MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021050	GAT	2	6	262233	262238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545306
5002	NC_021050	AAAGC	2	10	262254	262263	60 %	0 %	20 %	20 %	482545306
5003	NC_021050	TAAAG	2	10	262292	262301	60 %	20 %	20 %	0 %	482545306
5004	NC_021050	GTT	2	6	262356	262361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545306
5005	NC_021050	TTG	2	6	262396	262401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545306
5006	NC_021050	A	6	6	262470	262475	100 %	0 %	0 %	0 %	482545306
5007	NC_021050	GCG	2	6	262519	262524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545307
5008	NC_021050	ATG	2	6	262669	262674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545307
5009	NC_021050	CGT	2	6	262738	262743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545308
5010	NC_021050	TGT	2	6	262982	262987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545308
5011	NC_021050	GTA	2	6	263023	263028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545308
5012	NC_021050	AGC	2	6	263055	263060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545308
5013	NC_021050	CAG	2	6	263113	263118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545309
5014	NC_021050	TTC	2	6	263145	263150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545309
5015	NC_021050	AAG	2	6	263188	263193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5016	NC_021050	GGA	2	6	263289	263294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545309
5017	NC_021050	GA	3	6	263305	263310	50 %	0 %	50 %	0 %	482545309
5018	NC_021050	AGA	2	6	263331	263336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5019	NC_021050	AGA	2	6	263340	263345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5020	NC_021050	AGAT	2	8	263360	263367	50 %	25 %	25 %	0 %	482545309
5021	NC_021050	GAA	2	6	263386	263391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5022	NC_021050	GCT	2	6	263392	263397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545309
5023	NC_021050	TGG	2	6	263400	263405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545309
5024	NC_021050	TGA	2	6	263430	263435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545309
5025	NC_021050	TGT	2	6	263436	263441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545309
5026	NC_021050	A	7	7	263498	263504	100 %	0 %	0 %	0 %	482545309
5027	NC_021050	TCT	2	6	263514	263519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545309
5028	NC_021050	GAA	2	6	263527	263532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5029	NC_021050	ATC	2	6	263534	263539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545309
5030	NC_021050	CAC	2	6	263577	263582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545309
5031	NC_021050	AAAC	2	8	263631	263638	75 %	0 %	0 %	25 %	482545309
5032	NC_021050	TCT	2	6	263792	263797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545309
5033	NC_021050	TGGT	2	8	263916	263923	0 %	50 %	50 %	0 %	482545309
5034	NC_021050	AGA	2	6	263985	263990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545309
5035	NC_021050	A	6	6	264469	264474	100 %	0 %	0 %	0 %	482545310
5036	NC_021050	ATT	2	6	264486	264491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545310
5037	NC_021050	CAA	2	6	264520	264525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545310
5038	NC_021050	CT	3	6	264528	264533	0 %	50 %	0 %	50 %	482545310
5039	NC_021050	GAA	2	6	264541	264546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5040	NC_021050	TA	3	6	264557	264562	50 %	50 %	0 %	0 %	482545310
5041	NC_021050	CAAG	2	8	264574	264581	50 %	0 %	25 %	25 %	482545310
5042	NC_021050	CT	4	8	264588	264595	0 %	50 %	0 %	50 %	482545310
5043	NC_021050	AGAC	2	8	264624	264631	50 %	0 %	25 %	25 %	482545310
5044	NC_021050	TCTTT	2	10	264657	264666	0 %	80 %	0 %	20 %	482545310
5045	NC_021050	AGA	2	6	264682	264687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5046	NC_021050	ATG	2	6	264735	264740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545310
5047	NC_021050	AAT	2	6	264758	264763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545310
5048	NC_021050	TAA	2	6	264832	264837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545310
5049	NC_021050	ATA	2	6	264894	264899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545310
5050	NC_021050	TG	3	6	264994	264999	0 %	50 %	50 %	0 %	482545310
5051	NC_021050	TGA	2	6	265006	265011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545310
5052	NC_021050	CTT	2	6	265026	265031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545310
5053	NC_021050	GTT	2	6	265063	265068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545310
5054	NC_021050	CAG	2	6	265161	265166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545310
5055	NC_021050	AGAAA	2	10	265181	265190	80 %	0 %	20 %	0 %	482545310
5056	NC_021050	TGAA	2	8	265245	265252	50 %	25 %	25 %	0 %	482545310
5057	NC_021050	TCT	2	6	265258	265263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545310
5058	NC_021050	GCT	2	6	265346	265351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545310
5059	NC_021050	AGA	2	6	265390	265395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5060	NC_021050	ATG	2	6	265440	265445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545310
