MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021050	CCT	2	6	541804	541809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545556
10503	NC_021050	TCCT	2	8	541837	541844	0 %	50 %	0 %	50 %	482545556
10504	NC_021050	AGC	2	6	541867	541872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545556
10505	NC_021050	CTT	2	6	541873	541878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545556
10506	NC_021050	CAA	2	6	541884	541889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545556
10507	NC_021050	AGA	2	6	541919	541924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545556
10508	NC_021050	CTGA	2	8	541929	541936	25 %	25 %	25 %	25 %	482545556
10509	NC_021050	GAA	2	6	542038	542043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545556
10510	NC_021050	TTG	2	6	542085	542090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545556
10511	NC_021050	CTTT	2	8	542113	542120	0 %	75 %	0 %	25 %	482545556
10512	NC_021050	TTTC	2	8	542166	542173	0 %	75 %	0 %	25 %	482545556
10513	NC_021050	TC	3	6	542237	542242	0 %	50 %	0 %	50 %	482545556
10514	NC_021050	A	7	7	542254	542260	100 %	0 %	0 %	0 %	482545556
10515	NC_021050	ACG	2	6	542338	542343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545556
10516	NC_021050	ACA	2	6	542355	542360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545556
10517	NC_021050	AAT	2	6	542361	542366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545556
10518	NC_021050	CTTT	2	8	542370	542377	0 %	75 %	0 %	25 %	482545556
10519	NC_021050	CTA	2	6	542586	542591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545557
10520	NC_021050	GGC	2	6	542610	542615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545557
10521	NC_021050	TGT	2	6	542616	542621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545557
10522	NC_021050	CTTT	2	8	542630	542637	0 %	75 %	0 %	25 %	482545557
10523	NC_021050	GTA	2	6	542642	542647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545557
10524	NC_021050	T	6	6	542660	542665	0 %	100 %	0 %	0 %	482545557
10525	NC_021050	ATT	2	6	542666	542671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545557
10526	NC_021050	ATG	2	6	542697	542702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545557
10527	NC_021050	TATCT	2	10	542783	542792	20 %	60 %	0 %	20 %	482545557
10528	NC_021050	TAT	2	6	542860	542865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545557
10529	NC_021050	TGC	2	6	542866	542871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545557
10530	NC_021050	A	7	7	542963	542969	100 %	0 %	0 %	0 %	482545557
10531	NC_021050	TTTTC	2	10	542985	542994	0 %	80 %	0 %	20 %	482545557
10532	NC_021050	TC	3	6	543099	543104	0 %	50 %	0 %	50 %	482545557
10533	NC_021050	CATT	2	8	543147	543154	25 %	50 %	0 %	25 %	482545557
10534	NC_021050	A	7	7	543190	543196	100 %	0 %	0 %	0 %	482545557
10535	NC_021050	TTA	2	6	543206	543211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545557
10536	NC_021050	TAA	2	6	543246	543251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545557
10537	NC_021050	AAC	2	6	543307	543312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545557
10538	NC_021050	TTG	2	6	543460	543465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545557
10539	NC_021050	ATA	2	6	543529	543534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545557
10540	NC_021050	ACAA	2	8	543606	543613	75 %	0 %	0 %	25 %	482545558
10541	NC_021050	TTC	2	6	543667	543672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545558
10542	NC_021050	CT	3	6	543801	543806	0 %	50 %	0 %	50 %	482545558
10543	NC_021050	ATT	2	6	543831	543836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545558
10544	NC_021050	ACT	2	6	543851	543856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545558
10545	NC_021050	A	7	7	543884	543890	100 %	0 %	0 %	0 %	482545558
10546	NC_021050	ATT	2	6	543951	543956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545558
10547	NC_021050	TTA	2	6	543960	543965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545558
10548	NC_021050	CTGG	2	8	544015	544022	0 %	25 %	50 %	25 %	482545558
10549	NC_021050	TAT	2	6	544037	544042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545558
10550	NC_021050	TGT	2	6	544081	544086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545558
10551	NC_021050	ATT	2	6	544158	544163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545558
10552	NC_021050	TCA	2	6	544210	544215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545558
10553	NC_021050	CCT	2	6	544239	544244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545558
10554	NC_021050	CATT	2	8	544277	544284	25 %	50 %	0 %	25 %	482545558
10555	NC_021050	CTT	2	6	544307	544312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545558
10556	NC_021050	T	6	6	544323	544328	0 %	100 %	0 %	0 %	482545558
