MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020935	ATC	2	6	510145	510150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452669
10002	NC_020935	T	6	6	510266	510271	0 %	100 %	0 %	0 %	478452669
10003	NC_020935	T	6	6	510277	510282	0 %	100 %	0 %	0 %	478452669
10004	NC_020935	AGCTA	2	10	510319	510328	40 %	20 %	20 %	20 %	478452669
10005	NC_020935	TGA	2	6	510429	510434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452669
10006	NC_020935	ACC	2	6	510729	510734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452670
10007	NC_020935	TCTT	2	8	510742	510749	0 %	75 %	0 %	25 %	478452670
10008	NC_020935	ACA	2	6	510816	510821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452670
10009	NC_020935	ACT	2	6	510822	510827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452670
10010	NC_020935	ACA	2	6	510835	510840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452670
10011	NC_020935	AGC	2	6	510849	510854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452670
10012	NC_020935	T	7	7	510866	510872	0 %	100 %	0 %	0 %	478452670
10013	NC_020935	A	6	6	511204	511209	100 %	0 %	0 %	0 %	478452671
10014	NC_020935	CTG	2	6	511240	511245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452671
10015	NC_020935	CCT	2	6	511247	511252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452671
10016	NC_020935	TC	3	6	511345	511350	0 %	50 %	0 %	50 %	478452671
10017	NC_020935	CTT	2	6	511376	511381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452671
10018	NC_020935	CAC	2	6	511390	511395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452671
10019	NC_020935	GAA	2	6	511413	511418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452671
10020	NC_020935	TGC	3	9	511488	511496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452672
10021	NC_020935	CTC	2	6	511510	511515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452672
10022	NC_020935	CTT	2	6	511643	511648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452672
10023	NC_020935	ATG	2	6	511649	511654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452672
10024	NC_020935	AGA	2	6	511693	511698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452672
10025	NC_020935	CTT	2	6	511718	511723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452672
10026	NC_020935	ACA	2	6	511747	511752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452672
10027	NC_020935	TAA	2	6	511787	511792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452672
10028	NC_020935	CTC	2	6	511793	511798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452672
10029	NC_020935	AAG	2	6	511827	511832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452672
10030	NC_020935	GTA	2	6	511860	511865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452672
10031	NC_020935	AG	3	6	511879	511884	50 %	0 %	50 %	0 %	478452672
10032	NC_020935	GAA	2	6	511885	511890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452672
10033	NC_020935	CT	3	6	511944	511949	0 %	50 %	0 %	50 %	478452672
10034	NC_020935	CTT	2	6	512128	512133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452672
10035	NC_020935	T	6	6	512132	512137	0 %	100 %	0 %	0 %	478452672
10036	NC_020935	A	6	6	512158	512163	100 %	0 %	0 %	0 %	478452672
10037	NC_020935	TTCT	2	8	512175	512182	0 %	75 %	0 %	25 %	478452672
10038	NC_020935	AGA	2	6	512211	512216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452672
10039	NC_020935	CCCA	2	8	512245	512252	25 %	0 %	0 %	75 %	478452672
10040	NC_020935	AGA	2	6	512265	512270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452672
10041	NC_020935	ATC	2	6	512336	512341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452672
10042	NC_020935	ACGAC	2	10	512421	512430	40 %	0 %	20 %	40 %	478452672
10043	NC_020935	CTCTT	2	10	512504	512513	0 %	60 %	0 %	40 %	478452672
10044	NC_020935	TCC	2	6	512558	512563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452672
10045	NC_020935	CCGC	2	8	512587	512594	0 %	0 %	25 %	75 %	478452672
10046	NC_020935	GAG	2	6	512611	512616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452672
10047	NC_020935	T	6	6	512666	512671	0 %	100 %	0 %	0 %	478452672
10048	NC_020935	CTC	2	6	512713	512718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452672
10049	NC_020935	CAC	2	6	512751	512756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452672
10050	NC_020935	CTCTAT	2	12	513213	513224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478452673
10051	NC_020935	TC	3	6	513279	513284	0 %	50 %	0 %	50 %	478452673
10052	NC_020935	CTTC	2	8	513316	513323	0 %	50 %	0 %	50 %	478452673
10053	NC_020935	TCT	2	6	513427	513432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452673
10054	NC_020935	AGT	2	6	513584	513589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452673
10055	NC_020935	TCT	2	6	513607	513612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452673
10056	NC_020935	ATAG	2	8	513626	513633	50 %	25 %	25 %	0 %	478452673
