MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021050	TAT	2	6	516907	516912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545534
10002	NC_021050	TGA	2	6	516983	516988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545534
10003	NC_021050	CAA	2	6	517094	517099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545534
10004	NC_021050	TA	3	6	517115	517120	50 %	50 %	0 %	0 %	482545534
10005	NC_021050	AGA	2	6	517204	517209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545534
10006	NC_021050	TAA	2	6	517237	517242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545534
10007	NC_021050	CAAG	2	8	517276	517283	50 %	0 %	25 %	25 %	482545534
10008	NC_021050	CT	3	6	517363	517368	0 %	50 %	0 %	50 %	482545535
10009	NC_021050	TCA	2	6	517374	517379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545535
10010	NC_021050	CCCA	2	8	517436	517443	25 %	0 %	0 %	75 %	482545535
10011	NC_021050	GCT	2	6	517477	517482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545535
10012	NC_021050	T	7	7	517609	517615	0 %	100 %	0 %	0 %	482545535
10013	NC_021050	AT	3	6	517644	517649	50 %	50 %	0 %	0 %	482545535
10014	NC_021050	TCTGGA	2	12	517653	517664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482545535
10015	NC_021050	GCA	2	6	517704	517709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545535
10016	NC_021050	CAA	2	6	517768	517773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545535
10017	NC_021050	T	6	6	517778	517783	0 %	100 %	0 %	0 %	482545535
10018	NC_021050	GAA	2	6	517803	517808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545535
10019	NC_021050	TTC	2	6	517835	517840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545535
10020	NC_021050	TGG	2	6	517919	517924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545535
10021	NC_021050	GT	3	6	517941	517946	0 %	50 %	50 %	0 %	482545535
10022	NC_021050	AC	3	6	517959	517964	50 %	0 %	0 %	50 %	482545535
10023	NC_021050	ATA	2	6	517989	517994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545535
10024	NC_021050	TCT	2	6	517999	518004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545535
10025	NC_021050	ATCC	2	8	518024	518031	25 %	25 %	0 %	50 %	482545535
10026	NC_021050	T	6	6	518186	518191	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10027	NC_021050	T	7	7	518222	518228	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10028	NC_021050	T	6	6	518268	518273	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10029	NC_021050	TTC	2	6	518300	518305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545536
10030	NC_021050	GCG	2	6	518329	518334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545536
10031	NC_021050	TAT	2	6	518347	518352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545536
10032	NC_021050	TTTC	2	8	518413	518420	0 %	75 %	0 %	25 %	482545536
10033	NC_021050	TTC	2	6	518429	518434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545536
10034	NC_021050	CTA	2	6	518469	518474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545536
10035	NC_021050	TAT	2	6	518492	518497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545536
10036	NC_021050	CTA	2	6	518539	518544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545536
10037	NC_021050	CTT	2	6	518569	518574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545536
10038	NC_021050	GCA	2	6	518646	518651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545536
10039	NC_021050	CCT	2	6	518674	518679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545536
10040	NC_021050	T	7	7	518688	518694	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10041	NC_021050	AGT	2	6	518777	518782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545536
10042	NC_021050	TAT	2	6	518800	518805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545536
10043	NC_021050	AGC	2	6	518828	518833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545536
10044	NC_021050	GT	4	8	518872	518879	0 %	50 %	50 %	0 %	482545536
10045	NC_021050	T	7	7	518910	518916	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10046	NC_021050	ATG	2	6	518917	518922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545536
10047	NC_021050	T	7	7	519127	519133	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10048	NC_021050	CTT	2	6	519176	519181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545536
10049	NC_021050	CTG	2	6	519194	519199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545536
10050	NC_021050	T	6	6	519220	519225	0 %	100 %	0 %	0 %	482545536
10051	NC_021050	GTTG	2	8	519253	519260	0 %	50 %	50 %	0 %	482545536
10052	NC_021050	TGC	2	6	519272	519277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545536
10053	NC_021050	ATT	2	6	519282	519287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545536
10054	NC_021050	CTCTA	2	10	519323	519332	20 %	40 %	0 %	40 %	482545536
10055	NC_021050	TAT	2	6	519362	519367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545536
10056	NC_021050	GTT	2	6	519444	519449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545537
10057	NC_021050	GATA	2	8	519458	519465	50 %	25 %	25 %	0 %	482545537
10058	NC_021050	TCA	2	6	519506	519511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545537
10059	NC_021050	T	7	7	519534	519540	0 %	100 %	0 %	0 %	482545537
10060	NC_021050	AAG	2	6	519549	519554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545537
10061	NC_021050	GAA	2	6	519798	519803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545537
10062	NC_021050	GAA	2	6	519810	519815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545537
