MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 20358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020969	GAA	2	6	309004	309009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473237
6002	NC_020969	TG	3	6	309112	309117	0 %	50 %	50 %	0 %	478473237
6003	NC_020969	TG	3	6	309134	309139	0 %	50 %	50 %	0 %	478473237
6004	NC_020969	TTC	2	6	309227	309232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473238
6005	NC_020969	AGAA	2	8	309260	309267	75 %	0 %	25 %	0 %	478473238
6006	NC_020969	CTG	2	6	309280	309285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473238
6007	NC_020969	CTTTT	2	10	309295	309304	0 %	80 %	0 %	20 %	478473238
6008	NC_020969	TC	3	6	309368	309373	0 %	50 %	0 %	50 %	478473238
6009	NC_020969	GAA	2	6	309384	309389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473238
6010	NC_020969	AGC	2	6	309437	309442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473238
6011	NC_020969	AG	3	6	309533	309538	50 %	0 %	50 %	0 %	478473238
6012	NC_020969	TAC	2	6	309637	309642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473238
6013	NC_020969	CGC	2	6	309645	309650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478473238
6014	NC_020969	CAA	2	6	309651	309656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473238
6015	NC_020969	TC	3	6	309667	309672	0 %	50 %	0 %	50 %	478473238
6016	NC_020969	GCA	2	6	309692	309697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473238
6017	NC_020969	AAC	2	6	309743	309748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473238
6018	NC_020969	T	6	6	309753	309758	0 %	100 %	0 %	0 %	478473238
6019	NC_020969	TAA	2	6	309773	309778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473238
6020	NC_020969	TC	3	6	309815	309820	0 %	50 %	0 %	50 %	478473238
6021	NC_020969	AC	3	6	309935	309940	50 %	0 %	0 %	50 %	478473239
6022	NC_020969	TCT	2	6	309945	309950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473239
6023	NC_020969	CGTT	2	8	309955	309962	0 %	50 %	25 %	25 %	478473239
6024	NC_020969	GAT	2	6	309989	309994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473239
6025	NC_020969	GTTG	2	8	309995	310002	0 %	50 %	50 %	0 %	478473239
6026	NC_020969	CTC	2	6	310197	310202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473239
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6028	NC_020969	TAT	2	6	310247	310252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473239
6029	NC_020969	TCCT	2	8	310309	310316	0 %	50 %	0 %	50 %	478473239
6030	NC_020969	CTA	2	6	310318	310323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473239
6031	NC_020969	AGT	2	6	310361	310366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473239
6032	NC_020969	GGC	2	6	310386	310391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478473239
6033	NC_020969	GAAT	2	8	310396	310403	50 %	25 %	25 %	0 %	478473239
6034	NC_020969	AAAG	2	8	310503	310510	75 %	0 %	25 %	0 %	478473239
6035	NC_020969	AGA	2	6	310537	310542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473239
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6038	NC_020969	ACT	2	6	310764	310769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473239
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6041	NC_020969	GA	3	6	310903	310908	50 %	0 %	50 %	0 %	478473239
6042	NC_020969	CTT	2	6	310941	310946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473239
6043	NC_020969	CTT	2	6	310963	310968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473239
6044	NC_020969	T	6	6	311000	311005	0 %	100 %	0 %	0 %	478473239
6045	NC_020969	AAC	2	6	311039	311044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473239
6046	NC_020969	TTC	2	6	311153	311158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473239
6047	NC_020969	AATC	2	8	311228	311235	50 %	25 %	0 %	25 %	478473239
6048	NC_020969	ATT	2	6	311291	311296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473239
6049	NC_020969	TCT	2	6	311433	311438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473240
6050	NC_020969	TAT	2	6	311442	311447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473240
6051	NC_020969	CAA	2	6	311493	311498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473240
6052	NC_020969	TTC	2	6	311522	311527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473240
6053	NC_020969	TA	3	6	311575	311580	50 %	50 %	0 %	0 %	478473240
6054	NC_020969	CTC	2	6	311614	311619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473240
6055	NC_020969	TCTT	2	8	311696	311703	0 %	75 %	0 %	25 %	478473240
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6058	NC_020969	TTC	2	6	311872	311877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473240
6059	NC_020969	CTAT	2	8	311905	311912	25 %	50 %	0 %	25 %	478473240
6060	NC_020969	CTT	2	6	311956	311961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473240
6061	NC_020969	A	7	7	312019	312025	100 %	0 %	0 %	0 %	478473240
6062	NC_020969	A	6	6	312036	312041	100 %	0 %	0 %	0 %	478473240
6063	NC_020969	GCA	2	6	312123	312128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473240
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6066	NC_020969	TTG	2	6	312240	312245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473240
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6069	NC_020969	CAA	2	6	312333	312338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473241
6070	NC_020969	GCT	2	6	312440	312445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473241
6071	NC_020969	TGT	2	6	312453	312458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473241
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6074	NC_020969	TTG	2	6	312593	312598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473241
6075	NC_020969	TGGG	2	8	312705	312712	0 %	25 %	75 %	0 %	478473241
6076	NC_020969	AG	3	6	312736	312741	50 %	0 %	50 %	0 %	478473241
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6082	NC_020969	ATT	2	6	313129	313134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473242
6083	NC_020969	CTTGG	2	10	313154	313163	0 %	40 %	40 %	20 %	478473242
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6089	NC_020969	TAT	2	6	313345	313350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473242
6090	NC_020969	TGG	2	6	313384	313389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473242
6091	NC_020969	TGG	2	6	313416	313421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473242
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6096	NC_020969	ATC	2	6	313787	313792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473243
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6102	NC_020969	AAT	2	6	314020	314025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473243
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6105	NC_020969	A	8	8	314076	314083	100 %	0 %	0 %	0 %	478473244
6106	NC_020969	CTT	2	6	314084	314089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
6107	NC_020969	ATA	2	6	314135	314140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473244
6108	NC_020969	CAA	2	6	314167	314172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473244
6109	NC_020969	CTT	2	6	314240	314245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
6110	NC_020969	A	6	6	314327	314332	100 %	0 %	0 %	0 %	478473244
6111	NC_020969	CTAA	2	8	314377	314384	50 %	25 %	0 %	25 %	478473244
6112	NC_020969	CTT	2	6	314426	314431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
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6114	NC_020969	T	7	7	314490	314496	0 %	100 %	0 %	0 %	478473244
6115	NC_020969	CTT	2	6	314513	314518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
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6119	NC_020969	AGA	2	6	314823	314828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473244
6120	NC_020969	TTC	2	6	314862	314867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
6121	NC_020969	GGAA	2	8	315045	315052	50 %	0 %	50 %	0 %	478473244
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6123	NC_020969	TCT	2	6	315091	315096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473244
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