MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 20290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020974	A	6	6	54572	54577	100 %	0 %	0 %	0 %	478463111
1003	NC_020974	TATT	2	8	54594	54601	25 %	75 %	0 %	0 %	478463111
1004	NC_020974	CTT	2	6	54603	54608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463111
1005	NC_020974	A	7	7	54710	54716	100 %	0 %	0 %	0 %	478463112
1006	NC_020974	TTC	2	6	54733	54738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463112
1007	NC_020974	CAC	2	6	54862	54867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463112
1008	NC_020974	CAA	2	6	54896	54901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463112
1009	NC_020974	GAA	2	6	54923	54928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463112
1010	NC_020974	CT	3	6	54947	54952	0 %	50 %	0 %	50 %	478463112
1011	NC_020974	TCGA	2	8	54982	54989	25 %	25 %	25 %	25 %	478463112
1012	NC_020974	CTTC	2	8	55076	55083	0 %	50 %	0 %	50 %	478463112
1013	NC_020974	GAAT	2	8	55111	55118	50 %	25 %	25 %	0 %	478463112
1014	NC_020974	TGT	2	6	55147	55152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463112
1015	NC_020974	GAT	2	6	55175	55180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463112
1016	NC_020974	TTGA	2	8	55181	55188	25 %	50 %	25 %	0 %	478463112
1017	NC_020974	AGC	2	6	55230	55235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463112
1018	NC_020974	TCA	2	6	55236	55241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463112
1019	NC_020974	A	6	6	55370	55375	100 %	0 %	0 %	0 %	478463112
1020	NC_020974	CAA	2	6	55389	55394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463112
1021	NC_020974	G	6	6	55426	55431	0 %	0 %	100 %	0 %	478463112
1022	NC_020974	AAT	2	6	55523	55528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463112
1023	NC_020974	GGAA	2	8	55537	55544	50 %	0 %	50 %	0 %	478463112
1024	NC_020974	TGG	2	6	55686	55691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463112
1025	NC_020974	GGTTCA	2	12	55709	55720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478463112
1026	NC_020974	TTATC	2	10	55810	55819	20 %	60 %	0 %	20 %	478463112
1027	NC_020974	AGAA	2	8	55883	55890	75 %	0 %	25 %	0 %	478463112
1028	NC_020974	CTG	2	6	55905	55910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463112
1029	NC_020974	GAG	2	6	55911	55916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463112
1030	NC_020974	AT	3	6	56155	56160	50 %	50 %	0 %	0 %	478463112
1031	NC_020974	TTA	2	6	56170	56175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463112
1032	NC_020974	TGT	2	6	56337	56342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463113
1033	NC_020974	TGG	2	6	56346	56351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463113
1034	NC_020974	T	6	6	56383	56388	0 %	100 %	0 %	0 %	478463113
1035	NC_020974	CTGG	3	12	56448	56459	0 %	25 %	50 %	25 %	478463113
1036	NC_020974	ATT	2	6	56463	56468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463113
1037	NC_020974	GAT	2	6	56476	56481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463113
1038	NC_020974	TCT	2	6	56494	56499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463113
1039	NC_020974	TCC	2	6	56508	56513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463113
1040	NC_020974	TCC	2	6	56526	56531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463113
1041	NC_020974	TTA	2	6	56539	56544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463113
1042	NC_020974	TTGC	2	8	56582	56589	0 %	50 %	25 %	25 %	478463113
1043	NC_020974	AGCG	2	8	56622	56629	25 %	0 %	50 %	25 %	478463113
1044	NC_020974	T	6	6	56634	56639	0 %	100 %	0 %	0 %	478463113
1045	NC_020974	GTA	2	6	56665	56670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463113
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1047	NC_020974	TGG	2	6	56796	56801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463113
1048	NC_020974	GTTGT	2	10	56875	56884	0 %	60 %	40 %	0 %	478463113
1049	NC_020974	T	6	6	56930	56935	0 %	100 %	0 %	0 %	478463113
1050	NC_020974	GAAAAG	2	12	56965	56976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463113
1051	NC_020974	TCC	2	6	56980	56985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463113
1052	NC_020974	AGT	3	9	57069	57077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463113
1053	NC_020974	AGCT	2	8	57081	57088	25 %	25 %	25 %	25 %	478463113
1054	NC_020974	CT	3	6	57087	57092	0 %	50 %	0 %	50 %	478463113
1055	NC_020974	GAG	2	6	57100	57105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463113
1056	NC_020974	TGG	2	6	57123	57128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463113
1057	NC_020974	GT	3	6	57137	57142	0 %	50 %	50 %	0 %	478463113
1058	NC_020974	TGT	2	6	57146	57151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463113
1059	NC_020974	AGT	2	6	57156	57161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463113
1060	NC_020974	GTT	2	6	57249	57254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463113
1061	NC_020974	T	6	6	57253	57258	0 %	100 %	0 %	0 %	478463113
1062	NC_020974	TTTG	2	8	57327	57334	0 %	75 %	25 %	0 %	478463113
1063	NC_020974	AGA	2	6	57409	57414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463113
1064	NC_020974	CAG	2	6	57572	57577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463113
1065	NC_020974	CAT	2	6	57581	57586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463113
