MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020943	GGA	2	6	282649	282654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455180
5503	NC_020943	AGA	2	6	282696	282701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455180
5504	NC_020943	GAG	2	6	282776	282781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455180
5505	NC_020943	GTT	2	6	282786	282791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455180
5506	NC_020943	TTC	2	6	282853	282858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5507	NC_020943	TCT	2	6	282937	282942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5508	NC_020943	AGT	2	6	282951	282956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455180
5509	NC_020943	GCT	2	6	282983	282988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455180
5510	NC_020943	TTC	2	6	283004	283009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5511	NC_020943	CCA	2	6	283015	283020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455180
5512	NC_020943	CT	3	6	283027	283032	0 %	50 %	0 %	50 %	478455180
5513	NC_020943	TAT	2	6	283046	283051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455180
5514	NC_020943	ACA	2	6	283060	283065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455180
5515	NC_020943	CT	3	6	283139	283144	0 %	50 %	0 %	50 %	478455180
5516	NC_020943	ATA	2	6	283182	283187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455180
5517	NC_020943	CT	3	6	283278	283283	0 %	50 %	0 %	50 %	478455180
5518	NC_020943	TCT	2	6	283318	283323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5519	NC_020943	GTA	2	6	283410	283415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455180
5520	NC_020943	AC	3	6	283489	283494	50 %	0 %	0 %	50 %	478455180
5521	NC_020943	TCT	2	6	283495	283500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5522	NC_020943	ATG	2	6	283556	283561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455180
5523	NC_020943	CTA	2	6	283652	283657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455180
5524	NC_020943	CTT	2	6	283715	283720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455180
5525	NC_020943	CAG	2	6	283833	283838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455180
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5527	NC_020943	TAC	2	6	283911	283916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455180
5528	NC_020943	GCT	2	6	283961	283966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455180
5529	NC_020943	GAA	2	6	284007	284012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455180
5530	NC_020943	ATA	2	6	284054	284059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455180
5531	NC_020943	CGTT	2	8	284061	284068	0 %	50 %	25 %	25 %	478455180
5532	NC_020943	ATTC	2	8	284070	284077	25 %	50 %	0 %	25 %	478455180
5533	NC_020943	CAT	2	6	284389	284394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455181
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5537	NC_020943	GT	3	6	284502	284507	0 %	50 %	50 %	0 %	478455181
5538	NC_020943	CTG	2	6	284558	284563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455181
5539	NC_020943	CCA	2	6	284683	284688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455181
5540	NC_020943	CAC	2	6	284874	284879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455181
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5542	NC_020943	CTCC	2	8	284956	284963	0 %	25 %	0 %	75 %	478455181
5543	NC_020943	AAGC	2	8	284978	284985	50 %	0 %	25 %	25 %	478455181
5544	NC_020943	ATG	2	6	284995	285000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455181
5545	NC_020943	T	6	6	285051	285056	0 %	100 %	0 %	0 %	478455181
5546	NC_020943	CTC	2	6	285057	285062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455181
5547	NC_020943	GAT	2	6	285106	285111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455181
5548	NC_020943	A	7	7	285112	285118	100 %	0 %	0 %	0 %	478455181
5549	NC_020943	AG	3	6	285179	285184	50 %	0 %	50 %	0 %	478455181
5550	NC_020943	CTT	2	6	285482	285487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455182
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5553	NC_020943	GTC	2	6	285592	285597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455182
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5555	NC_020943	ACT	2	6	285639	285644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455182
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5557	NC_020943	TGC	2	6	285744	285749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455182
5558	NC_020943	T	7	7	285754	285760	0 %	100 %	0 %	0 %	478455182
5559	NC_020943	CTCCTA	2	12	285761	285772	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478455182
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5562	NC_020943	ATC	2	6	285986	285991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455182
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5564	NC_020943	TTCGA	2	10	286015	286024	20 %	40 %	20 %	20 %	478455182
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5573	NC_020943	T	7	7	286334	286340	0 %	100 %	0 %	0 %	478455183
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5587	NC_020943	TTTA	2	8	286792	286799	25 %	75 %	0 %	0 %	478455183
5588	NC_020943	A	8	8	286880	286887	100 %	0 %	0 %	0 %	478455183
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5993	NC_020943	TCG	2	6	307458	307463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455204
5994	NC_020943	TTG	2	6	307551	307556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455204
5995	NC_020943	TTG	2	6	307626	307631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455204
5996	NC_020943	TA	3	6	307727	307732	50 %	50 %	0 %	0 %	478455204
5997	NC_020943	TAA	2	6	307777	307782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455204
5998	NC_020943	TAA	2	6	307807	307812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455204
5999	NC_020943	AAC	2	6	307825	307830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455204
6000	NC_020943	TTG	2	6	308025	308030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455204

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