MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020935	CAA	2	6	661386	661391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452817
13002	NC_020935	GCT	2	6	661395	661400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452817
13003	NC_020935	CT	3	6	661399	661404	0 %	50 %	0 %	50 %	478452817
13004	NC_020935	ACAG	2	8	661412	661419	50 %	0 %	25 %	25 %	478452817
13005	NC_020935	TCC	2	6	661586	661591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452817
13006	NC_020935	AAGC	2	8	661660	661667	50 %	0 %	25 %	25 %	478452817
13007	NC_020935	GA	3	6	661678	661683	50 %	0 %	50 %	0 %	478452817
13008	NC_020935	GAA	2	6	661692	661697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452817
13009	NC_020935	GAA	2	6	661740	661745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452817
13010	NC_020935	TTA	2	6	661850	661855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452817
13011	NC_020935	GACA	2	8	661985	661992	50 %	0 %	25 %	25 %	478452818
13012	NC_020935	CTT	2	6	662008	662013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452818
13013	NC_020935	CTC	2	6	662036	662041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452818
13014	NC_020935	CTTT	3	12	662062	662073	0 %	75 %	0 %	25 %	478452818
13015	NC_020935	AAC	2	6	662091	662096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452818
13016	NC_020935	GAAAA	2	10	662146	662155	80 %	0 %	20 %	0 %	478452818
13017	NC_020935	T	6	6	662229	662234	0 %	100 %	0 %	0 %	478452818
13018	NC_020935	GAT	2	6	662253	662258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452818
13019	NC_020935	TTC	2	6	662295	662300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452818
13020	NC_020935	TA	3	6	662350	662355	50 %	50 %	0 %	0 %	478452818
13021	NC_020935	AACA	2	8	662554	662561	75 %	0 %	0 %	25 %	478452818
13022	NC_020935	TCT	2	6	662574	662579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452818
13023	NC_020935	TC	4	8	662647	662654	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13024	NC_020935	CT	4	8	662672	662679	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13025	NC_020935	CTT	2	6	662690	662695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452818
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13027	NC_020935	GATGG	2	10	662904	662913	20 %	20 %	60 %	0 %	478452818
13028	NC_020935	CT	3	6	662917	662922	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13029	NC_020935	TACTT	2	10	663063	663072	20 %	60 %	0 %	20 %	478452818
13030	NC_020935	CTG	2	6	663076	663081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452818
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13032	NC_020935	TTA	2	6	663124	663129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452818
13033	NC_020935	TC	3	6	663147	663152	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13034	NC_020935	TC	3	6	663190	663195	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13035	NC_020935	AGG	2	6	663198	663203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452818
13036	NC_020935	ATT	2	6	663218	663223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452818
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13038	NC_020935	GGTTG	2	10	663256	663265	0 %	40 %	60 %	0 %	478452818
13039	NC_020935	CTT	2	6	663326	663331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452818
13040	NC_020935	CT	3	6	663343	663348	0 %	50 %	0 %	50 %	478452818
13041	NC_020935	TGA	2	6	663426	663431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452818
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13044	NC_020935	TCC	2	6	663525	663530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452818
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13046	NC_020935	CAT	2	6	663630	663635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452818
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13052	NC_020935	AAG	2	6	664035	664040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452819
13053	NC_020935	AGC	2	6	664074	664079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452819
13054	NC_020935	TCT	2	6	664099	664104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452819
13055	NC_020935	TAA	2	6	664134	664139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452819
13056	NC_020935	ATA	2	6	664172	664177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452819
13057	NC_020935	TCT	2	6	664198	664203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452819
13058	NC_020935	GAA	2	6	664237	664242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452819
13059	NC_020935	AAG	2	6	664253	664258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452819
13060	NC_020935	CTG	2	6	664284	664289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452819
13061	NC_020935	CTA	2	6	664349	664354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452819
13062	NC_020935	TCA	2	6	664360	664365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452819
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13064	NC_020935	GA	3	6	664423	664428	50 %	0 %	50 %	0 %	478452819
13065	NC_020935	TCA	2	6	664429	664434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452819
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13073	NC_020935	TGC	2	6	664740	664745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452819
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13094	NC_020935	GATA	2	8	665861	665868	50 %	25 %	25 %	0 %	478452819
13095	NC_020935	TAG	2	6	665880	665885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452819
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13101	NC_020935	AC	3	6	666031	666036	50 %	0 %	0 %	50 %	478452819
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13104	NC_020935	TC	3	6	666062	666067	0 %	50 %	0 %	50 %	478452819
13105	NC_020935	ATA	2	6	666101	666106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452819
13106	NC_020935	AATA	2	8	666123	666130	75 %	25 %	0 %	0 %	478452819
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13109	NC_020935	A	6	6	666318	666323	100 %	0 %	0 %	0 %	478452819
13110	NC_020935	ATC	2	6	666351	666356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452819
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13113	NC_020935	T	9	9	666535	666543	0 %	100 %	0 %	0 %	478452819
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13120	NC_020935	CT	3	6	666949	666954	0 %	50 %	0 %	50 %	478452820
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