MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021050	TCTT	2	8	110	117	0 %	75 %	0 %	25 %	482545087
2	NC_021050	GAA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
3	NC_021050	AG	3	6	147	152	50 %	0 %	50 %	0 %	482545087
4	NC_021050	AG	3	6	201	206	50 %	0 %	50 %	0 %	482545087
5	NC_021050	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
6	NC_021050	A	6	6	262	267	100 %	0 %	0 %	0 %	482545087
7	NC_021050	ACA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545087
8	NC_021050	TTGT	2	8	305	312	0 %	75 %	25 %	0 %	482545087
9	NC_021050	A	7	7	330	336	100 %	0 %	0 %	0 %	482545087
10	NC_021050	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545087
11	NC_021050	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
12	NC_021050	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
13	NC_021050	CATG	2	8	468	475	25 %	25 %	25 %	25 %	482545087
14	NC_021050	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545087
15	NC_021050	ATG	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
16	NC_021050	TC	3	6	579	584	0 %	50 %	0 %	50 %	482545087
17	NC_021050	TTC	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545087
18	NC_021050	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
19	NC_021050	GAA	3	9	724	732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
20	NC_021050	TGA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
21	NC_021050	GA	3	6	792	797	50 %	0 %	50 %	0 %	482545087
22	NC_021050	GGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545087
23	NC_021050	GCT	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545087
24	NC_021050	GGT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545087
25	NC_021050	AAAG	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	482545087
26	NC_021050	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
27	NC_021050	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545087
28	NC_021050	AG	3	6	920	925	50 %	0 %	50 %	0 %	482545087
29	NC_021050	GCTA	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	482545087
30	NC_021050	GA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	50 %	0 %	482545087
31	NC_021050	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
32	NC_021050	GAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
33	NC_021050	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	482545088
34	NC_021050	TCT	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
35	NC_021050	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
36	NC_021050	TAA	3	9	1216	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
37	NC_021050	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
38	NC_021050	CATG	2	8	1294	1301	25 %	25 %	25 %	25 %	482545088
39	NC_021050	TATCCA	2	12	1306	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545088
40	NC_021050	A	6	6	1338	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	482545088
41	NC_021050	AGAT	2	8	1346	1353	50 %	25 %	25 %	0 %	482545088
42	NC_021050	AGGA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	50 %	0 %	482545088
43	NC_021050	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	482545088
44	NC_021050	TC	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	482545088
45	NC_021050	TCT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
46	NC_021050	T	6	6	1475	1480	0 %	100 %	0 %	0 %	482545088
47	NC_021050	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545088
48	NC_021050	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
49	NC_021050	TGT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545088
50	NC_021050	ACA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
51	NC_021050	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	482545088
52	NC_021050	TGA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545088
53	NC_021050	TG	3	6	1790	1795	0 %	50 %	50 %	0 %	482545088
54	NC_021050	GTCT	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	482545088
55	NC_021050	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
56	NC_021050	TAA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
57	NC_021050	TCT	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
58	NC_021050	GAA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545088
59	NC_021050	A	6	6	1933	1938	100 %	0 %	0 %	0 %	482545088
60	NC_021050	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
61	NC_021050	GAG	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
62	NC_021050	TTTG	2	8	2044	2051	0 %	75 %	25 %	0 %	482545088
63	NC_021050	CCTT	2	8	2067	2074	0 %	50 %	0 %	50 %	482545088
64	NC_021050	CTT	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
65	NC_021050	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
66	NC_021050	A	6	6	2245	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	482545088
67	NC_021050	CAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545088
68	NC_021050	AAGG	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	482545088
69	NC_021050	AAC	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
70	NC_021050	T	8	8	2478	2485	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
71	NC_021050	T	7	7	2491	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
72	NC_021050	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545089
73	NC_021050	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
74	NC_021050	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545089
75	NC_021050	T	6	6	2591	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
76	NC_021050	ATT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545089
77	NC_021050	T	6	6	2746	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
78	NC_021050	T	6	6	2758	2763	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
79	NC_021050	GTC	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545089
80	NC_021050	AGG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545089
81	NC_021050	AG	3	6	2843	2848	50 %	0 %	50 %	0 %	482545089
82	NC_021050	T	6	6	2872	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	482545089
83	NC_021050	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545089
84	NC_021050	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
85	NC_021050	T	7	7	3060	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	482545090
86	NC_021050	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545090
87	NC_021050	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	482545090
88	NC_021050	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
89	NC_021050	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	482545090
90	NC_021050	CT	4	8	3235	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	482545090
91	NC_021050	ACA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
92	NC_021050	A	7	7	3303	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	482545090
93	NC_021050	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	482545090
94	NC_021050	TCA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
95	NC_021050	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
