MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/8200/07 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020945	TG	3	6	508923	508928	0 %	50 %	50 %	0 %	478470713
10003	NC_020945	GAA	2	6	508967	508972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470713
10004	NC_020945	CGAAT	2	10	509062	509071	40 %	20 %	20 %	20 %	478470713
10005	NC_020945	ACT	2	6	509072	509077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470713
10006	NC_020945	TCT	2	6	509168	509173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470713
10007	NC_020945	CTA	2	6	509244	509249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470713
10008	NC_020945	AGC	2	6	509263	509268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470713
10009	NC_020945	AAG	2	6	509301	509306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470713
10010	NC_020945	AGC	2	6	509325	509330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470713
10011	NC_020945	CAA	2	6	509337	509342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478470713
10012	NC_020945	ATT	2	6	509344	509349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478470713
10013	NC_020945	ACT	2	6	509432	509437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470713
10014	NC_020945	TTA	2	6	509438	509443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478470713
10015	NC_020945	ACG	2	6	509504	509509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470713
10016	NC_020945	TACT	2	8	509598	509605	25 %	50 %	0 %	25 %	478470713
10017	NC_020945	GTT	2	6	509630	509635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478470713
10018	NC_020945	TCC	2	6	509656	509661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478470713
10019	NC_020945	AGA	2	6	509785	509790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470713
10020	NC_020945	CAA	3	9	509820	509828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478470713
10021	NC_020945	GCTGTT	2	12	509837	509848	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478470713
10022	NC_020945	ACT	2	6	509876	509881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470713
10023	NC_020945	CTT	2	6	509910	509915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470713
10024	NC_020945	AGC	2	6	509994	509999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470713
10025	NC_020945	CTT	2	6	510003	510008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470713
10026	NC_020945	CAG	2	6	510087	510092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470713
10027	NC_020945	TG	3	6	510239	510244	0 %	50 %	50 %	0 %	478470713
10028	NC_020945	ATC	2	6	510259	510264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470713
10029	NC_020945	T	6	6	510380	510385	0 %	100 %	0 %	0 %	478470713
10030	NC_020945	T	6	6	510391	510396	0 %	100 %	0 %	0 %	478470713
10031	NC_020945	AGCTA	2	10	510433	510442	40 %	20 %	20 %	20 %	478470713
10032	NC_020945	TGA	2	6	510543	510548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478470713
10033	NC_020945	ACC	2	6	510843	510848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478470714
10034	NC_020945	TCTT	2	8	510856	510863	0 %	75 %	0 %	25 %	478470714
10035	NC_020945	ACA	2	6	510930	510935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478470714
10036	NC_020945	ACT	2	6	510936	510941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470714
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10038	NC_020945	AGC	2	6	510963	510968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470714
10039	NC_020945	T	7	7	510980	510986	0 %	100 %	0 %	0 %	478470714
10040	NC_020945	A	6	6	511321	511326	100 %	0 %	0 %	0 %	478470715
10041	NC_020945	CTG	2	6	511357	511362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478470715
10042	NC_020945	CCT	2	6	511364	511369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478470715
10043	NC_020945	TC	3	6	511462	511467	0 %	50 %	0 %	50 %	478470715
10044	NC_020945	CTT	2	6	511493	511498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470715
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10047	NC_020945	TGC	3	9	511605	511613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478470716
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10050	NC_020945	ATG	2	6	511766	511771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478470716
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10052	NC_020945	CTT	2	6	511835	511840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470716
10053	NC_020945	ACA	2	6	511864	511869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478470716
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10055	NC_020945	CTC	2	6	511910	511915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478470716
10056	NC_020945	AAG	2	6	511944	511949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470716
10057	NC_020945	GTA	2	6	511977	511982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478470716
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10059	NC_020945	GAA	2	6	512002	512007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470716
10060	NC_020945	CT	3	6	512061	512066	0 %	50 %	0 %	50 %	478470716
10061	NC_020945	CTT	2	6	512245	512250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470716
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10063	NC_020945	A	6	6	512275	512280	100 %	0 %	0 %	0 %	478470716
10064	NC_020945	TTCT	2	8	512292	512299	0 %	75 %	0 %	25 %	478470716
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10068	NC_020945	ATC	2	6	512453	512458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478470716
10069	NC_020945	ACGAC	2	10	512538	512547	40 %	0 %	20 %	40 %	478470716
10070	NC_020945	CTCTT	2	10	512621	512630	0 %	60 %	0 %	40 %	478470716
10071	NC_020945	TCC	2	6	512675	512680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478470716
10072	NC_020945	CCGC	2	8	512704	512711	0 %	0 %	25 %	75 %	478470716
10073	NC_020945	GAG	2	6	512728	512733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478470716
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10085	NC_020945	TGC	2	6	513831	513836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478470717
10086	NC_020945	TGAACT	2	12	513837	513848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478470717
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10088	NC_020945	CAA	2	6	514329	514334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478470718
10089	NC_020945	ATA	2	6	514363	514368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478470718
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10091	NC_020945	TAA	2	6	514503	514508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478470718
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10094	NC_020945	GA	3	6	514616	514621	50 %	0 %	50 %	0 %	478470718
10095	NC_020945	ATCC	2	8	514623	514630	25 %	25 %	0 %	50 %	478470718
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10099	NC_020945	TCT	2	6	514723	514728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478470718
10100	NC_020945	A	6	6	514773	514778	100 %	0 %	0 %	0 %	478470718
10101	NC_020945	GAA	2	6	514793	514798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470718
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10104	NC_020945	AAT	2	6	514908	514913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478470718
10105	NC_020945	CAG	2	6	515048	515053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470718
10106	NC_020945	TAATTC	2	12	515159	515170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478470718
10107	NC_020945	CGA	2	6	515181	515186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470718
10108	NC_020945	T	6	6	515224	515229	0 %	100 %	0 %	0 %	478470718
10109	NC_020945	TC	3	6	515288	515293	0 %	50 %	0 %	50 %	478470718
10110	NC_020945	A	6	6	515341	515346	100 %	0 %	0 %	0 %	478470718
10111	NC_020945	AAG	2	6	515372	515377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470718
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10115	NC_020945	TGCAA	2	10	515490	515499	40 %	20 %	20 %	20 %	478470718
10116	NC_020945	CTG	2	6	515582	515587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478470718
10117	NC_020945	GCA	2	6	515630	515635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478470718
10118	NC_020945	AAG	2	6	515648	515653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478470718
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10120	NC_020945	TGT	2	6	515665	515670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478470718
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10241	NC_020945	TCC	2	6	523228	523233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478470722
10242	NC_020945	GAT	2	6	523261	523266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478470722
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10259	NC_020945	ATTC	2	8	524114	524121	25 %	50 %	0 %	25 %	478470724
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