MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020943	CAC	2	6	257698	257703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455159
5003	NC_020943	GCT	2	6	257783	257788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455159
5004	NC_020943	TCA	2	6	257831	257836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455159
5005	NC_020943	TCT	2	6	257866	257871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455159
5006	NC_020943	TTC	2	6	257880	257885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455159
5007	NC_020943	TGC	2	6	257939	257944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455159
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5009	NC_020943	TAAT	2	8	257955	257962	50 %	50 %	0 %	0 %	478455159
5010	NC_020943	A	6	6	257963	257968	100 %	0 %	0 %	0 %	478455159
5011	NC_020943	AGA	2	6	257980	257985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455159
5012	NC_020943	A	8	8	258206	258213	100 %	0 %	0 %	0 %	478455160
5013	NC_020943	TCA	2	6	258224	258229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455160
5014	NC_020943	GAT	2	6	258250	258255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455160
5015	NC_020943	GGC	2	6	258314	258319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455160
5016	NC_020943	TTC	2	6	258330	258335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455160
5017	NC_020943	ATT	2	6	258353	258358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455160
5018	NC_020943	CT	3	6	258386	258391	0 %	50 %	0 %	50 %	478455160
5019	NC_020943	AGG	2	6	258463	258468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455160
5020	NC_020943	TAC	2	6	258503	258508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455160
5021	NC_020943	CTT	2	6	258538	258543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455160
5022	NC_020943	TAA	2	6	258700	258705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455160
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5028	NC_020943	TC	3	6	259126	259131	0 %	50 %	0 %	50 %	478455160
5029	NC_020943	T	6	6	259136	259141	0 %	100 %	0 %	0 %	478455160
5030	NC_020943	TCT	3	9	259149	259157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455160
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5040	NC_020943	TGG	2	6	259553	259558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455160
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5052	NC_020943	CAA	2	6	260381	260386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455162
5053	NC_020943	TGCAA	2	10	260392	260401	40 %	20 %	20 %	20 %	478455162
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5059	NC_020943	CTGG	2	8	260600	260607	0 %	25 %	50 %	25 %	478455162
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5095	NC_020943	ATGA	2	8	262130	262137	50 %	25 %	25 %	0 %	478455163
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5119	NC_020943	A	6	6	263381	263386	100 %	0 %	0 %	0 %	478455163
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5121	NC_020943	CCTTT	2	10	263438	263447	0 %	60 %	0 %	40 %	478455163
5122	NC_020943	AGA	2	6	263476	263481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455163
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5492	NC_020943	CTG	2	6	281952	281957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455180
5493	NC_020943	GAA	2	6	281987	281992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455180
5494	NC_020943	TATC	2	8	282062	282069	25 %	50 %	0 %	25 %	478455180
5495	NC_020943	AGCT	2	8	282083	282090	25 %	25 %	25 %	25 %	478455180
5496	NC_020943	CTG	2	6	282249	282254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455180
5497	NC_020943	ACG	2	6	282288	282293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455180
5498	NC_020943	TAA	2	6	282351	282356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455180
5499	NC_020943	ATA	2	6	282358	282363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455180
5500	NC_020943	ATA	2	6	282413	282418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455180

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