MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021050	TAA	2	6	212431	212436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545262
4002	NC_021050	CAA	2	6	212470	212475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545262
4003	NC_021050	ACAT	2	8	212592	212599	50 %	25 %	0 %	25 %	482545262
4004	NC_021050	AAG	2	6	212650	212655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545262
4005	NC_021050	TGA	2	6	212663	212668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545262
4006	NC_021050	CAAC	2	8	212713	212720	50 %	0 %	0 %	50 %	482545262
4007	NC_021050	CCA	2	6	212748	212753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545262
4008	NC_021050	T	6	6	212767	212772	0 %	100 %	0 %	0 %	482545262
4009	NC_021050	GGAT	2	8	212782	212789	25 %	25 %	50 %	0 %	482545262
4010	NC_021050	TTC	2	6	212840	212845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545262
4011	NC_021050	GAAC	2	8	212883	212890	50 %	0 %	25 %	25 %	482545262
4012	NC_021050	GA	3	6	212929	212934	50 %	0 %	50 %	0 %	482545262
4013	NC_021050	GAA	2	6	212954	212959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545262
4014	NC_021050	GAG	2	6	212971	212976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545262
4015	NC_021050	ATAA	2	8	212994	213001	75 %	25 %	0 %	0 %	482545262
4016	NC_021050	G	6	6	213012	213017	0 %	0 %	100 %	0 %	482545262
4017	NC_021050	T	6	6	213020	213025	0 %	100 %	0 %	0 %	482545262
4018	NC_021050	TCG	2	6	213080	213085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545262
4019	NC_021050	GCGA	2	8	213147	213154	25 %	0 %	50 %	25 %	482545262
4020	NC_021050	GTT	2	6	213160	213165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545262
4021	NC_021050	CTC	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545262
4022	NC_021050	TCT	2	6	213225	213230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545262
4023	NC_021050	TTG	2	6	213241	213246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545262
4024	NC_021050	AGG	2	6	213278	213283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545262
4025	NC_021050	GCA	2	6	213336	213341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545262
4026	NC_021050	TGA	2	6	213439	213444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545262
4027	NC_021050	GAGG	2	8	213463	213470	25 %	0 %	75 %	0 %	482545262
4028	NC_021050	TCA	2	6	213507	213512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545262
4029	NC_021050	TG	3	6	213582	213587	0 %	50 %	50 %	0 %	482545262
4030	NC_021050	TAAG	2	8	213597	213604	50 %	25 %	25 %	0 %	482545262
4031	NC_021050	CACAT	2	10	213615	213624	40 %	20 %	0 %	40 %	482545262
4032	NC_021050	CGC	2	6	213685	213690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545262
4033	NC_021050	TAG	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545262
4034	NC_021050	CTA	2	6	213838	213843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545262
4035	NC_021050	GA	3	6	213863	213868	50 %	0 %	50 %	0 %	482545262
4036	NC_021050	GAAA	2	8	213882	213889	75 %	0 %	25 %	0 %	482545262
4037	NC_021050	TGG	2	6	213924	213929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545262
4038	NC_021050	TGA	2	6	214083	214088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545262
4039	NC_021050	ATG	2	6	214089	214094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545262
4040	NC_021050	CAT	2	6	214130	214135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545262
4041	NC_021050	GGT	2	6	214701	214706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545263
4042	NC_021050	AT	3	6	214786	214791	50 %	50 %	0 %	0 %	482545263
4043	NC_021050	CA	3	6	214882	214887	50 %	0 %	0 %	50 %	482545263
4044	NC_021050	C	6	6	214889	214894	0 %	0 %	0 %	100 %	482545263
4045	NC_021050	TTA	2	6	214944	214949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545263
4046	NC_021050	TAG	2	6	214972	214977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545263
4047	NC_021050	GCT	2	6	214991	214996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545263
4048	NC_021050	TTC	2	6	215022	215027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545263
4049	NC_021050	CTT	2	6	215038	215043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545263
4050	NC_021050	TCA	2	6	215046	215051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545263
4051	NC_021050	TAG	2	6	215130	215135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545263
4052	NC_021050	TTA	2	6	215189	215194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545263
4053	NC_021050	GGC	2	6	215264	215269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545264
4054	NC_021050	GAA	2	6	215283	215288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545264
4055	NC_021050	TGGT	2	8	215328	215335	0 %	50 %	50 %	0 %	482545264
4056	NC_021050	AAG	2	6	215397	215402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545264
4057	NC_021050	TCC	2	6	215441	215446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545264
4058	NC_021050	TG	3	6	215493	215498	0 %	50 %	50 %	0 %	482545264
4059	NC_021050	GCG	2	6	215544	215549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545264
4060	NC_021050	TTC	2	6	215636	215641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545264
4061	NC_021050	TAA	2	6	215671	215676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545264
4062	NC_021050	AAT	2	6	215756	215761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545264
4063	NC_021050	AG	3	6	215786	215791	50 %	0 %	50 %	0 %	482545264
4064	NC_021050	T	6	6	215813	215818	0 %	100 %	0 %	0 %	482545264
4065	NC_021050	A	8	8	215837	215844	100 %	0 %	0 %	0 %	482545264
4066	NC_021050	TGTCG	2	10	215915	215924	0 %	40 %	40 %	20 %	482545264
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4069	NC_021050	AC	3	6	216073	216078	50 %	0 %	0 %	50 %	482545264
4070	NC_021050	ATTC	2	8	216121	216128	25 %	50 %	0 %	25 %	482545264
