MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020935	ATC	2	6	561087	561092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452717
11003	NC_020935	CT	3	6	561107	561112	0 %	50 %	0 %	50 %	478452717
11004	NC_020935	CAT	2	6	561119	561124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452717
11005	NC_020935	AGA	2	6	561153	561158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452717
11006	NC_020935	CAA	2	6	561176	561181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452717
11007	NC_020935	TGA	2	6	561187	561192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452717
11008	NC_020935	AGA	2	6	561261	561266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452717
11009	NC_020935	AAT	2	6	561278	561283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452717
11010	NC_020935	A	6	6	561328	561333	100 %	0 %	0 %	0 %	478452717
11011	NC_020935	CTT	2	6	561350	561355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452717
11012	NC_020935	ACAA	2	8	561390	561397	75 %	0 %	0 %	25 %	478452717
11013	NC_020935	ATC	2	6	561399	561404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452717
11014	NC_020935	TC	3	6	561418	561423	0 %	50 %	0 %	50 %	478452717
11015	NC_020935	T	6	6	561437	561442	0 %	100 %	0 %	0 %	478452717
11016	NC_020935	CCCA	2	8	561451	561458	25 %	0 %	0 %	75 %	478452717
11017	NC_020935	CT	3	6	561621	561626	0 %	50 %	0 %	50 %	478452718
11018	NC_020935	GAT	2	6	561667	561672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452718
11019	NC_020935	AAC	2	6	561685	561690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452718
11020	NC_020935	CAG	2	6	561761	561766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452718
11021	NC_020935	TCA	2	6	561770	561775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452718
11022	NC_020935	CAT	2	6	561850	561855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452718
11023	NC_020935	CA	3	6	561948	561953	50 %	0 %	0 %	50 %	478452718
11024	NC_020935	AAT	2	6	561982	561987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452718
11025	NC_020935	GAT	2	6	561999	562004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452718
11026	NC_020935	C	6	6	562024	562029	0 %	0 %	0 %	100 %	478452718
11027	NC_020935	TCA	2	6	562031	562036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452718
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11032	NC_020935	T	6	6	562303	562308	0 %	100 %	0 %	0 %	478452718
11033	NC_020935	ATCA	2	8	562372	562379	50 %	25 %	0 %	25 %	478452718
11034	NC_020935	CTA	2	6	562485	562490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452718
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11037	NC_020935	AGGTA	2	10	562710	562719	40 %	20 %	40 %	0 %	478452718
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11041	NC_020935	CGTC	2	8	562933	562940	0 %	25 %	25 %	50 %	478452718
11042	NC_020935	TTG	2	6	563158	563163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452719
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11052	NC_020935	TCC	2	6	563727	563732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452720
11053	NC_020935	GAA	2	6	563757	563762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452720
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11055	NC_020935	CGA	2	6	563975	563980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452720
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11058	NC_020935	GAG	2	6	564119	564124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452720
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11060	NC_020935	ACG	2	6	564387	564392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452720
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11063	NC_020935	TCA	2	6	564511	564516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452720
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11065	NC_020935	TCT	2	6	564682	564687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452720
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11088	NC_020935	TAA	2	6	565770	565775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452722
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11092	NC_020935	AAT	2	6	566058	566063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452722
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11102	NC_020935	C	6	6	566721	566726	0 %	0 %	0 %	100 %	478452722
11103	NC_020935	A	7	7	566736	566742	100 %	0 %	0 %	0 %	478452722
11104	NC_020935	CTT	2	6	566748	566753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452722
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11106	NC_020935	CACT	2	8	566805	566812	25 %	25 %	0 %	50 %	478452722
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11109	NC_020935	A	6	6	566926	566931	100 %	0 %	0 %	0 %	478452722
11110	NC_020935	AAGCA	2	10	566938	566947	60 %	0 %	20 %	20 %	478452722
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11487	NC_020935	AGA	2	6	585022	585027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452740
11488	NC_020935	TTC	2	6	585051	585056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452740
11489	NC_020935	ATA	2	6	585120	585125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452741
11490	NC_020935	AG	3	6	585137	585142	50 %	0 %	50 %	0 %	478452741
11491	NC_020935	ATT	2	6	585185	585190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452741
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11495	NC_020935	AGC	2	6	585383	585388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452741
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