MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_021050	AAT	2	6	1015650	1015655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546001
20004	NC_021050	T	6	6	1015659	1015664	0 %	100 %	0 %	0 %	482546001
20005	NC_021050	A	6	6	1015706	1015711	100 %	0 %	0 %	0 %	482546001
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20008	NC_021050	A	6	6	1016330	1016335	100 %	0 %	0 %	0 %	482546002
20009	NC_021050	GCA	2	6	1016733	1016738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546003
20010	NC_021050	ACT	2	6	1016768	1016773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546003
20011	NC_021050	CCGCAA	2	12	1016779	1016790	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482546003
20012	NC_021050	GCAAC	2	10	1016803	1016812	40 %	0 %	20 %	40 %	482546003
20013	NC_021050	AGCTC	2	10	1016827	1016836	20 %	20 %	20 %	40 %	482546003
20014	NC_021050	TTTG	2	8	1016846	1016853	0 %	75 %	25 %	0 %	482546003
20015	NC_021050	CAA	2	6	1016916	1016921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546003
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20020	NC_021050	GCA	2	6	1017382	1017387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546003
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20118	NC_021050	AG	3	6	1021726	1021731	50 %	0 %	50 %	0 %	482546005
20119	NC_021050	CTT	2	6	1021799	1021804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546005
20120	NC_021050	GCA	2	6	1021844	1021849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546005
20121	NC_021050	T	6	6	1021880	1021885	0 %	100 %	0 %	0 %	482546005
20122	NC_021050	CTT	2	6	1021951	1021956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546005
20123	NC_021050	AAAT	2	8	1021962	1021969	75 %	25 %	0 %	0 %	482546005
20124	NC_021050	CT	3	6	1022026	1022031	0 %	50 %	0 %	50 %	482546005
20125	NC_021050	CTTC	2	8	1022036	1022043	0 %	50 %	0 %	50 %	482546005
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20127	NC_021050	CTAC	2	8	1022190	1022197	25 %	25 %	0 %	50 %	482546005
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20132	NC_021050	CTTC	2	8	1022636	1022643	0 %	50 %	0 %	50 %	482546005
20133	NC_021050	ATC	2	6	1022648	1022653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546005
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20139	NC_021050	GTA	2	6	1022777	1022782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546005
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20227	NC_021050	GCT	2	6	1027447	1027452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546007
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20233	NC_021050	GAAA	2	8	1027794	1027801	75 %	0 %	25 %	0 %	482546008
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20353	NC_021050	ATC	2	6	1034234	1034239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546014
20354	NC_021050	ATC	2	6	1034258	1034263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546014
20355	NC_021050	CTA	2	6	1034305	1034310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546014
20356	NC_021050	TCC	3	9	1034330	1034338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546014
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20358	NC_021050	GCAA	2	8	1034357	1034364	50 %	0 %	25 %	25 %	482546014
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20365	NC_021050	ATC	3	9	1034666	1034674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546014
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20374	NC_021050	GAA	2	6	1035138	1035143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546015
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20382	NC_021050	CTT	2	6	1035455	1035460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546015
20383	NC_021050	TCT	2	6	1035505	1035510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546015
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.