MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020971	TCT	2	6	80535	80540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461317
1503	NC_020971	GAA	2	6	80545	80550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461317
1504	NC_020971	TGC	2	6	80595	80600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461317
1505	NC_020971	CAA	2	6	80629	80634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461317
1506	NC_020971	GAA	2	6	80647	80652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461317
1507	NC_020971	GGA	2	6	80691	80696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461317
1508	NC_020971	TC	4	8	80719	80726	0 %	50 %	0 %	50 %	478461317
1509	NC_020971	A	7	7	80738	80744	100 %	0 %	0 %	0 %	478461317
1510	NC_020971	TTACT	2	10	80778	80787	20 %	60 %	0 %	20 %	478461317
1511	NC_020971	TATC	2	8	80794	80801	25 %	50 %	0 %	25 %	478461317
1512	NC_020971	GA	3	6	80812	80817	50 %	0 %	50 %	0 %	478461317
1513	NC_020971	TAT	2	6	80892	80897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461317
1514	NC_020971	AGA	2	6	81096	81101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461317
1515	NC_020971	GGGA	2	8	81105	81112	25 %	0 %	75 %	0 %	478461317
1516	NC_020971	CTGC	2	8	81209	81216	0 %	25 %	25 %	50 %	478461318
1517	NC_020971	GCT	2	6	81227	81232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461318
1518	NC_020971	ATT	2	6	81233	81238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461318
1519	NC_020971	CTT	2	6	81276	81281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461318
1520	NC_020971	CTT	2	6	81297	81302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461318
1521	NC_020971	CAT	2	6	81344	81349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461318
1522	NC_020971	TGA	2	6	81466	81471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461318
1523	NC_020971	AGG	2	6	81477	81482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461318
1524	NC_020971	GGTT	2	8	81502	81509	0 %	50 %	50 %	0 %	478461318
1525	NC_020971	GTC	2	6	81525	81530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461318
1526	NC_020971	CT	3	6	81542	81547	0 %	50 %	0 %	50 %	478461318
1527	NC_020971	GGA	2	6	81548	81553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461318
1528	NC_020971	CAA	2	6	81554	81559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461318
1529	NC_020971	AG	3	6	81561	81566	50 %	0 %	50 %	0 %	478461318
1530	NC_020971	T	6	6	81568	81573	0 %	100 %	0 %	0 %	478461318
1531	NC_020971	CGAT	2	8	81630	81637	25 %	25 %	25 %	25 %	478461318
1532	NC_020971	TCAT	2	8	81705	81712	25 %	50 %	0 %	25 %	478461318
1533	NC_020971	TTA	2	6	81755	81760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461318
1534	NC_020971	TG	3	6	81772	81777	0 %	50 %	50 %	0 %	478461318
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1538	NC_020971	T	6	6	81940	81945	0 %	100 %	0 %	0 %	478461319
1539	NC_020971	GAC	2	6	81967	81972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461319
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1541	NC_020971	TTA	2	6	82013	82018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461319
1542	NC_020971	CTT	2	6	82067	82072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461319
1543	NC_020971	TTA	2	6	82110	82115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461319
1544	NC_020971	T	6	6	82118	82123	0 %	100 %	0 %	0 %	478461319
1545	NC_020971	AGAAA	2	10	82168	82177	80 %	0 %	20 %	0 %	478461319
1546	NC_020971	T	6	6	82223	82228	0 %	100 %	0 %	0 %	478461319
1547	NC_020971	GTTA	2	8	82247	82254	25 %	50 %	25 %	0 %	478461319
1548	NC_020971	ACA	2	6	82281	82286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461319
1549	NC_020971	GCG	2	6	82313	82318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461319
1550	NC_020971	T	6	6	82356	82361	0 %	100 %	0 %	0 %	478461319
1551	NC_020971	TGG	3	9	82382	82390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461319
1552	NC_020971	CAG	2	6	82458	82463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461319
1553	NC_020971	GTT	2	6	82469	82474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461319
1554	NC_020971	TATT	2	8	82479	82486	25 %	75 %	0 %	0 %	478461319
1555	NC_020971	GTG	2	6	82503	82508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461319
1556	NC_020971	CCT	2	6	82553	82558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461319
1557	NC_020971	GGAAG	2	10	82681	82690	40 %	0 %	60 %	0 %	478461319
1558	NC_020971	ATT	2	6	82700	82705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461319
1559	NC_020971	TTG	2	6	82722	82727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461319
1560	NC_020971	TTC	2	6	82730	82735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461319
1561	NC_020971	T	6	6	82764	82769	0 %	100 %	0 %	0 %	478461319
1562	NC_020971	GAA	2	6	82803	82808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461319
1563	NC_020971	GAA	2	6	82832	82837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461319
1564	NC_020971	GA	3	6	82894	82899	50 %	0 %	50 %	0 %	478461319
1565	NC_020971	GTTC	2	8	82904	82911	0 %	50 %	25 %	25 %	478461319
1566	NC_020971	GCT	2	6	83039	83044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461319
1567	NC_020971	GTGC	2	8	83051	83058	0 %	25 %	50 %	25 %	478461319
1568	NC_020971	TAA	2	6	83101	83106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461319
1569	NC_020971	CAT	2	6	83117	83122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461319
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1571	NC_020971	GA	3	6	83214	83219	50 %	0 %	50 %	0 %	478461319
1572	NC_020971	TAC	2	6	83265	83270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461320
1573	NC_020971	T	6	6	83289	83294	0 %	100 %	0 %	0 %	478461320
1574	NC_020971	T	7	7	83301	83307	0 %	100 %	0 %	0 %	478461320
1575	NC_020971	T	6	6	83314	83319	0 %	100 %	0 %	0 %	478461320
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1578	NC_020971	TATG	2	8	83435	83442	25 %	50 %	25 %	0 %	478461320
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1583	NC_020971	CAA	2	6	83548	83553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461320
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1585	NC_020971	CATT	2	8	83573	83580	25 %	50 %	0 %	25 %	478461320
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1599	NC_020971	TGC	2	6	84325	84330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461321
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1602	NC_020971	AG	3	6	84368	84373	50 %	0 %	50 %	0 %	478461321
1603	NC_020971	GAA	2	6	84401	84406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461321
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1608	NC_020971	GAAG	2	8	84698	84705	50 %	0 %	50 %	0 %	478461321
1609	NC_020971	A	6	6	84722	84727	100 %	0 %	0 %	0 %	478461321
1610	NC_020971	AGA	2	6	84772	84777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461321
1611	NC_020971	TTC	2	6	84850	84855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461321
1612	NC_020971	TAAA	2	8	84864	84871	75 %	25 %	0 %	0 %	478461321
1613	NC_020971	ATCC	2	8	84935	84942	25 %	25 %	0 %	50 %	478461321
1614	NC_020971	TGG	2	6	84963	84968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461321
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1618	NC_020971	TTTC	2	8	85082	85089	0 %	75 %	0 %	25 %	478461321
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1627	NC_020971	AG	3	6	85666	85671	50 %	0 %	50 %	0 %	478461322
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1876	NC_020971	T	8	8	99260	99267	0 %	100 %	0 %	0 %	478461333
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1879	NC_020971	GCC	2	6	99422	99427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478461333
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