MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021050	GAAA	2	8	439543	439550	75 %	0 %	25 %	0 %	482545458
8502	NC_021050	GTT	2	6	439586	439591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545458
8503	NC_021050	TAT	2	6	439602	439607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545458
8504	NC_021050	TCC	2	6	439629	439634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545458
8505	NC_021050	TAA	3	9	439692	439700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545459
8506	NC_021050	AGA	2	6	439775	439780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545459
8507	NC_021050	AGC	2	6	439797	439802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545459
8508	NC_021050	TTG	2	6	439807	439812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545459
8509	NC_021050	CAA	2	6	439823	439828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545459
8510	NC_021050	AGA	2	6	439829	439834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545459
8511	NC_021050	AAG	2	6	439875	439880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545459
8512	NC_021050	TAA	2	6	439888	439893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545459
8513	NC_021050	CA	3	6	440097	440102	50 %	0 %	0 %	50 %	482545459
8514	NC_021050	ATC	2	6	440145	440150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545459
8515	NC_021050	AT	3	6	440304	440309	50 %	50 %	0 %	0 %	482545460
8516	NC_021050	T	6	6	440314	440319	0 %	100 %	0 %	0 %	482545460
8517	NC_021050	AGA	3	9	440320	440328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545460
8518	NC_021050	CTTT	2	8	440357	440364	0 %	75 %	0 %	25 %	482545460
8519	NC_021050	G	6	6	440450	440455	0 %	0 %	100 %	0 %	482545460
8520	NC_021050	T	6	6	440473	440478	0 %	100 %	0 %	0 %	482545460
8521	NC_021050	GTT	2	6	440591	440596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545460
8522	NC_021050	GA	3	6	440600	440605	50 %	0 %	50 %	0 %	482545460
8523	NC_021050	TTA	2	6	440621	440626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545460
8524	NC_021050	TCC	2	6	440635	440640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545460
8525	NC_021050	A	8	8	440676	440683	100 %	0 %	0 %	0 %	482545460
8526	NC_021050	AAAGA	2	10	440732	440741	80 %	0 %	20 %	0 %	482545460
8527	NC_021050	AAT	2	6	440742	440747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545460
8528	NC_021050	TTA	2	6	440796	440801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545461
8529	NC_021050	T	6	6	440901	440906	0 %	100 %	0 %	0 %	482545461
8530	NC_021050	TTC	2	6	440987	440992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545461
8531	NC_021050	TCC	2	6	441000	441005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545461
8532	NC_021050	TTTA	2	8	441018	441025	25 %	75 %	0 %	0 %	482545461
8533	NC_021050	CTG	2	6	441216	441221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545461
8534	NC_021050	AGA	2	6	441245	441250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545461
8535	NC_021050	TTGCCA	2	12	441268	441279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482545461
8536	NC_021050	GA	4	8	441291	441298	50 %	0 %	50 %	0 %	482545461
8537	NC_021050	GAA	2	6	441305	441310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545461
8538	NC_021050	TTC	2	6	441344	441349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545461
8539	NC_021050	TTAC	2	8	441405	441412	25 %	50 %	0 %	25 %	482545461
8540	NC_021050	GTT	2	6	441450	441455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545461
8541	NC_021050	TAT	2	6	441485	441490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545461
8542	NC_021050	GAT	2	6	441501	441506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545461
8543	NC_021050	GAG	2	6	441532	441537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545461
8544	NC_021050	TC	3	6	441623	441628	0 %	50 %	0 %	50 %	482545461
8545	NC_021050	AG	3	6	441726	441731	50 %	0 %	50 %	0 %	482545462
8546	NC_021050	GCTA	2	8	441748	441755	25 %	25 %	25 %	25 %	482545462
8547	NC_021050	GA	3	6	441759	441764	50 %	0 %	50 %	0 %	482545462
8548	NC_021050	AAG	2	6	441767	441772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545462
8549	NC_021050	GCT	3	9	441773	441781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545462
8550	NC_021050	GTA	2	6	441832	441837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545462
8551	NC_021050	CCA	2	6	441840	441845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545462
8552	NC_021050	TC	3	6	441847	441852	0 %	50 %	0 %	50 %	482545462
8553	NC_021050	GCTA	2	8	441880	441887	25 %	25 %	25 %	25 %	482545462
8554	NC_021050	CGGC	2	8	441929	441936	0 %	0 %	50 %	50 %	482545462
8555	NC_021050	AGC	2	6	441970	441975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545462
8556	NC_021050	TGC	2	6	441979	441984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545462
8557	NC_021050	TCC	2	6	441991	441996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545462
8558	NC_021050	AG	3	6	442037	442042	50 %	0 %	50 %	0 %	482545462
