MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18005	NC_020968	AGA	2	6	924229	924234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460255
18006	NC_020968	TGTAT	2	10	924245	924254	20 %	60 %	20 %	0 %	478460255
18007	NC_020968	TGC	2	6	924286	924291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460255
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18011	NC_020968	GAA	2	6	924365	924370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460255
18012	NC_020968	AGA	2	6	924397	924402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460255
18013	NC_020968	AGA	2	6	924409	924414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460255
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18016	NC_020968	CTT	2	6	924561	924566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460256
18017	NC_020968	AC	3	6	924579	924584	50 %	0 %	0 %	50 %	478460256
18018	NC_020968	GTTTT	2	10	924615	924624	0 %	80 %	20 %	0 %	478460256
18019	NC_020968	T	8	8	924645	924652	0 %	100 %	0 %	0 %	478460256
18020	NC_020968	T	6	6	924676	924681	0 %	100 %	0 %	0 %	478460256
18021	NC_020968	GAA	2	6	924738	924743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460256
18022	NC_020968	GAA	2	6	924759	924764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460256
18023	NC_020968	TAC	2	6	924847	924852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460256
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18035	NC_020968	CAG	2	6	925281	925286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460256
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18040	NC_020968	TTTCA	2	10	925759	925768	20 %	60 %	0 %	20 %	478460256
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18043	NC_020968	GTT	2	6	926041	926046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460256
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18053	NC_020968	T	7	7	926445	926451	0 %	100 %	0 %	0 %	478460257
18054	NC_020968	T	6	6	926593	926598	0 %	100 %	0 %	0 %	478460257
18055	NC_020968	CTA	2	6	926622	926627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460257
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18057	NC_020968	TCA	2	6	926678	926683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460257
18058	NC_020968	ATCT	2	8	926697	926704	25 %	50 %	0 %	25 %	478460257
18059	NC_020968	CTA	2	6	926808	926813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460257
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18069	NC_020968	TAG	2	6	927708	927713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460257
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18105	NC_020968	CGATA	2	10	929541	929550	40 %	20 %	20 %	20 %	478460258
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18112	NC_020968	A	6	6	929797	929802	100 %	0 %	0 %	0 %	478460258
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18118	NC_020968	TTAT	2	8	929994	930001	25 %	75 %	0 %	0 %	478460258
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18487	NC_020968	TG	3	6	947682	947687	0 %	50 %	50 %	0 %	478460274
18488	NC_020968	ATCG	2	8	947705	947712	25 %	25 %	25 %	25 %	478460274
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18491	NC_020968	CGAT	2	8	947784	947791	25 %	25 %	25 %	25 %	478460274
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