4071	NC_021050	AGG	2	6	216133	216138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545264
4072	NC_021050	TGT	2	6	216222	216227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545264
4073	NC_021050	AGT	2	6	216231	216236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545264
4074	NC_021050	CTT	2	6	216286	216291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545264
4075	NC_021050	AGG	2	6	216301	216306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545264
4076	NC_021050	GCA	3	9	216309	216317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545264
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4079	NC_021050	CTT	2	6	216448	216453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545264
4080	NC_021050	A	7	7	216464	216470	100 %	0 %	0 %	0 %	482545264
4081	NC_021050	AAT	2	6	216519	216524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545264
4082	NC_021050	TG	3	6	216554	216559	0 %	50 %	50 %	0 %	482545264
4083	NC_021050	TG	3	6	216641	216646	0 %	50 %	50 %	0 %	482545264
4084	NC_021050	AAT	2	6	216647	216652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545264
4085	NC_021050	AAG	2	6	217268	217273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545265
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4089	NC_021050	ATG	2	6	217491	217496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545265
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4094	NC_021050	ACG	2	6	217783	217788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545265
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4102	NC_021050	TTG	2	6	218065	218070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545266
4103	NC_021050	GAC	2	6	218076	218081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545266
4104	NC_021050	TGG	2	6	218129	218134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545266
4105	NC_021050	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	482545266
4106	NC_021050	ATT	2	6	218179	218184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545266
4107	NC_021050	TAT	2	6	218248	218253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545266
4108	NC_021050	TGAA	2	8	218266	218273	50 %	25 %	25 %	0 %	482545266
4109	NC_021050	AGA	2	6	218309	218314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545266
4110	NC_021050	TCCT	2	8	218317	218324	0 %	50 %	0 %	50 %	482545266
4111	NC_021050	GTT	2	6	218332	218337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545266
4112	NC_021050	A	10	10	218480	218489	100 %	0 %	0 %	0 %	482545267
4113	NC_021050	TGG	2	6	218590	218595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545267
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4115	NC_021050	TAC	2	6	218669	218674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545267
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4117	NC_021050	GA	3	6	218719	218724	50 %	0 %	50 %	0 %	482545267
4118	NC_021050	TCT	2	6	218743	218748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545267
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4120	NC_021050	AAG	2	6	218781	218786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545267
4121	NC_021050	AAT	2	6	218811	218816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545267
4122	NC_021050	GAAG	2	8	218860	218867	50 %	0 %	50 %	0 %	482545268
4123	NC_021050	TTA	2	6	218947	218952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545268
4124	NC_021050	TTC	2	6	218968	218973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545268
4125	NC_021050	AAG	2	6	218975	218980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545268
4126	NC_021050	TCT	2	6	218994	218999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545268
4127	NC_021050	GCT	2	6	219011	219016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545268
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4129	NC_021050	TTA	2	6	219116	219121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545269
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4240	NC_021050	GTT	2	6	223636	223641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545273
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4244	NC_021050	GGTAG	2	10	223809	223818	20 %	20 %	60 %	0 %	482545273
4245	NC_021050	AGATA	2	10	223820	223829	60 %	20 %	20 %	0 %	482545273
4246	NC_021050	TCT	2	6	223878	223883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545273
4247	NC_021050	AG	3	6	223905	223910	50 %	0 %	50 %	0 %	482545273
4248	NC_021050	TAT	2	6	224158	224163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545273
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4251	NC_021050	CAT	2	6	224299	224304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545273
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4254	NC_021050	AGT	2	6	224375	224380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545273
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4344	NC_021050	A	7	7	228697	228703	100 %	0 %	0 %	0 %	482545277
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4356	NC_021050	CGTTC	2	10	229342	229351	0 %	40 %	20 %	40 %	482545279
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4493	NC_021050	GAA	2	6	235839	235844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545283
4494	NC_021050	TGA	2	6	235868	235873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545283
4495	NC_021050	GAAAAA	2	12	235899	235910	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	482545283
4496	NC_021050	AGA	3	9	235945	235953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545283
4497	NC_021050	CGA	2	6	236037	236042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545284
4498	NC_021050	TCA	2	6	236046	236051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545284
4499	NC_021050	CAG	2	6	236099	236104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545284
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