MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 20358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020969	CTT	2	6	508854	508859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473409
10003	NC_020969	CTT	2	6	508942	508947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473409
10004	NC_020969	TAA	2	6	508968	508973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473409
10005	NC_020969	CTT	2	6	509020	509025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473409
10006	NC_020969	GTC	2	6	509037	509042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473409
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10008	NC_020969	GCA	2	6	509154	509159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473410
10009	NC_020969	AGTTTT	2	12	509348	509359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478473410
10010	NC_020969	AGAC	2	8	509367	509374	50 %	0 %	25 %	25 %	478473410
10011	NC_020969	GAG	2	6	509386	509391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473410
10012	NC_020969	TTTC	2	8	509411	509418	0 %	75 %	0 %	25 %	478473410
10013	NC_020969	CTT	2	6	509438	509443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473410
10014	NC_020969	TCG	2	6	509461	509466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473410
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10017	NC_020969	TAT	2	6	509873	509878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473411
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10019	NC_020969	TCTT	2	8	509962	509969	0 %	75 %	0 %	25 %	478473411
10020	NC_020969	GAA	2	6	509990	509995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473411
10021	NC_020969	ATG	2	6	510226	510231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473412
10022	NC_020969	TCGC	2	8	510236	510243	0 %	25 %	25 %	50 %	478473412
10023	NC_020969	CAG	2	6	510287	510292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473412
10024	NC_020969	CGA	2	6	510301	510306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473412
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10026	NC_020969	TC	4	8	510378	510385	0 %	50 %	0 %	50 %	478473412
10027	NC_020969	GTTC	2	8	510403	510410	0 %	50 %	25 %	25 %	478473412
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10034	NC_020969	CTT	2	6	510659	510664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473412
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10041	NC_020969	GGA	2	6	510852	510857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473412
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10044	NC_020969	TG	3	6	510977	510982	0 %	50 %	50 %	0 %	478473412
10045	NC_020969	AGA	2	6	511002	511007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473412
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10047	NC_020969	CTG	2	6	511049	511054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473412
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10051	NC_020969	CGT	2	6	511219	511224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473412
10052	NC_020969	A	6	6	511226	511231	100 %	0 %	0 %	0 %	478473412
10053	NC_020969	GTC	2	6	511244	511249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473412
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10056	NC_020969	GA	3	6	511412	511417	50 %	0 %	50 %	0 %	478473412
10057	NC_020969	GGA	2	6	511423	511428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473412
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10060	NC_020969	GCA	2	6	511591	511596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473412
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10069	NC_020969	CAAA	2	8	512063	512070	75 %	0 %	0 %	25 %	478473412
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10105	NC_020969	AGA	2	6	513786	513791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473414
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10107	NC_020969	ACT	2	6	513877	513882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473414
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10109	NC_020969	AGC	2	6	513995	514000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473414
10110	NC_020969	CTT	2	6	514004	514009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473414
10111	NC_020969	CAG	2	6	514088	514093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473414
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10116	NC_020969	T	6	6	514392	514397	0 %	100 %	0 %	0 %	478473414
10117	NC_020969	AGCTA	2	10	514434	514443	40 %	20 %	20 %	20 %	478473414
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10121	NC_020969	TCTT	2	8	514857	514864	0 %	75 %	0 %	25 %	478473415
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10482	NC_020969	GGA	3	9	534173	534181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473428
10483	NC_020969	GCT	2	6	534193	534198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473428
10484	NC_020969	AGG	2	6	534313	534318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473428
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10491	NC_020969	TCG	2	6	534675	534680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473429
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10500	NC_020969	TA	3	6	534967	534972	50 %	50 %	0 %	0 %	478473429

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