MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020976	TTCC	2	8	207937	207944	0 %	50 %	0 %	50 %	478464144
4002	NC_020976	TAA	2	6	207952	207957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
4003	NC_020976	AGTA	2	8	208041	208048	50 %	25 %	25 %	0 %	478464144
4004	NC_020976	TTC	2	6	208095	208100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4005	NC_020976	CGC	2	6	208126	208131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478464144
4006	NC_020976	ATC	2	6	208175	208180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464144
4007	NC_020976	TGA	2	6	208192	208197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464144
4008	NC_020976	ATA	2	6	208215	208220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
4009	NC_020976	TCT	2	6	208221	208226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4010	NC_020976	ACG	2	6	208265	208270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464144
4011	NC_020976	TTC	2	6	208304	208309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4012	NC_020976	TAAC	2	8	208324	208331	50 %	25 %	0 %	25 %	478464144
4013	NC_020976	TCT	2	6	208332	208337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4014	NC_020976	ATA	2	6	208355	208360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
4015	NC_020976	TGT	2	6	208491	208496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464144
4016	NC_020976	TAC	2	6	208535	208540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464144
4017	NC_020976	AAG	2	6	208566	208571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464144
4018	NC_020976	TTTA	2	8	208601	208608	25 %	75 %	0 %	0 %	478464144
4019	NC_020976	TTC	3	9	208621	208629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4020	NC_020976	AAC	2	6	208769	208774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464144
4021	NC_020976	T	6	6	208790	208795	0 %	100 %	0 %	0 %	478464144
4022	NC_020976	ATTT	2	8	208906	208913	25 %	75 %	0 %	0 %	478464144
4023	NC_020976	AAT	2	6	208937	208942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
4024	NC_020976	GC	3	6	208986	208991	0 %	0 %	50 %	50 %	478464144
4025	NC_020976	AAT	2	6	209048	209053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
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4027	NC_020976	AATT	2	8	209144	209151	50 %	50 %	0 %	0 %	478464144
4028	NC_020976	TTG	2	6	209176	209181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464144
4029	NC_020976	GAG	2	6	209202	209207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464144
4030	NC_020976	GCA	2	6	209361	209366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464144
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4032	NC_020976	AAT	2	6	209627	209632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464144
4033	NC_020976	GAT	2	6	209693	209698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464144
4034	NC_020976	TTC	2	6	209699	209704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464144
4035	NC_020976	TTTA	2	8	209705	209712	25 %	75 %	0 %	0 %	478464144
4036	NC_020976	ATT	2	6	209743	209748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464145
4037	NC_020976	TTG	2	6	209889	209894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464145
4038	NC_020976	TC	3	6	209919	209924	0 %	50 %	0 %	50 %	478464145
4039	NC_020976	TTC	2	6	209958	209963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464145
4040	NC_020976	AGT	2	6	209976	209981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464145
4041	NC_020976	AACA	2	8	210003	210010	75 %	0 %	0 %	25 %	478464145
4042	NC_020976	TCT	2	6	210029	210034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464145
4043	NC_020976	TGGA	2	8	210061	210068	25 %	25 %	50 %	0 %	478464145
4044	NC_020976	TTC	2	6	210115	210120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464145
4045	NC_020976	TA	3	6	210135	210140	50 %	50 %	0 %	0 %	478464145
4046	NC_020976	TTC	2	6	210163	210168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464145
4047	NC_020976	GCA	2	6	210173	210178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464145
4048	NC_020976	GCT	2	6	210182	210187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464145
4049	NC_020976	GGA	2	6	210239	210244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464145
4050	NC_020976	T	6	6	210307	210312	0 %	100 %	0 %	0 %	478464145
4051	NC_020976	AACG	2	8	210355	210362	50 %	0 %	25 %	25 %	478464145
4052	NC_020976	TCA	2	6	210398	210403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464145
4053	NC_020976	CTTT	2	8	210416	210423	0 %	75 %	0 %	25 %	478464145
4054	NC_020976	CCAT	2	8	210446	210453	25 %	25 %	0 %	50 %	478464145
4055	NC_020976	GA	3	6	210464	210469	50 %	0 %	50 %	0 %	478464145
4056	NC_020976	T	6	6	210484	210489	0 %	100 %	0 %	0 %	478464145
4057	NC_020976	AGG	2	6	210508	210513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464145
4058	NC_020976	CATT	2	8	210530	210537	25 %	50 %	0 %	25 %	478464145
4059	NC_020976	AGA	2	6	210564	210569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464145
4060	NC_020976	CAA	2	6	210577	210582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464145
