MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_020968	AGC	2	6	534368	534373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459916
10503	NC_020968	ATC	2	6	534443	534448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459916
10504	NC_020968	GAC	2	6	534459	534464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459916
10505	NC_020968	AGC	3	9	534497	534505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459916
10506	NC_020968	AAC	2	6	534509	534514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459916
10507	NC_020968	TGAT	2	8	534532	534539	25 %	50 %	25 %	0 %	478459916
10508	NC_020968	TCA	2	6	534688	534693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459917
10509	NC_020968	CT	3	6	534727	534732	0 %	50 %	0 %	50 %	478459917
10510	NC_020968	TAA	2	6	534756	534761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459917
10511	NC_020968	AAG	2	6	534805	534810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459917
10512	NC_020968	TTC	2	6	534813	534818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459917
10513	NC_020968	TCG	2	6	534820	534825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459917
10514	NC_020968	TCCTC	2	10	534835	534844	0 %	40 %	0 %	60 %	478459917
10515	NC_020968	TA	3	6	534926	534931	50 %	50 %	0 %	0 %	478459917
10516	NC_020968	CAA	2	6	535025	535030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459917
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10518	NC_020968	CTT	2	6	535070	535075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459917
10519	NC_020968	TTC	2	6	535081	535086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459917
10520	NC_020968	AGA	2	6	535095	535100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459917
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10522	NC_020968	C	7	7	535200	535206	0 %	0 %	0 %	100 %	478459917
10523	NC_020968	A	6	6	535244	535249	100 %	0 %	0 %	0 %	478459917
10524	NC_020968	CT	3	6	535512	535517	0 %	50 %	0 %	50 %	478459918
10525	NC_020968	TCT	2	6	535563	535568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459918
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10541	NC_020968	TGACA	2	10	536293	536302	40 %	20 %	20 %	20 %	478459919
10542	NC_020968	GT	3	6	536322	536327	0 %	50 %	50 %	0 %	478459919
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10547	NC_020968	CGA	2	6	536564	536569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459919
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10553	NC_020968	AGAA	2	8	536757	536764	75 %	0 %	25 %	0 %	478459919
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10603	NC_020968	TC	3	6	539360	539365	0 %	50 %	0 %	50 %	478459922
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10607	NC_020968	TCT	2	6	539537	539542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459923
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10611	NC_020968	CA	3	6	539854	539859	50 %	0 %	0 %	50 %	478459923
10612	NC_020968	CTT	2	6	539868	539873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459923
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10614	NC_020968	CT	3	6	539913	539918	0 %	50 %	0 %	50 %	478459923
10615	NC_020968	CTTT	2	8	539977	539984	0 %	75 %	0 %	25 %	478459923
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