MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11004	NC_020968	GAA	2	6	559101	559106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459942
11005	NC_020968	CT	3	6	559145	559150	0 %	50 %	0 %	50 %	478459942
11006	NC_020968	TGA	2	6	559167	559172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459942
11007	NC_020968	A	6	6	559200	559205	100 %	0 %	0 %	0 %	478459942
11008	NC_020968	GAA	2	6	559306	559311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459942
11009	NC_020968	TG	3	6	559323	559328	0 %	50 %	50 %	0 %	478459942
11010	NC_020968	AG	3	6	559422	559427	50 %	0 %	50 %	0 %	478459942
11011	NC_020968	TCT	2	6	559535	559540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459943
11012	NC_020968	ATA	2	6	559565	559570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459943
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11014	NC_020968	CTG	2	6	559605	559610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459943
11015	NC_020968	GAG	2	6	559640	559645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459943
11016	NC_020968	CTG	2	6	559688	559693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459944
11017	NC_020968	AAG	2	6	559879	559884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459944
11018	NC_020968	GAG	2	6	559962	559967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459944
11019	NC_020968	AAT	2	6	560010	560015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459944
11020	NC_020968	CTC	2	6	560019	560024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459944
11021	NC_020968	ACC	2	6	560089	560094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459944
11022	NC_020968	GCATAG	2	12	560115	560126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478459944
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11033	NC_020968	TTG	2	6	560920	560925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459945
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11041	NC_020968	CTA	2	6	561142	561147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459945
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11044	NC_020968	CATT	2	8	561226	561233	25 %	50 %	0 %	25 %	478459946
11045	NC_020968	CTG	2	6	561236	561241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459946
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11053	NC_020968	GAAA	2	8	561647	561654	75 %	0 %	25 %	0 %	478459946
11054	NC_020968	AAT	2	6	561655	561660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459946
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11057	NC_020968	A	6	6	561730	561735	100 %	0 %	0 %	0 %	478459946
11058	NC_020968	CTG	2	6	561778	561783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459946
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11060	NC_020968	TGA	2	6	561840	561845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459946
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11065	NC_020968	AAAG	2	8	561991	561998	75 %	0 %	25 %	0 %	478459946
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11100	NC_020968	C	6	6	564137	564142	0 %	0 %	0 %	100 %	478459949
11101	NC_020968	TGT	2	6	564240	564245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459949
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11104	NC_020968	TA	3	6	564302	564307	50 %	50 %	0 %	0 %	478459949
11105	NC_020968	GAAC	2	8	564354	564361	50 %	0 %	25 %	25 %	478459949
11106	NC_020968	CTA	2	6	564474	564479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459949
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11109	NC_020968	CCT	2	6	564568	564573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459949
11110	NC_020968	CAC	2	6	564575	564580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459949
11111	NC_020968	AGAA	2	8	564644	564651	75 %	0 %	25 %	0 %	478459949
11112	NC_020968	CAAA	2	8	564768	564775	75 %	0 %	0 %	25 %	478459950
11113	NC_020968	GA	3	6	564780	564785	50 %	0 %	50 %	0 %	478459950
11114	NC_020968	CCAT	2	8	564791	564798	25 %	25 %	0 %	50 %	478459950
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11120	NC_020968	CAT	2	6	564972	564977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459950
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