4061	NC_020976	ATA	4	12	210620	210631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464145
4062	NC_020976	GCT	2	6	210689	210694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464145
4063	NC_020976	GAA	2	6	210774	210779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464145
4064	NC_020976	ACG	2	6	210790	210795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464145
4065	NC_020976	AGCG	2	8	210900	210907	25 %	0 %	50 %	25 %	478464145
4066	NC_020976	CT	3	6	210937	210942	0 %	50 %	0 %	50 %	478464145
4067	NC_020976	CT	3	6	210945	210950	0 %	50 %	0 %	50 %	478464145
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4071	NC_020976	TGTTT	2	10	211094	211103	0 %	80 %	20 %	0 %	478464145
4072	NC_020976	CTA	2	6	211146	211151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464145
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4074	NC_020976	TAGA	2	8	211197	211204	50 %	25 %	25 %	0 %	478464145
4075	NC_020976	CTTGT	2	10	211275	211284	0 %	60 %	20 %	20 %	478464145
4076	NC_020976	ATT	2	6	211291	211296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464145
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4081	NC_020976	CTGGAT	2	12	211602	211613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478464145
4082	NC_020976	GTA	2	6	211827	211832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464145
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4084	NC_020976	CTTG	2	8	211869	211876	0 %	50 %	25 %	25 %	478464145
4085	NC_020976	GAAATA	2	12	211925	211936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478464145
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4088	NC_020976	CGT	2	6	212118	212123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464145
4089	NC_020976	TTTCT	2	10	212125	212134	0 %	80 %	0 %	20 %	478464145
4090	NC_020976	TAA	2	6	212154	212159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464146
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4093	NC_020976	ACG	2	6	212460	212465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464146
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4095	NC_020976	AATA	2	8	212753	212760	75 %	25 %	0 %	0 %	478464147
4096	NC_020976	CTT	2	6	212803	212808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464147
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4100	NC_020976	AAG	2	6	212986	212991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464147
4101	NC_020976	CTT	2	6	212992	212997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464147
4102	NC_020976	CTT	2	6	213019	213024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464147
4103	NC_020976	CTG	2	6	213078	213083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464147
4104	NC_020976	CCA	2	6	213141	213146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464147
4105	NC_020976	CAAA	2	8	213161	213168	75 %	0 %	0 %	25 %	478464147
4106	NC_020976	CCA	2	6	213180	213185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464147
4107	NC_020976	GCA	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464147
4108	NC_020976	CAA	2	6	213205	213210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464147
4109	NC_020976	TAC	2	6	213256	213261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464147
4110	NC_020976	CTT	2	6	213319	213324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464147
4111	NC_020976	TA	3	6	213445	213450	50 %	50 %	0 %	0 %	478464148
4112	NC_020976	ATG	2	6	213498	213503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464148
4113	NC_020976	TGT	2	6	213506	213511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464148
4114	NC_020976	GC	3	6	213571	213576	0 %	0 %	50 %	50 %	478464148
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4118	NC_020976	CAC	2	6	213828	213833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464148
4119	NC_020976	TCT	2	6	213898	213903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464148
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4122	NC_020976	T	6	6	213982	213987	0 %	100 %	0 %	0 %	478464148
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4246	NC_020976	T	6	6	219818	219823	0 %	100 %	0 %	0 %	478464153
4247	NC_020976	AGA	2	6	219832	219837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464153
4248	NC_020976	AGA	2	6	219862	219867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464153
4249	NC_020976	TAC	2	6	219873	219878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464153
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4251	NC_020976	CAT	2	6	219920	219925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464153
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4365	NC_020976	CTT	2	6	225459	225464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464159
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4492	NC_020976	A	6	6	232044	232049	100 %	0 %	0 %	0 %	478464163
4493	NC_020976	A	6	6	232128	232133	100 %	0 %	0 %	0 %	478464163
4494	NC_020976	TAA	2	6	232198	232203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464163
4495	NC_020976	ACG	2	6	232259	232264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464163
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