96	NC_021050	TTG	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
97	NC_021050	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
98	NC_021050	AGC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545090
99	NC_021050	TGG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
100	NC_021050	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
101	NC_021050	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
102	NC_021050	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	482545090
103	NC_021050	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
104	NC_021050	ATG	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545090
105	NC_021050	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
106	NC_021050	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
107	NC_021050	TCA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
108	NC_021050	TTG	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
109	NC_021050	TGT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
110	NC_021050	CT	3	6	4096	4101	0 %	50 %	0 %	50 %	482545090
111	NC_021050	TC	3	6	4140	4145	0 %	50 %	0 %	50 %	482545090
112	NC_021050	AGA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
113	NC_021050	CAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
114	NC_021050	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
115	NC_021050	A	7	7	4299	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	482545090
116	NC_021050	AGC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545090
117	NC_021050	TTTG	2	8	4348	4355	0 %	75 %	25 %	0 %	482545090
118	NC_021050	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
119	NC_021050	TGCT	2	8	4430	4437	0 %	50 %	25 %	25 %	482545090
120	NC_021050	A	6	6	4492	4497	100 %	0 %	0 %	0 %	482545090
121	NC_021050	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	482545090
122	NC_021050	TAT	2	6	4586	4591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545090
123	NC_021050	AAG	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
124	NC_021050	CAGC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	25 %	50 %	482545090
125	NC_021050	AG	3	6	4670	4675	50 %	0 %	50 %	0 %	482545090
126	NC_021050	AGA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
127	NC_021050	GAA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
128	NC_021050	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
129	NC_021050	AAAC	2	8	4737	4744	75 %	0 %	0 %	25 %	482545090
130	NC_021050	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
131	NC_021050	AG	3	6	4848	4853	50 %	0 %	50 %	0 %	482545090
132	NC_021050	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
133	NC_021050	AATC	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	482545090
134	NC_021050	GTT	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
135	NC_021050	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	482545090
136	NC_021050	AAG	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
137	NC_021050	TCT	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
138	NC_021050	CCTT	2	8	5366	5373	0 %	50 %	0 %	50 %	482545091
139	NC_021050	ATTCT	2	10	5382	5391	20 %	60 %	0 %	20 %	482545091
140	NC_021050	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
141	NC_021050	T	8	8	5514	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	482545091
142	NC_021050	AGA	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
143	NC_021050	T	6	6	5745	5750	0 %	100 %	0 %	0 %	482545091
144	NC_021050	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545091
145	NC_021050	TAT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
146	NC_021050	TTG	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545091
147	NC_021050	ATT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
148	NC_021050	CTTT	2	8	5961	5968	0 %	75 %	0 %	25 %	482545091
149	NC_021050	AGA	3	9	6001	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
150	NC_021050	TCG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545091
151	NC_021050	TAC	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545091
152	NC_021050	T	6	6	6107	6112	0 %	100 %	0 %	0 %	482545091
153	NC_021050	AGA	2	6	6163	6168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
154	NC_021050	CTTA	2	8	6240	6247	25 %	50 %	0 %	25 %	482545091
155	NC_021050	TTGAA	2	10	6264	6273	40 %	40 %	20 %	0 %	482545091
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157	NC_021050	T	6	6	6374	6379	0 %	100 %	0 %	0 %	482545091
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160	NC_021050	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545092
161	NC_021050	TTCG	2	8	6642	6649	0 %	50 %	25 %	25 %	482545092
162	NC_021050	GT	3	6	6651	6656	0 %	50 %	50 %	0 %	482545092
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164	NC_021050	TTG	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
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167	NC_021050	TTCT	2	8	6760	6767	0 %	75 %	0 %	25 %	482545092
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171	NC_021050	TGG	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545092
172	NC_021050	TTG	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
173	NC_021050	TCA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545092
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175	NC_021050	TTGT	2	8	7216	7223	0 %	75 %	25 %	0 %	482545092
176	NC_021050	TTC	2	6	7384	7389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545092
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183	NC_021050	TCTA	2	8	7683	7690	25 %	50 %	0 %	25 %	482545093
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199	NC_021050	TGTT	2	8	8211	8218	0 %	75 %	25 %	0 %	482545093
200	NC_021050	AG	3	6	8245	8250	50 %	0 %	50 %	0 %	482545093
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252	NC_021050	A	6	6	10607	10612	100 %	0 %	0 %	0 %	482545093
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256	NC_021050	AG	3	6	10690	10695	50 %	0 %	50 %	0 %	482545094
257	NC_021050	TCT	2	6	10709	10714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545094
258	NC_021050	ACC	2	6	10731	10736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545094
259	NC_021050	ACT	2	6	10741	10746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545094
260	NC_021050	TCT	2	6	10757	10762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545094
261	NC_021050	T	7	7	10777	10783	0 %	100 %	0 %	0 %	482545094
262	NC_021050	T	7	7	10806	10812	0 %	100 %	0 %	0 %	482545094
263	NC_021050	GAAG	2	8	10835	10842	50 %	0 %	50 %	0 %	482545094
264	NC_021050	CG	3	6	10882	10887	0 %	0 %	50 %	50 %	482545094
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267	NC_021050	CTT	2	6	10965	10970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545094
268	NC_021050	GTA	2	6	10992	10997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545094
269	NC_021050	TAGG	2	8	11008	11015	25 %	25 %	50 %	0 %	482545094
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271	NC_021050	GA	3	6	11170	11175	50 %	0 %	50 %	0 %	482545094
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