8559	NC_021050	GA	4	8	442080	442087	50 %	0 %	50 %	0 %	482545462
8560	NC_021050	GGC	2	6	442120	442125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545462
8561	NC_021050	T	6	6	442219	442224	0 %	100 %	0 %	0 %	482545462
8562	NC_021050	TCT	2	6	442304	442309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545462
8563	NC_021050	GA	3	6	442413	442418	50 %	0 %	50 %	0 %	482545462
8564	NC_021050	ATC	2	6	442507	442512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545462
8565	NC_021050	TTGGTA	2	12	442882	442893	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482545463
8566	NC_021050	TG	3	6	442921	442926	0 %	50 %	50 %	0 %	482545463
8567	NC_021050	TCA	2	6	442929	442934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545463
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8570	NC_021050	TGC	2	6	443000	443005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545463
8571	NC_021050	CTG	2	6	443008	443013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545463
8572	NC_021050	AGC	2	6	443031	443036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545463
8573	NC_021050	CTTC	2	8	443229	443236	0 %	50 %	0 %	50 %	482545463
8574	NC_021050	GTA	2	6	443238	443243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545463
8575	NC_021050	AGGATC	2	12	443261	443272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482545463
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8580	NC_021050	GAA	2	6	443600	443605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545463
8581	NC_021050	TCT	2	6	443685	443690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545463
8582	NC_021050	CCAAT	2	10	443695	443704	40 %	20 %	0 %	40 %	482545463
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8588	NC_021050	TTTC	2	8	444037	444044	0 %	75 %	0 %	25 %	482545463
8589	NC_021050	AAC	2	6	444088	444093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545463
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8595	NC_021050	TGA	2	6	444392	444397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545463
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8597	NC_021050	TC	3	6	444458	444463	0 %	50 %	0 %	50 %	482545463
8598	NC_021050	ATC	2	6	444641	444646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545463
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8600	NC_021050	AAAG	2	8	444768	444775	75 %	0 %	25 %	0 %	482545463
8601	NC_021050	GA	3	6	444788	444793	50 %	0 %	50 %	0 %	482545463
8602	NC_021050	GCTTC	2	10	444796	444805	0 %	40 %	20 %	40 %	482545463
8603	NC_021050	CTC	2	6	444833	444838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545463
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8605	NC_021050	AG	3	6	445094	445099	50 %	0 %	50 %	0 %	482545464
8606	NC_021050	T	6	6	445110	445115	0 %	100 %	0 %	0 %	482545464
8607	NC_021050	AGCT	2	8	445143	445150	25 %	25 %	25 %	25 %	482545464
8608	NC_021050	CAA	2	6	445212	445217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545464
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8610	NC_021050	AAG	2	6	445282	445287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545464
8611	NC_021050	ATA	2	6	445368	445373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545464
8612	NC_021050	TAA	2	6	445497	445502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545464
8613	NC_021050	TGA	2	6	445586	445591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545464
8614	NC_021050	TCC	2	6	445646	445651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545464
8615	NC_021050	GAT	2	6	445678	445683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545464
8616	NC_021050	T	7	7	445785	445791	0 %	100 %	0 %	0 %	482545464
8617	NC_021050	AGA	2	6	445822	445827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545464
8618	NC_021050	T	6	6	445930	445935	0 %	100 %	0 %	0 %	482545465
8619	NC_021050	GA	3	6	446008	446013	50 %	0 %	50 %	0 %	482545465
8620	NC_021050	GGGTTT	2	12	446031	446042	0 %	50 %	50 %	0 %	482545465
8621	NC_021050	CAA	2	6	446057	446062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545465
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8992	NC_021050	GAA	2	6	463219	463224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545483
8993	NC_021050	TAA	2	6	463353	463358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545483
8994	NC_021050	TAGAT	2	10	463377	463386	40 %	40 %	20 %	0 %	482545483
8995	NC_021050	TAT	2	6	463387	463392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545483
8996	NC_021050	CTCC	2	8	463393	463400	0 %	25 %	0 %	75 %	482545483
8997	NC_021050	CTG	2	6	463409	463414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545483
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8999	NC_021050	TAT	2	6	463459	463464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545483
9000	NC_021050	TGG	2	6	463554	463559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545483

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