MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020964	ATT	2	6	208281	208286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474050
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4004	NC_020964	AAC	2	6	208353	208358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474050
4005	NC_020964	A	6	6	208378	208383	100 %	0 %	0 %	0 %	478474050
4006	NC_020964	TTA	2	6	208445	208450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474050
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4012	NC_020964	TTA	2	6	208829	208834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474051
4013	NC_020964	ATG	2	6	208841	208846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474051
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4015	NC_020964	GGA	2	6	208966	208971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474051
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4018	NC_020964	GC	3	6	209061	209066	0 %	0 %	50 %	50 %	478474051
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4021	NC_020964	GAA	2	6	209299	209304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474051
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4057	NC_020964	CT	3	6	210976	210981	0 %	50 %	0 %	50 %	478474053
4058	NC_020964	CTT	2	6	211002	211007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474053
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4107	NC_020964	GAT	2	6	213572	213577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474054
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4109	NC_020964	TTTA	2	8	213584	213591	25 %	75 %	0 %	0 %	478474054
4110	NC_020964	ATT	2	6	213622	213627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474055
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4123	NC_020964	GGA	2	6	214118	214123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474055
4124	NC_020964	T	6	6	214186	214191	0 %	100 %	0 %	0 %	478474055
4125	NC_020964	AACG	2	8	214234	214241	50 %	0 %	25 %	25 %	478474055
4126	NC_020964	TCA	2	6	214277	214282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474055
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4128	NC_020964	CCAT	2	8	214325	214332	25 %	25 %	0 %	50 %	478474055
4129	NC_020964	GA	3	6	214343	214348	50 %	0 %	50 %	0 %	478474055
4130	NC_020964	T	6	6	214363	214368	0 %	100 %	0 %	0 %	478474055
4131	NC_020964	AGG	2	6	214387	214392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474055
4132	NC_020964	CATT	2	8	214409	214416	25 %	50 %	0 %	25 %	478474055
4133	NC_020964	AGA	2	6	214443	214448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474055
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4136	NC_020964	GCT	2	6	214568	214573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474055
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4140	NC_020964	CT	3	6	214816	214821	0 %	50 %	0 %	50 %	478474055
4141	NC_020964	CT	3	6	214824	214829	0 %	50 %	0 %	50 %	478474055
4142	NC_020964	AGC	2	6	214831	214836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474055
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4148	NC_020964	TAGA	2	8	215076	215083	50 %	25 %	25 %	0 %	478474055
4149	NC_020964	CTTGT	2	10	215154	215163	0 %	60 %	20 %	20 %	478474055
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4154	NC_020964	CTGGAT	2	12	215481	215492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478474055
4155	NC_020964	GTA	2	6	215706	215711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474055
4156	NC_020964	ACC	2	6	215720	215725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478474055
4157	NC_020964	CTTG	2	8	215748	215755	0 %	50 %	25 %	25 %	478474055
4158	NC_020964	GAAATA	2	12	215804	215815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478474055
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4162	NC_020964	TTTCT	2	10	216004	216013	0 %	80 %	0 %	20 %	478474055
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4231	NC_020964	TA	3	6	219827	219832	50 %	50 %	0 %	0 %	478474059
4232	NC_020964	CTG	2	6	219869	219874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474059
4233	NC_020964	CTT	2	6	219890	219895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474059
4234	NC_020964	TCA	2	6	219913	219918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474059
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4236	NC_020964	ATG	2	6	220424	220429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474060
4237	NC_020964	GAT	2	6	220482	220487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474060
4238	NC_020964	AGA	2	6	220501	220506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474060
4239	NC_020964	AAC	2	6	220526	220531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474060
4240	NC_020964	CTC	2	6	220574	220579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478474060
4241	NC_020964	T	7	7	220594	220600	0 %	100 %	0 %	0 %	478474060
4242	NC_020964	A	6	6	220604	220609	100 %	0 %	0 %	0 %	478474060
4243	NC_020964	CTC	2	6	220619	220624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478474060
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4245	NC_020964	ATT	2	6	220641	220646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474060
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4360	NC_020964	A	7	7	225390	225396	100 %	0 %	0 %	0 %	478474064
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4492	NC_020964	AATG	2	8	232321	232328	50 %	25 %	25 %	0 %	478474070
4493	NC_020964	ATT	2	6	232370	232375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474070
4494	NC_020964	ATG	2	6	232416	232421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474071
4495	NC_020964	CAA	2	6	232422	232427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474071
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4497	NC_020964	A	6	6	232522	232527	100 %	0 %	0 %	0 %	478474071
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4500	NC_020964	AGG	2	6	232787	232792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474071

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