MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020943	AAG	2	6	661729	661734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455528
13003	NC_020943	AGC	2	6	661808	661813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455528
13004	NC_020943	TGA	2	6	661855	661860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455528
13005	NC_020943	GCA	2	6	661863	661868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455528
13006	NC_020943	A	7	7	661868	661874	100 %	0 %	0 %	0 %	478455528
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13009	NC_020943	GTC	2	6	662087	662092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455529
13010	NC_020943	GA	3	6	662110	662115	50 %	0 %	50 %	0 %	478455529
13011	NC_020943	TCA	2	6	662157	662162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455529
13012	NC_020943	GCGT	2	8	662186	662193	0 %	25 %	50 %	25 %	478455529
13013	NC_020943	TGAT	2	8	662364	662371	25 %	50 %	25 %	0 %	478455529
13014	NC_020943	GCT	2	6	662444	662449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455529
13015	NC_020943	TGG	2	6	662485	662490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455529
13016	NC_020943	ATG	2	6	662519	662524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455529
13017	NC_020943	ATGC	2	8	662543	662550	25 %	25 %	25 %	25 %	478455529
13018	NC_020943	A	8	8	662650	662657	100 %	0 %	0 %	0 %	478455529
13019	NC_020943	TGA	2	6	662692	662697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455529
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13021	NC_020943	GCT	2	6	662813	662818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455529
13022	NC_020943	TCT	2	6	662819	662824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455529
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13026	NC_020943	ATTG	2	8	663031	663038	25 %	50 %	25 %	0 %	478455529
13027	NC_020943	TCA	2	6	663075	663080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455529
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13029	NC_020943	GCTAC	2	10	663144	663153	20 %	20 %	20 %	40 %	478455529
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13033	NC_020943	AATA	2	8	663500	663507	75 %	25 %	0 %	0 %	478455530
13034	NC_020943	CACG	2	8	663525	663532	25 %	0 %	25 %	50 %	478455530
13035	NC_020943	TG	3	6	663557	663562	0 %	50 %	50 %	0 %	478455530
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13040	NC_020943	CT	3	6	663720	663725	0 %	50 %	0 %	50 %	478455530
13041	NC_020943	CTG	2	6	663759	663764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455530
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13053	NC_020943	AT	3	6	664333	664338	50 %	50 %	0 %	0 %	478455530
13054	NC_020943	CT	3	6	664342	664347	0 %	50 %	0 %	50 %	478455530
13055	NC_020943	GAA	2	6	664379	664384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455530
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13057	NC_020943	CGA	2	6	664412	664417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455530
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13069	NC_020943	TGAG	2	8	664929	664936	25 %	25 %	50 %	0 %	478455530
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13104	NC_020943	TC	3	6	666765	666770	0 %	50 %	0 %	50 %	478455531
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13230	NC_020943	AATC	2	8	672499	672506	50 %	25 %	0 %	25 %	478455534
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13239	NC_020943	TATCG	2	10	672781	672790	20 %	40 %	20 %	20 %	478455534
13240	NC_020943	TCC	2	6	672847	672852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455534
13241	NC_020943	CTA	2	6	672903	672908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455534
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