10557	NC_021050	TTA	2	6	544414	544419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545559
10558	NC_021050	GTC	2	6	544435	544440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545559
10559	NC_021050	A	6	6	544446	544451	100 %	0 %	0 %	0 %	482545559
10560	NC_021050	AAC	2	6	544539	544544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545559
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10562	NC_021050	GAA	2	6	544665	544670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545559
10563	NC_021050	CAT	2	6	544753	544758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545559
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10565	NC_021050	ATTGCT	2	12	544891	544902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482545559
10566	NC_021050	ATT	2	6	544924	544929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545559
10567	NC_021050	CTA	2	6	545020	545025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545559
10568	NC_021050	TCA	2	6	545027	545032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545559
10569	NC_021050	TG	3	6	545060	545065	0 %	50 %	50 %	0 %	482545559
10570	NC_021050	TCCTAG	2	12	545181	545192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482545559
10571	NC_021050	CAA	2	6	545219	545224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545559
10572	NC_021050	AAC	2	6	545296	545301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545560
10573	NC_021050	GAG	2	6	545335	545340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545560
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10575	NC_021050	TCGA	2	8	545430	545437	25 %	25 %	25 %	25 %	482545560
10576	NC_021050	TCC	2	6	545447	545452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545560
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10579	NC_021050	CAT	2	6	545555	545560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545560
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10581	NC_021050	AAG	2	6	545587	545592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545560
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10583	NC_021050	GCAACG	2	12	545669	545680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545560
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10585	NC_021050	AATT	2	8	545716	545723	50 %	50 %	0 %	0 %	482545560
10586	NC_021050	ATTT	2	8	545779	545786	25 %	75 %	0 %	0 %	482545560
10587	NC_021050	T	6	6	545816	545821	0 %	100 %	0 %	0 %	482545560
10588	NC_021050	TCA	2	6	545824	545829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545560
10589	NC_021050	CTG	2	6	545842	545847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545560
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10591	NC_021050	CTT	2	6	545955	545960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545560
10592	NC_021050	TTC	2	6	546351	546356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545561
10593	NC_021050	GAA	2	6	546425	546430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545561
10594	NC_021050	TGA	2	6	546457	546462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545561
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10598	NC_021050	TGA	2	6	546631	546636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545561
10599	NC_021050	TCG	2	6	546720	546725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545561
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10601	NC_021050	CCTT	2	8	546800	546807	0 %	50 %	0 %	50 %	482545561
10602	NC_021050	TTG	2	6	546822	546827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545561
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10604	NC_021050	GATA	2	8	546895	546902	50 %	25 %	25 %	0 %	482545561
10605	NC_021050	ATT	2	6	546935	546940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545561
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10609	NC_021050	CTT	2	6	547101	547106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545562
10610	NC_021050	TAC	2	6	547203	547208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545562
10611	NC_021050	TAT	2	6	547212	547217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545562
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10613	NC_021050	GCTTG	2	10	547336	547345	0 %	40 %	40 %	20 %	482545562
10614	NC_021050	TTTC	2	8	547348	547355	0 %	75 %	0 %	25 %	482545562
10615	NC_021050	CTT	2	6	547410	547415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545562
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10618	NC_021050	TAT	2	6	547677	547682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545562
10619	NC_021050	ATT	2	6	547756	547761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545562
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