MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020976	TG	3	6	508924	508929	0 %	50 %	50 %	0 %	478464405
10003	NC_020976	GAA	2	6	508968	508973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464405
10004	NC_020976	CGAAT	2	10	509063	509072	40 %	20 %	20 %	20 %	478464405
10005	NC_020976	ACT	2	6	509073	509078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464405
10006	NC_020976	TCT	2	6	509169	509174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464405
10007	NC_020976	CTA	2	6	509245	509250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464405
10008	NC_020976	AGC	2	6	509264	509269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464405
10009	NC_020976	AAG	2	6	509302	509307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464405
10010	NC_020976	AGC	2	6	509326	509331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464405
10011	NC_020976	CAA	2	6	509338	509343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464405
10012	NC_020976	ATT	2	6	509345	509350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464405
10013	NC_020976	ACT	2	6	509433	509438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464405
10014	NC_020976	TTA	2	6	509439	509444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464405
10015	NC_020976	ACG	2	6	509505	509510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464405
10016	NC_020976	TACT	2	8	509599	509606	25 %	50 %	0 %	25 %	478464405
10017	NC_020976	GTT	2	6	509631	509636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464405
10018	NC_020976	TCC	2	6	509657	509662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464405
10019	NC_020976	AGA	2	6	509786	509791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464405
10020	NC_020976	CAA	3	9	509821	509829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464405
10021	NC_020976	GCTGTT	2	12	509838	509849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478464405
10022	NC_020976	ACT	2	6	509877	509882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464405
10023	NC_020976	CTT	2	6	509911	509916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464405
10024	NC_020976	AGC	2	6	509995	510000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464405
10025	NC_020976	CTT	2	6	510004	510009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464405
10026	NC_020976	CAG	2	6	510088	510093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464405
10027	NC_020976	TG	3	6	510240	510245	0 %	50 %	50 %	0 %	478464405
10028	NC_020976	ATC	2	6	510260	510265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464405
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10030	NC_020976	T	6	6	510392	510397	0 %	100 %	0 %	0 %	478464405
10031	NC_020976	AGCTA	2	10	510434	510443	40 %	20 %	20 %	20 %	478464405
10032	NC_020976	TGA	2	6	510544	510549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464405
10033	NC_020976	ACC	2	6	510844	510849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464406
10034	NC_020976	TCTT	2	8	510857	510864	0 %	75 %	0 %	25 %	478464406
10035	NC_020976	ACA	2	6	510931	510936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464406
10036	NC_020976	ACT	2	6	510937	510942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464406
10037	NC_020976	ACA	2	6	510950	510955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464406
10038	NC_020976	AGC	2	6	510964	510969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464406
10039	NC_020976	T	7	7	510981	510987	0 %	100 %	0 %	0 %	478464406
10040	NC_020976	A	6	6	511322	511327	100 %	0 %	0 %	0 %	478464407
10041	NC_020976	CTG	2	6	511358	511363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464407
10042	NC_020976	CCT	2	6	511365	511370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464407
10043	NC_020976	TC	3	6	511463	511468	0 %	50 %	0 %	50 %	478464407
10044	NC_020976	CTT	2	6	511494	511499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464407
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10047	NC_020976	TGC	3	9	511606	511614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464408
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10050	NC_020976	ATG	2	6	511767	511772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464408
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10052	NC_020976	CTT	2	6	511836	511841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464408
10053	NC_020976	ACA	2	6	511865	511870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464408
10054	NC_020976	TAA	2	6	511905	511910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464408
10055	NC_020976	CTC	2	6	511911	511916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464408
10056	NC_020976	AAG	2	6	511945	511950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464408
10057	NC_020976	GTA	2	6	511978	511983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464408
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10059	NC_020976	GAA	2	6	512003	512008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464408
10060	NC_020976	CT	3	6	512062	512067	0 %	50 %	0 %	50 %	478464408
10061	NC_020976	CTT	2	6	512246	512251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464408
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10063	NC_020976	A	6	6	512276	512281	100 %	0 %	0 %	0 %	478464408
10064	NC_020976	TTCT	2	8	512293	512300	0 %	75 %	0 %	25 %	478464408
10065	NC_020976	AGA	2	6	512329	512334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464408
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10067	NC_020976	AGA	2	6	512383	512388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464408
10068	NC_020976	ATC	2	6	512454	512459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464408
10069	NC_020976	ACGAC	2	10	512539	512548	40 %	0 %	20 %	40 %	478464408
10070	NC_020976	CTCTT	2	10	512622	512631	0 %	60 %	0 %	40 %	478464408
10071	NC_020976	TCC	2	6	512676	512681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464408
10072	NC_020976	CCGC	2	8	512705	512712	0 %	0 %	25 %	75 %	478464408
10073	NC_020976	GAG	2	6	512729	512734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464408
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10079	NC_020976	CTTC	2	8	513434	513441	0 %	50 %	0 %	50 %	478464409
10080	NC_020976	TCT	2	6	513545	513550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464409
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10085	NC_020976	TGC	2	6	513832	513837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464409
10086	NC_020976	TGAACT	2	12	513838	513849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478464409
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10088	NC_020976	CAA	2	6	514330	514335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464410
10089	NC_020976	ATA	2	6	514364	514369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464410
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10091	NC_020976	TAA	2	6	514504	514509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464410
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10094	NC_020976	GA	3	6	514617	514622	50 %	0 %	50 %	0 %	478464410
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10101	NC_020976	GAA	2	6	514794	514799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464410
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10104	NC_020976	AAT	2	6	514909	514914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464410
10105	NC_020976	CAG	2	6	515049	515054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464410
10106	NC_020976	TAATTC	2	12	515160	515171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478464410
10107	NC_020976	CGA	2	6	515182	515187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464410
10108	NC_020976	T	6	6	515225	515230	0 %	100 %	0 %	0 %	478464410
10109	NC_020976	TC	3	6	515289	515294	0 %	50 %	0 %	50 %	478464410
10110	NC_020976	A	6	6	515342	515347	100 %	0 %	0 %	0 %	478464410
10111	NC_020976	AAG	2	6	515373	515378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464410
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10115	NC_020976	TGCAA	2	10	515491	515500	40 %	20 %	20 %	20 %	478464410
10116	NC_020976	CTG	2	6	515583	515588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464410
10117	NC_020976	GCA	2	6	515631	515636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464410
10118	NC_020976	AAG	2	6	515649	515654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464410
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10120	NC_020976	TGT	2	6	515666	515671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464410
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10241	NC_020976	TCC	2	6	523229	523234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464414
10242	NC_020976	GAT	2	6	523262	523267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464414
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