5061	NC_021050	ATT	2	6	265483	265488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545310
5062	NC_021050	TAGA	2	8	265497	265504	50 %	25 %	25 %	0 %	482545310
5063	NC_021050	TTA	2	6	265541	265546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545310
5064	NC_021050	ATT	2	6	265763	265768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545310
5065	NC_021050	GAA	2	6	265769	265774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5066	NC_021050	CCAGAA	2	12	265814	265825	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482545310
5067	NC_021050	T	6	6	265828	265833	0 %	100 %	0 %	0 %	482545310
5068	NC_021050	TTTCT	2	10	265879	265888	0 %	80 %	0 %	20 %	482545310
5069	NC_021050	TTC	2	6	265935	265940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545310
5070	NC_021050	AGA	2	6	265942	265947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5071	NC_021050	CTT	2	6	265989	265994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545310
5072	NC_021050	GAA	2	6	265996	266001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545310
5073	NC_021050	TCT	2	6	266007	266012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545310
5074	NC_021050	A	7	7	266018	266024	100 %	0 %	0 %	0 %	482545310
5075	NC_021050	TGT	2	6	266074	266079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545310
5076	NC_021050	TAG	2	6	266247	266252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545310
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5078	NC_021050	AAC	2	6	266509	266514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545311
5079	NC_021050	ATA	2	6	266622	266627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545311
5080	NC_021050	AGT	2	6	266908	266913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545311
5081	NC_021050	T	6	6	266923	266928	0 %	100 %	0 %	0 %	482545311
5082	NC_021050	GAA	2	6	266999	267004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545311
5083	NC_021050	A	6	6	267003	267008	100 %	0 %	0 %	0 %	482545311
5084	NC_021050	T	6	6	267045	267050	0 %	100 %	0 %	0 %	482545311
5085	NC_021050	AGA	3	9	267143	267151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545311
5086	NC_021050	GAAT	2	8	267291	267298	50 %	25 %	25 %	0 %	482545311
5087	NC_021050	AG	3	6	267308	267313	50 %	0 %	50 %	0 %	482545311
5088	NC_021050	GA	4	8	267318	267325	50 %	0 %	50 %	0 %	482545311
5089	NC_021050	ATG	2	6	267397	267402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545311
5090	NC_021050	AGA	2	6	267439	267444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545311
5091	NC_021050	AGA	2	6	267467	267472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545311
5092	NC_021050	ATGC	2	8	267497	267504	25 %	25 %	25 %	25 %	482545312
5093	NC_021050	A	6	6	267533	267538	100 %	0 %	0 %	0 %	482545312
5094	NC_021050	GAG	2	6	267549	267554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545312
5095	NC_021050	TGGA	2	8	267588	267595	25 %	25 %	50 %	0 %	482545312
5096	NC_021050	TAC	2	6	267716	267721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545312
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5098	NC_021050	TAGA	2	8	267885	267892	50 %	25 %	25 %	0 %	482545312
5099	NC_021050	AG	3	6	267926	267931	50 %	0 %	50 %	0 %	482545312
5100	NC_021050	AAT	2	6	267990	267995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545312
5101	NC_021050	AAT	2	6	268044	268049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545312
5102	NC_021050	T	6	6	268110	268115	0 %	100 %	0 %	0 %	482545312
5103	NC_021050	ATA	2	6	268232	268237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545312
5104	NC_021050	TTA	2	6	268312	268317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545312
5105	NC_021050	TGA	2	6	268472	268477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545312
5106	NC_021050	ATG	2	6	268558	268563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545312
5107	NC_021050	T	8	8	268698	268705	0 %	100 %	0 %	0 %	482545313
5108	NC_021050	CTT	2	6	268706	268711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545313
5109	NC_021050	A	9	9	268720	268728	100 %	0 %	0 %	0 %	482545313
5110	NC_021050	CTG	2	6	268805	268810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545313
5111	NC_021050	ATGG	2	8	268823	268830	25 %	25 %	50 %	0 %	482545313
5112	NC_021050	GA	3	6	268832	268837	50 %	0 %	50 %	0 %	482545313
5113	NC_021050	CTT	2	6	268838	268843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545313
5114	NC_021050	GCT	2	6	268864	268869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545313
5115	NC_021050	ATTT	2	8	268893	268900	25 %	75 %	0 %	0 %	482545313
5116	NC_021050	ATT	2	6	268974	268979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545313
5117	NC_021050	TCTT	2	8	269015	269022	0 %	75 %	0 %	25 %	482545313
5118	NC_021050	TCA	2	6	269025	269030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545313
5119	NC_021050	TTA	2	6	269146	269151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545313
5120	NC_021050	GA	3	6	269253	269258	50 %	0 %	50 %	0 %	482545313
5121	NC_021050	GA	3	6	269343	269348	50 %	0 %	50 %	0 %	482545313
5122	NC_021050	T	6	6	269373	269378	0 %	100 %	0 %	0 %	482545313
5123	NC_021050	GA	3	6	269398	269403	50 %	0 %	50 %	0 %	482545313
5124	NC_021050	T	6	6	269508	269513	0 %	100 %	0 %	0 %	482545313
5125	NC_021050	ATC	2	6	269528	269533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545313
