MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 20362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020940	TGC	2	6	584113	584118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475286
11503	NC_020940	CGT	2	6	584149	584154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475286
11504	NC_020940	CTA	2	6	584181	584186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475286
11505	NC_020940	AGC	2	6	584269	584274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475286
11506	NC_020940	ATA	2	6	584291	584296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475286
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11508	NC_020940	TGT	2	6	584380	584385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478475286
11509	NC_020940	CTT	2	6	584394	584399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475286
11510	NC_020940	TGG	2	6	584448	584453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478475286
11511	NC_020940	ATG	2	6	584471	584476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478475286
11512	NC_020940	CTG	2	6	584494	584499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475286
11513	NC_020940	CT	3	6	584559	584564	0 %	50 %	0 %	50 %	478475286
11514	NC_020940	CAT	2	6	584592	584597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475286
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11516	NC_020940	CGA	3	9	584625	584633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475286
11517	NC_020940	CTTT	2	8	584695	584702	0 %	75 %	0 %	25 %	478475286
11518	NC_020940	CATC	2	8	584717	584724	25 %	25 %	0 %	50 %	478475286
11519	NC_020940	GAG	2	6	584739	584744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478475286
11520	NC_020940	GT	3	6	584755	584760	0 %	50 %	50 %	0 %	478475286
11521	NC_020940	TAAA	2	8	584772	584779	75 %	25 %	0 %	0 %	478475286
11522	NC_020940	GAA	2	6	585036	585041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475287
11523	NC_020940	TAT	2	6	585148	585153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478475287
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11525	NC_020940	ATC	2	6	585219	585224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475287
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11527	NC_020940	T	6	6	585432	585437	0 %	100 %	0 %	0 %	478475288
11528	NC_020940	ATTTC	2	10	585492	585501	20 %	60 %	0 %	20 %	478475288
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11530	NC_020940	CTT	2	6	585532	585537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475288
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11533	NC_020940	TTCTC	2	10	585729	585738	0 %	60 %	0 %	40 %	478475288
11534	NC_020940	T	6	6	585744	585749	0 %	100 %	0 %	0 %	478475288
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11539	NC_020940	TCAT	2	8	585935	585942	25 %	50 %	0 %	25 %	478475288
11540	NC_020940	TTC	2	6	585949	585954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475288
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11542	NC_020940	CTTC	2	8	586104	586111	0 %	50 %	0 %	50 %	478475288
11543	NC_020940	CAG	3	9	586119	586127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475288
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11546	NC_020940	CAA	2	6	586401	586406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478475288
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11556	NC_020940	CAG	2	6	586784	586789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475289
11557	NC_020940	CAG	2	6	586811	586816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475289
11558	NC_020940	TAT	2	6	586838	586843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478475289
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11560	NC_020940	T	8	8	586908	586915	0 %	100 %	0 %	0 %	478475289
11561	NC_020940	ATT	3	9	586952	586960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478475290
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11622	NC_020940	ACG	2	6	590144	590149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475295
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11624	NC_020940	TCTA	2	8	590477	590484	25 %	50 %	0 %	25 %	478475295
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11988	NC_020940	GATA	2	8	609721	609728	50 %	25 %	25 %	0 %	478475323
11989	NC_020940	AGT	2	6	609742	609747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478475323
11990	NC_020940	TTC	2	6	609914	609919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475323
11991	NC_020940	TCA	2	6	609936	609941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475323
11992	NC_020940	ACA	2	6	609973	609978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478475323
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11995	NC_020940	TGA	2	6	610107	610112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478475323
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11998	NC_020940	CACC	2	8	610211	610218	25 %	0 %	0 %	75 %	478475323
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12000	NC_020940	TTG	2	6	610311	610316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478475324

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