MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

< Previous12...29303132333435363738394041Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021050	TTA	2	6	768231	768236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545759
15003	NC_021050	AATGT	2	10	768262	768271	40 %	40 %	20 %	0 %	482545759
15004	NC_021050	ATTGG	2	10	768287	768296	20 %	40 %	40 %	0 %	482545759
15005	NC_021050	AAGA	2	8	768323	768330	75 %	0 %	25 %	0 %	482545759
15006	NC_021050	ATAGA	2	10	768432	768441	60 %	20 %	20 %	0 %	482545760
15007	NC_021050	A	6	6	768464	768469	100 %	0 %	0 %	0 %	482545760
15008	NC_021050	AG	3	6	768517	768522	50 %	0 %	50 %	0 %	482545760
15009	NC_021050	CTT	2	6	768545	768550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545760
15010	NC_021050	A	6	6	768631	768636	100 %	0 %	0 %	0 %	482545760
15011	NC_021050	GGAG	2	8	768647	768654	25 %	0 %	75 %	0 %	482545760
15012	NC_021050	TTA	2	6	768679	768684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545760
15013	NC_021050	AAG	2	6	768714	768719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545760
15014	NC_021050	CAA	2	6	768734	768739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545760
15015	NC_021050	TTA	2	6	768867	768872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545760
15016	NC_021050	GAT	2	6	768893	768898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545760
15017	NC_021050	AAC	2	6	768966	768971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545760
15018	NC_021050	TTAC	2	8	769015	769022	25 %	50 %	0 %	25 %	482545760
15019	NC_021050	AAC	2	6	769026	769031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545760
15020	NC_021050	AGA	3	9	769057	769065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545760
15021	NC_021050	CGCT	2	8	769197	769204	0 %	25 %	25 %	50 %	482545760
15022	NC_021050	CTTT	2	8	769215	769222	0 %	75 %	0 %	25 %	482545760
15023	NC_021050	TTA	2	6	769354	769359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545760
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15025	NC_021050	CGAC	2	8	769518	769525	25 %	0 %	25 %	50 %	482545760
15026	NC_021050	CAG	2	6	769545	769550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545760
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15028	NC_021050	TCG	2	6	769621	769626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545761
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15030	NC_021050	AGAA	2	8	769775	769782	75 %	0 %	25 %	0 %	482545761
15031	NC_021050	ATG	2	6	769792	769797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545761
15032	NC_021050	TCCT	2	8	769829	769836	0 %	50 %	0 %	50 %	482545761
15033	NC_021050	GAA	2	6	769885	769890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545761
15034	NC_021050	A	6	6	769893	769898	100 %	0 %	0 %	0 %	482545761
15035	NC_021050	CAA	2	6	769927	769932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545761
15036	NC_021050	GAA	2	6	770023	770028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545761
15037	NC_021050	CAA	2	6	770033	770038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545761
15038	NC_021050	GGA	2	6	770058	770063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545761
15039	NC_021050	GAA	2	6	770158	770163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545761
15040	NC_021050	AAT	2	6	770168	770173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545761
15041	NC_021050	A	6	6	770205	770210	100 %	0 %	0 %	0 %	482545762
15042	NC_021050	ATT	2	6	770225	770230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545762
15043	NC_021050	GAC	2	6	770245	770250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545762
15044	NC_021050	TAC	2	6	770317	770322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545762
15045	NC_021050	TTG	2	6	770358	770363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545762
15046	NC_021050	A	6	6	770400	770405	100 %	0 %	0 %	0 %	482545762
15047	NC_021050	CTA	2	6	770415	770420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545762
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15049	NC_021050	ATGAAG	2	12	770567	770578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482545762
15050	NC_021050	CTG	2	6	770583	770588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545762
15051	NC_021050	ATT	2	6	770708	770713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545762
15052	NC_021050	AAGG	2	8	770753	770760	50 %	0 %	50 %	0 %	482545762
15053	NC_021050	A	7	7	770765	770771	100 %	0 %	0 %	0 %	482545762
15054	NC_021050	AGG	3	9	770788	770796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545762
15055	NC_021050	TC	3	6	770845	770850	0 %	50 %	0 %	50 %	482545762
15056	NC_021050	GAG	2	6	770874	770879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545762
15057	NC_021050	TCA	3	9	770895	770903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545762
15058	NC_021050	TGA	2	6	770914	770919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545762
15059	NC_021050	A	6	6	770924	770929	100 %	0 %	0 %	0 %	482545762
15060	NC_021050	AAG	2	6	770931	770936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545762
15061	NC_021050	TGC	2	6	770983	770988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545762
15062	NC_021050	ATCA	2	8	771032	771039	50 %	25 %	0 %	25 %	482545762
15063	NC_021050	TCA	2	6	771045	771050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545762
15064	NC_021050	TAACTC	2	12	771084	771095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545762
15065	NC_021050	CT	3	6	771121	771126	0 %	50 %	0 %	50 %	482545762
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15070	NC_021050	GCT	2	6	771314	771319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545762
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15079	NC_021050	TCG	2	6	771504	771509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545762
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15085	NC_021050	AAGC	2	8	771696	771703	50 %	0 %	25 %	25 %	482545762
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15089	NC_021050	AAG	2	6	771780	771785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545762
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15091	NC_021050	AGC	2	6	771949	771954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545762
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15093	NC_021050	A	6	6	771981	771986	100 %	0 %	0 %	0 %	482545762
15094	NC_021050	ATCCGC	2	12	772009	772020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482545762
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15102	NC_021050	A	6	6	772505	772510	100 %	0 %	0 %	0 %	482545763
15103	NC_021050	TGGA	2	8	772642	772649	25 %	25 %	50 %	0 %	482545763
15104	NC_021050	GGA	2	6	772686	772691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545763
15105	NC_021050	A	6	6	772693	772698	100 %	0 %	0 %	0 %	482545763
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15107	NC_021050	TTCT	2	8	772720	772727	0 %	75 %	0 %	25 %	482545763
15108	NC_021050	TAG	2	6	772744	772749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545763
15109	NC_021050	TC	3	6	772759	772764	0 %	50 %	0 %	50 %	482545763
15110	NC_021050	TG	3	6	772791	772796	0 %	50 %	50 %	0 %	482545763
15111	NC_021050	GTT	2	6	772868	772873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545763
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15113	NC_021050	ACC	2	6	772916	772921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545763
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15488	NC_021050	A	6	6	791806	791811	100 %	0 %	0 %	0 %	482545779
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15491	NC_021050	ATC	2	6	791938	791943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545779
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