MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020935	T	6	6	27891	27896	0 %	100 %	0 %	0 %	478452246
503	NC_020935	TGA	2	6	27904	27909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452246
504	NC_020935	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478452246
505	NC_020935	GGATA	2	10	27938	27947	40 %	20 %	40 %	0 %	478452246
506	NC_020935	A	7	7	27962	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	478452246
507	NC_020935	AAG	2	6	27979	27984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452246
508	NC_020935	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	478452246
509	NC_020935	A	8	8	28096	28103	100 %	0 %	0 %	0 %	478452247
510	NC_020935	TTC	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452247
511	NC_020935	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	478452247
512	NC_020935	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	478452247
513	NC_020935	TTC	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452247
514	NC_020935	AAG	2	6	28273	28278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452247
515	NC_020935	TTC	2	6	28373	28378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452247
516	NC_020935	AAG	2	6	28387	28392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452247
517	NC_020935	AAG	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452247
518	NC_020935	A	6	6	28411	28416	100 %	0 %	0 %	0 %	478452247
519	NC_020935	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452248
520	NC_020935	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478452248
521	NC_020935	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452248
522	NC_020935	TAG	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452248
523	NC_020935	AGA	2	6	28837	28842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452248
524	NC_020935	GAT	3	9	28919	28927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452248
525	NC_020935	GAG	2	6	28962	28967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452248
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527	NC_020935	GCA	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452248
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529	NC_020935	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478452248
530	NC_020935	TTC	2	6	29217	29222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452248
531	NC_020935	CAG	2	6	29229	29234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452248
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533	NC_020935	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452248
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535	NC_020935	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	478452248
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537	NC_020935	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	478452248
538	NC_020935	GAA	2	6	29672	29677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452248
539	NC_020935	TGT	2	6	29704	29709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452249
540	NC_020935	TCT	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452249
541	NC_020935	ACA	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452249
542	NC_020935	ATG	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452249
543	NC_020935	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478452249
544	NC_020935	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478452249
545	NC_020935	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478452249
546	NC_020935	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478452249
547	NC_020935	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	478452249
548	NC_020935	ATC	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452249
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550	NC_020935	T	8	8	30471	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	478452249
551	NC_020935	ATG	2	6	30496	30501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452249
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555	NC_020935	GTT	2	6	30713	30718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452250
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557	NC_020935	TC	3	6	30741	30746	0 %	50 %	0 %	50 %	478452250
558	NC_020935	TCT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452250
559	NC_020935	CTG	2	6	30810	30815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452250
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563	NC_020935	CCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452250
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565	NC_020935	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	478452250
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567	NC_020935	GGC	2	6	31048	31053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478452250
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570	NC_020935	TAG	2	6	31149	31154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452250
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