1066	NC_020974	TTG	2	6	57594	57599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463113
1067	NC_020974	TG	3	6	57778	57783	0 %	50 %	50 %	0 %	478463113
1068	NC_020974	GGTT	2	8	57787	57794	0 %	50 %	50 %	0 %	478463113
1069	NC_020974	TAA	2	6	57843	57848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463113
1070	NC_020974	ACT	2	6	57859	57864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463113
1071	NC_020974	TTA	2	6	57865	57870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463113
1072	NC_020974	GAA	3	9	57883	57891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463113
1073	NC_020974	ATT	2	6	57894	57899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463113
1074	NC_020974	T	6	6	57898	57903	0 %	100 %	0 %	0 %	478463113
1075	NC_020974	ATT	2	6	57913	57918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463113
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1078	NC_020974	GGA	2	6	58023	58028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463114
1079	NC_020974	GTT	2	6	58029	58034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463114
1080	NC_020974	GCT	2	6	58068	58073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463114
1081	NC_020974	GAT	2	6	58086	58091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463114
1082	NC_020974	TGA	2	6	58103	58108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463114
1083	NC_020974	CCT	2	6	58116	58121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463114
1084	NC_020974	AGTTGT	2	12	58182	58193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478463114
1085	NC_020974	GAT	2	6	58248	58253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463114
1086	NC_020974	TCC	2	6	58265	58270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463114
1087	NC_020974	GAG	2	6	58284	58289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463114
1088	NC_020974	AGTTGT	2	12	58326	58337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478463114
1089	NC_020974	AGA	2	6	58397	58402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463114
1090	NC_020974	CTA	2	6	58413	58418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463114
1091	NC_020974	CTG	2	6	58585	58590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463114
1092	NC_020974	TGT	2	6	58652	58657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463114
1093	NC_020974	AGAA	2	8	58721	58728	75 %	0 %	25 %	0 %	478463114
1094	NC_020974	CT	3	6	58732	58737	0 %	50 %	0 %	50 %	478463114
1095	NC_020974	GTT	2	6	58741	58746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463114
1096	NC_020974	AGGT	2	8	58761	58768	25 %	25 %	50 %	0 %	478463114
1097	NC_020974	CAC	2	6	58874	58879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463114
1098	NC_020974	AGG	2	6	58925	58930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463114
1099	NC_020974	TCT	2	6	58941	58946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463114
1100	NC_020974	T	9	9	59050	59058	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1101	NC_020974	CAA	2	6	59116	59121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463114
1102	NC_020974	GCT	2	6	59145	59150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463114
1103	NC_020974	ATC	2	6	59183	59188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463114
1104	NC_020974	T	7	7	59191	59197	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1105	NC_020974	TGT	2	6	59218	59223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463114
1106	NC_020974	TCTTGT	2	12	59235	59246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478463114
1107	NC_020974	T	8	8	59257	59264	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1108	NC_020974	CTT	2	6	59275	59280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463114
1109	NC_020974	TTC	2	6	59306	59311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463114
1110	NC_020974	TGG	2	6	59332	59337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463114
1111	NC_020974	TAGA	2	8	59434	59441	50 %	25 %	25 %	0 %	478463114
1112	NC_020974	TTA	2	6	59520	59525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463114
1113	NC_020974	TGAA	2	8	59539	59546	50 %	25 %	25 %	0 %	478463114
1114	NC_020974	TGT	2	6	59553	59558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463114
1115	NC_020974	T	8	8	59616	59623	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1116	NC_020974	T	6	6	59636	59641	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1117	NC_020974	T	6	6	59647	59652	0 %	100 %	0 %	0 %	478463114
1118	NC_020974	AGA	2	6	59721	59726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463115
1119	NC_020974	TCT	2	6	59737	59742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463115
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1121	NC_020974	CGTT	2	8	59920	59927	0 %	50 %	25 %	25 %	478463115
1122	NC_020974	GGAG	2	8	59929	59936	25 %	0 %	75 %	0 %	478463115
1123	NC_020974	GTAA	2	8	59981	59988	50 %	25 %	25 %	0 %	478463115
1124	NC_020974	TCCTAA	2	12	60048	60059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463115
1125	NC_020974	AGT	2	6	60077	60082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463115
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1127	NC_020974	AGC	2	6	60157	60162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463115
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