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5127	NC_021050	A	7	7	269795	269801	100 %	0 %	0 %	0 %	482545314
5128	NC_021050	A	7	7	269816	269822	100 %	0 %	0 %	0 %	482545314
5129	NC_021050	T	6	6	269836	269841	0 %	100 %	0 %	0 %	482545314
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5133	NC_021050	CTG	2	6	270036	270041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545314
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5226	NC_021050	CTGGC	2	10	274744	274753	0 %	20 %	40 %	40 %	482545315
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5230	NC_021050	TCAG	2	8	275024	275031	25 %	25 %	25 %	25 %	482545316
5231	NC_021050	T	6	6	275083	275088	0 %	100 %	0 %	0 %	482545316
5232	NC_021050	TCT	2	6	275096	275101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545316
5233	NC_021050	ATTT	2	8	275366	275373	25 %	75 %	0 %	0 %	482545317
5234	NC_021050	GAA	2	6	275379	275384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545317
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5236	NC_021050	ATC	2	6	275440	275445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545317
5237	NC_021050	ATC	2	6	275461	275466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545317
5238	NC_021050	ATA	2	6	275477	275482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545317
5239	NC_021050	GCA	3	9	275536	275544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545317
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5241	NC_021050	G	6	6	275654	275659	0 %	0 %	100 %	0 %	482545317
5242	NC_021050	GGAG	2	8	275683	275690	25 %	0 %	75 %	0 %	482545317
5243	NC_021050	T	7	7	275702	275708	0 %	100 %	0 %	0 %	482545317
5244	NC_021050	GTT	2	6	275738	275743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545317
5245	NC_021050	T	8	8	275785	275792	0 %	100 %	0 %	0 %	482545317
5246	NC_021050	AGAGA	2	10	275793	275802	60 %	0 %	40 %	0 %	482545317
5247	NC_021050	GAAG	2	8	275815	275822	50 %	0 %	50 %	0 %	482545317
5248	NC_021050	GAC	2	6	275884	275889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545318
5249	NC_021050	ATG	2	6	275937	275942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545318
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5251	NC_021050	CTT	2	6	275958	275963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545318
5252	NC_021050	GAA	2	6	275972	275977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545318
5253	NC_021050	GA	3	6	275997	276002	50 %	0 %	50 %	0 %	482545318
5254	NC_021050	T	8	8	276022	276029	0 %	100 %	0 %	0 %	482545318
5255	NC_021050	AGA	2	6	276037	276042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545318
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5352	NC_021050	CAAG	2	8	281254	281261	50 %	0 %	25 %	25 %	482545326
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5361	NC_021050	GAAA	2	8	281592	281599	75 %	0 %	25 %	0 %	482545326
5362	NC_021050	T	6	6	281602	281607	0 %	100 %	0 %	0 %	482545326
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5364	NC_021050	AG	3	6	281629	281634	50 %	0 %	50 %	0 %	482545326
5365	NC_021050	A	6	6	281657	281662	100 %	0 %	0 %	0 %	482545326
5366	NC_021050	TGT	2	6	281723	281728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545327
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5370	NC_021050	CAG	2	6	281872	281877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545327
5371	NC_021050	TGC	2	6	281903	281908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545327
5372	NC_021050	GAA	2	6	282033	282038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545327
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5384	NC_021050	AGAA	2	8	282885	282892	75 %	0 %	25 %	0 %	482545328
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5393	NC_021050	A	6	6	283335	283340	100 %	0 %	0 %	0 %	482545328
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5399	NC_021050	A	8	8	283546	283553	100 %	0 %	0 %	0 %	482545328
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5479	NC_021050	GTTT	2	8	288378	288385	0 %	75 %	25 %	0 %	482545333
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5487	NC_021050	TTTCC	2	10	288581	288590	0 %	60 %	0 %	40 %	482545333
5488	NC_021050	ATT	5	15	288615	288629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545333
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5491	NC_021050	TAT	2	6	288782	288787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545333
5492	NC_021050	TAC	2	6	288788	288793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545333
5493	NC_021050	TTC	2	6	288799	288804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545333
5494	NC_021050	ATT	2	6	288845	288850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545333
5495	NC_021050	A	7	7	288854	288860	100 %	0 %	0 %	0 %	482545333
5496	NC_021050	CGT	2	6	288861	288866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545333
5497	NC_021050	TCC	2	6	288986	288991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545333
5498	NC_021050	TGGT	2	8	289026	289033	0 %	50 %	50 %	0 %	482545333
5499	NC_021050	CTC	2	6	289051	289056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545333
5500	NC_021050	TCT	2	6	289113	289118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545333

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