10057	NC_020935	TCT	2	6	513708	513713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452673
10058	NC_020935	TGC	2	6	513714	513719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452673
10059	NC_020935	TGAACT	2	12	513720	513731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478452673
10060	NC_020935	TTG	2	6	513755	513760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452673
10061	NC_020935	CAA	2	6	514212	514217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452674
10062	NC_020935	ATA	2	6	514246	514251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452674
10063	NC_020935	TC	3	6	514344	514349	0 %	50 %	0 %	50 %	478452674
10064	NC_020935	TAA	2	6	514386	514391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452674
10065	NC_020935	AGA	2	6	514424	514429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452674
10066	NC_020935	AAG	2	6	514461	514466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452674
10067	NC_020935	GA	3	6	514499	514504	50 %	0 %	50 %	0 %	478452674
10068	NC_020935	ATCC	2	8	514506	514513	25 %	25 %	0 %	50 %	478452674
10069	NC_020935	CAT	2	6	514541	514546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452674
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10071	NC_020935	T	6	6	514581	514586	0 %	100 %	0 %	0 %	478452674
10072	NC_020935	TCT	2	6	514606	514611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452674
10073	NC_020935	A	6	6	514656	514661	100 %	0 %	0 %	0 %	478452674
10074	NC_020935	GAA	2	6	514676	514681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452674
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10077	NC_020935	AAT	2	6	514791	514796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452674
10078	NC_020935	CAG	2	6	514931	514936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452674
10079	NC_020935	TAATTC	2	12	515042	515053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478452674
10080	NC_020935	CGA	2	6	515064	515069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452674
10081	NC_020935	T	6	6	515107	515112	0 %	100 %	0 %	0 %	478452674
10082	NC_020935	TC	3	6	515171	515176	0 %	50 %	0 %	50 %	478452674
10083	NC_020935	A	6	6	515224	515229	100 %	0 %	0 %	0 %	478452674
10084	NC_020935	AAG	2	6	515255	515260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452674
10085	NC_020935	CTG	2	6	515265	515270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452674
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10087	NC_020935	ACTCCT	2	12	515311	515322	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478452674
10088	NC_020935	TGCAA	2	10	515373	515382	40 %	20 %	20 %	20 %	478452674
10089	NC_020935	CTG	2	6	515465	515470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452674
10090	NC_020935	GCA	2	6	515513	515518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452674
10091	NC_020935	AAG	2	6	515531	515536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452674
10092	NC_020935	TC	3	6	515540	515545	0 %	50 %	0 %	50 %	478452674
10093	NC_020935	TGT	2	6	515548	515553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452674
10094	NC_020935	ATC	2	6	515662	515667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452674
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10096	NC_020935	GAG	2	6	515749	515754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452674
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10101	NC_020935	GGA	2	6	516097	516102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452675
10102	NC_020935	AATG	2	8	516150	516157	50 %	25 %	25 %	0 %	478452675
10103	NC_020935	GTT	2	6	516214	516219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452675
10104	NC_020935	TCT	2	6	516248	516253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452675
10105	NC_020935	CAT	2	6	516260	516265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452675
10106	NC_020935	TCT	2	6	516307	516312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452675
10107	NC_020935	AAT	2	6	516327	516332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452675
10108	NC_020935	TCA	2	6	516365	516370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452675
10109	NC_020935	TTGC	2	8	516380	516387	0 %	50 %	25 %	25 %	478452675
10110	NC_020935	AATC	2	8	516389	516396	50 %	25 %	0 %	25 %	478452675
10111	NC_020935	AGCAC	2	10	516430	516439	40 %	0 %	20 %	40 %	478452675
10112	NC_020935	TAA	2	6	516447	516452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452675
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10115	NC_020935	GAA	2	6	516665	516670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452675
10116	NC_020935	GAT	2	6	516680	516685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452675
10117	NC_020935	TTCTG	2	10	516697	516706	0 %	60 %	20 %	20 %	478452675
10118	NC_020935	AT	3	6	516756	516761	50 %	50 %	0 %	0 %	478452675
10119	NC_020935	TTG	2	6	516822	516827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452675
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