10063	NC_021050	GAAA	2	8	519824	519831	75 %	0 %	25 %	0 %	482545537
10064	NC_021050	ACC	2	6	519859	519864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545537
10065	NC_021050	A	6	6	519878	519883	100 %	0 %	0 %	0 %	482545537
10066	NC_021050	GGT	2	6	520055	520060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545538
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10069	NC_021050	CAT	2	6	520175	520180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545538
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10072	NC_021050	ACA	2	6	520327	520332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545538
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10077	NC_021050	TGC	2	6	520516	520521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545538
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10087	NC_021050	CAAGA	2	10	521555	521564	60 %	0 %	20 %	20 %	482545539
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10089	NC_021050	TCC	2	6	521649	521654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545539
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10092	NC_021050	AAAG	2	8	521729	521736	75 %	0 %	25 %	0 %	482545539
10093	NC_021050	ATA	2	6	521756	521761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545539
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10095	NC_021050	TGT	3	9	522277	522285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545540
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10103	NC_021050	GT	3	6	522574	522579	0 %	50 %	50 %	0 %	482545540
10104	NC_021050	CTTTA	2	10	522602	522611	20 %	60 %	0 %	20 %	482545540
10105	NC_021050	TCC	2	6	522715	522720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545540
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10107	NC_021050	TGT	2	6	522793	522798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545540
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10109	NC_021050	TCT	2	6	522904	522909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545541
10110	NC_021050	CT	3	6	522933	522938	0 %	50 %	0 %	50 %	482545541
10111	NC_021050	CTA	2	6	522946	522951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545541
10112	NC_021050	GA	3	6	522952	522957	50 %	0 %	50 %	0 %	482545541
10113	NC_021050	CGA	2	6	523053	523058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545541
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10117	NC_021050	AAACC	2	10	523427	523436	60 %	0 %	0 %	40 %	482545541
10118	NC_021050	GCA	2	6	523463	523468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545541
10119	NC_021050	CTT	2	6	523644	523649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545541
10120	NC_021050	TAAA	2	8	523652	523659	75 %	25 %	0 %	0 %	482545541
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10122	NC_021050	AGA	2	6	523869	523874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545541
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10235	NC_021050	GAAC	2	8	529128	529135	50 %	0 %	25 %	25 %	482545547
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10243	NC_021050	ACA	2	6	529488	529493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545547
10244	NC_021050	CTT	2	6	529496	529501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545547
10245	NC_021050	GCA	2	6	529554	529559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545547
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10247	NC_021050	TAA	2	6	529594	529599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545547
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10273	NC_021050	TTG	2	6	530818	530823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545547
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10364	NC_021050	TCT	2	6	535540	535545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545551
10365	NC_021050	C	6	6	535584	535589	0 %	0 %	0 %	100 %	482545551
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10484	NC_021050	T	6	6	541308	541313	0 %	100 %	0 %	0 %	482545556
10485	NC_021050	GAT	2	6	541320	541325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545556
10486	NC_021050	ACTCCA	2	12	541350	541361	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	482545556
10487	NC_021050	GCT	2	6	541373	541378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545556
10488	NC_021050	GCA	2	6	541409	541414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545556
10489	NC_021050	AGA	2	6	541427	541432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545556
10490	NC_021050	T	6	6	541460	541465	0 %	100 %	0 %	0 %	482545556
10491	NC_021050	AGA	2	6	541474	541479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545556
10492	NC_021050	AGA	2	6	541504	541509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545556
10493	NC_021050	TAC	2	6	541515	541520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545556
10494	NC_021050	TAA	2	6	541523	541528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545556
10495	NC_021050	CAT	2	6	541562	541567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545556
10496	NC_021050	CAA	2	6	541575	541580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545556
10497	NC_021050	CTGCTT	2	12	541582	541593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482545556
10498	NC_021050	CAAA	2	8	541669	541676	75 %	0 %	0 %	25 %	482545556
10499	NC_021050	CGA	2	6	541677	541682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545556
10500	NC_021050	AT	3	6	541699	541704	50 %	50 %	0 %	0 %	482545556

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