MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021050	ATTCAA	2	12	667520	667531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482545671
13003	NC_021050	A	7	7	667530	667536	100 %	0 %	0 %	0 %	482545671
13004	NC_021050	AGC	2	6	667554	667559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545671
13005	NC_021050	AGACCG	2	12	667594	667605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545671
13006	NC_021050	GAG	2	6	667616	667621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545671
13007	NC_021050	CAAA	2	8	667643	667650	75 %	0 %	0 %	25 %	482545671
13008	NC_021050	CA	3	6	667675	667680	50 %	0 %	0 %	50 %	482545671
13009	NC_021050	GCA	2	6	667709	667714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545671
13010	NC_021050	CA	4	8	667717	667724	50 %	0 %	0 %	50 %	482545671
13011	NC_021050	CAA	2	6	667770	667775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545671
13012	NC_021050	T	7	7	667806	667812	0 %	100 %	0 %	0 %	482545671
13013	NC_021050	TAA	2	6	667887	667892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545672
13014	NC_021050	AGCT	2	8	667951	667958	25 %	25 %	25 %	25 %	482545672
13015	NC_021050	TTCA	2	8	667978	667985	25 %	50 %	0 %	25 %	482545672
13016	NC_021050	CT	3	6	668003	668008	0 %	50 %	0 %	50 %	482545672
13017	NC_021050	T	6	6	668035	668040	0 %	100 %	0 %	0 %	482545672
13018	NC_021050	CTT	2	6	668043	668048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545672
13019	NC_021050	CTTT	2	8	668059	668066	0 %	75 %	0 %	25 %	482545672
13020	NC_021050	GCT	2	6	668073	668078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545672
13021	NC_021050	TCTT	2	8	668081	668088	0 %	75 %	0 %	25 %	482545672
13022	NC_021050	TTC	2	6	668092	668097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545672
13023	NC_021050	TAA	2	6	668098	668103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545672
13024	NC_021050	A	6	6	668120	668125	100 %	0 %	0 %	0 %	482545672
13025	NC_021050	AGCA	2	8	668140	668147	50 %	0 %	25 %	25 %	482545672
13026	NC_021050	GCC	2	6	668171	668176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545672
13027	NC_021050	AGC	2	6	668278	668283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545672
13028	NC_021050	CCA	2	6	668287	668292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545672
13029	NC_021050	CAA	2	6	668307	668312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545672
13030	NC_021050	TGC	3	9	668341	668349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545672
13031	NC_021050	GCA	2	6	668417	668422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545672
13032	NC_021050	TAAC	2	8	668451	668458	50 %	25 %	0 %	25 %	482545672
13033	NC_021050	TCC	2	6	668473	668478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545672
13034	NC_021050	A	7	7	668501	668507	100 %	0 %	0 %	0 %	482545672
13035	NC_021050	TCGC	2	8	668508	668515	0 %	25 %	25 %	50 %	482545672
13036	NC_021050	AAAG	2	8	668537	668544	75 %	0 %	25 %	0 %	482545672
13037	NC_021050	CAT	2	6	668646	668651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545672
13038	NC_021050	AAG	2	6	668733	668738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545672
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13040	NC_021050	TCT	2	6	669002	669007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545673
13041	NC_021050	GTCT	2	8	669112	669119	0 %	50 %	25 %	25 %	482545673
13042	NC_021050	CTG	2	6	669122	669127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545673
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13045	NC_021050	AAG	2	6	669198	669203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545673
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13051	NC_021050	CT	3	6	669454	669459	0 %	50 %	0 %	50 %	482545673
13052	NC_021050	AAC	2	6	669490	669495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545673
13053	NC_021050	CTG	2	6	669511	669516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545673
13054	NC_021050	ATCTC	2	10	669596	669605	20 %	40 %	0 %	40 %	482545673
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13056	NC_021050	TTC	2	6	669626	669631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545673
13057	NC_021050	CAA	2	6	669648	669653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545673
13058	NC_021050	CAG	2	6	669675	669680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545673
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13060	NC_021050	CTT	2	6	669804	669809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545673
13061	NC_021050	AT	3	6	669877	669882	50 %	50 %	0 %	0 %	482545673
13062	NC_021050	CAA	2	6	669930	669935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545673
13063	NC_021050	CAG	2	6	670071	670076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545673
13064	NC_021050	CAT	2	6	670080	670085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545673
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13069	NC_021050	ATA	2	6	670391	670396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545673
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13093	NC_021050	TGC	2	6	671770	671775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545673
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13105	NC_021050	CCAT	2	8	672426	672433	25 %	25 %	0 %	50 %	482545673
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13241	NC_021050	ACA	2	6	679228	679233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545678
13242	NC_021050	GCA	2	6	679306	679311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545678
13243	NC_021050	TGG	2	6	679329	679334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545678
13244	NC_021050	T	7	7	679385	679391	0 %	100 %	0 %	0 %	482545678
13245	NC_021050	TTCTTA	2	12	679497	679508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482545679
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13253	NC_021050	T	6	6	679747	679752	0 %	100 %	0 %	0 %	482545679
13254	NC_021050	TCT	2	6	679756	679761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545679
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13334	NC_021050	GCT	2	6	684971	684976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545685
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13341	NC_021050	AC	3	6	685229	685234	50 %	0 %	0 %	50 %	482545685
13342	NC_021050	A	6	6	685330	685335	100 %	0 %	0 %	0 %	482545685
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13348	NC_021050	TGA	2	6	685607	685612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545685
13349	NC_021050	CT	3	6	685634	685639	0 %	50 %	0 %	50 %	482545685
13350	NC_021050	CA	3	6	685643	685648	50 %	0 %	0 %	50 %	482545685
13351	NC_021050	CAA	2	6	685689	685694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545685
13352	NC_021050	GTC	3	9	685708	685716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545685
13353	NC_021050	ATC	3	9	685717	685725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545685
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13355	NC_021050	C	9	9	685812	685820	0 %	0 %	0 %	100 %	482545686
13356	NC_021050	TCT	2	6	685885	685890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545686
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13359	NC_021050	TATG	2	8	685937	685944	25 %	50 %	25 %	0 %	482545686
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13361	NC_021050	TAT	2	6	685967	685972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545686
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13484	NC_021050	AGA	2	6	692462	692467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545693
13485	NC_021050	GGC	2	6	692481	692486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545693
13486	NC_021050	ATA	2	6	692521	692526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545693
13487	NC_021050	TC	3	6	692540	692545	0 %	50 %	0 %	50 %	482545693
13488	NC_021050	ATCAC	2	10	692620	692629	40 %	20 %	0 %	40 %	482545693
13489	NC_021050	T	6	6	692682	692687	0 %	100 %	0 %	0 %	482545693
13490	NC_021050	ATT	2	6	692811	692816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545694
13491	NC_021050	GA	3	6	692956	692961	50 %	0 %	50 %	0 %	482545694
13492	NC_021050	TAT	2	6	692981	692986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545694
13493	NC_021050	AAAG	2	8	693093	693100	75 %	0 %	25 %	0 %	482545694
13494	NC_021050	TGA	2	6	693164	693169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545694
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13497	NC_021050	CAA	2	6	693251	693256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545694
13498	NC_021050	GCT	2	6	693357	693362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545694
13499	NC_021050	TCGT	2	8	693363	693370	0 %	50 %	25 %	25 %	482545694
13500	NC_021050	GTC	2	6	693421	693426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545694

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