MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020931	AAC	2	6	508717	508722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454474
10002	NC_020931	TG	3	6	508923	508928	0 %	50 %	50 %	0 %	478454475
10003	NC_020931	GAA	2	6	508967	508972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454475
10004	NC_020931	CGAAT	2	10	509062	509071	40 %	20 %	20 %	20 %	478454475
10005	NC_020931	ACT	2	6	509072	509077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454475
10006	NC_020931	TCT	2	6	509168	509173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454475
10007	NC_020931	CTA	2	6	509244	509249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454475
10008	NC_020931	AGC	2	6	509263	509268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454475
10009	NC_020931	AAG	2	6	509301	509306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454475
10010	NC_020931	AGC	2	6	509325	509330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454475
10011	NC_020931	CAA	2	6	509337	509342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454475
10012	NC_020931	ATT	2	6	509344	509349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454475
10013	NC_020931	ACT	2	6	509432	509437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454475
10014	NC_020931	TTA	2	6	509438	509443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454475
10015	NC_020931	ACG	2	6	509504	509509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454475
10016	NC_020931	TACT	2	8	509598	509605	25 %	50 %	0 %	25 %	478454475
10017	NC_020931	GTT	2	6	509630	509635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454475
10018	NC_020931	TCC	2	6	509656	509661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454475
10019	NC_020931	AGA	2	6	509785	509790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454475
10020	NC_020931	CAA	3	9	509820	509828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454475
10021	NC_020931	GCTGTT	2	12	509837	509848	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478454475
10022	NC_020931	ACT	2	6	509876	509881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454475
10023	NC_020931	CTT	2	6	509910	509915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454475
10024	NC_020931	AGC	2	6	509994	509999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454475
10025	NC_020931	CTT	2	6	510003	510008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454475
10026	NC_020931	CAG	2	6	510087	510092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454475
10027	NC_020931	TG	3	6	510239	510244	0 %	50 %	50 %	0 %	478454475
10028	NC_020931	ATC	2	6	510259	510264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454475
10029	NC_020931	T	6	6	510380	510385	0 %	100 %	0 %	0 %	478454475
10030	NC_020931	T	6	6	510391	510396	0 %	100 %	0 %	0 %	478454475
10031	NC_020931	AGCTA	2	10	510433	510442	40 %	20 %	20 %	20 %	478454475
10032	NC_020931	TGA	2	6	510543	510548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454475
10033	NC_020931	ACC	2	6	510843	510848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454476
10034	NC_020931	TCTT	2	8	510856	510863	0 %	75 %	0 %	25 %	478454476
10035	NC_020931	ACA	2	6	510930	510935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454476
10036	NC_020931	ACT	2	6	510936	510941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454476
10037	NC_020931	ACA	2	6	510949	510954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454476
10038	NC_020931	AGC	2	6	510963	510968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454476
10039	NC_020931	T	7	7	510980	510986	0 %	100 %	0 %	0 %	478454476
10040	NC_020931	A	6	6	511321	511326	100 %	0 %	0 %	0 %	478454477
10041	NC_020931	CTG	2	6	511357	511362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454477
10042	NC_020931	CCT	2	6	511364	511369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454477
10043	NC_020931	TC	3	6	511462	511467	0 %	50 %	0 %	50 %	478454477
10044	NC_020931	CTT	2	6	511493	511498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454477
10045	NC_020931	CAC	2	6	511507	511512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454477
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10047	NC_020931	TGC	3	9	511605	511613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454478
10048	NC_020931	CTC	2	6	511627	511632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454478
10049	NC_020931	CTT	2	6	511760	511765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454478
10050	NC_020931	ATG	2	6	511766	511771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454478
10051	NC_020931	AGA	2	6	511810	511815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454478
10052	NC_020931	CTT	2	6	511835	511840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454478
10053	NC_020931	ACA	2	6	511864	511869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454478
10054	NC_020931	TAA	2	6	511904	511909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454478
10055	NC_020931	CTC	2	6	511910	511915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454478
10056	NC_020931	AAG	2	6	511944	511949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454478
10057	NC_020931	GTA	2	6	511977	511982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454478
10058	NC_020931	AG	3	6	511996	512001	50 %	0 %	50 %	0 %	478454478
10059	NC_020931	GAA	2	6	512002	512007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454478
10060	NC_020931	CT	3	6	512061	512066	0 %	50 %	0 %	50 %	478454478
10061	NC_020931	CTT	2	6	512245	512250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454478
10062	NC_020931	T	6	6	512249	512254	0 %	100 %	0 %	0 %	478454478
10063	NC_020931	A	6	6	512275	512280	100 %	0 %	0 %	0 %	478454478
10064	NC_020931	TTCT	2	8	512292	512299	0 %	75 %	0 %	25 %	478454478
10065	NC_020931	AGA	2	6	512328	512333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454478
10066	NC_020931	CCCA	2	8	512362	512369	25 %	0 %	0 %	75 %	478454478
10067	NC_020931	AGA	2	6	512382	512387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454478
10068	NC_020931	ATC	2	6	512453	512458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454478
10069	NC_020931	ACGAC	2	10	512538	512547	40 %	0 %	20 %	40 %	478454478
10070	NC_020931	CTCTT	2	10	512621	512630	0 %	60 %	0 %	40 %	478454478
10071	NC_020931	TCC	2	6	512675	512680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454478
10072	NC_020931	CCGC	2	8	512704	512711	0 %	0 %	25 %	75 %	478454478
10073	NC_020931	GAG	2	6	512728	512733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454478
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10075	NC_020931	CTC	2	6	512830	512835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454478
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10077	NC_020931	CTCTAT	2	12	513330	513341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478454479
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10079	NC_020931	CTTC	2	8	513433	513440	0 %	50 %	0 %	50 %	478454479
10080	NC_020931	TCT	2	6	513544	513549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454479
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10082	NC_020931	TCT	2	6	513724	513729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454479
10083	NC_020931	ATAG	2	8	513743	513750	50 %	25 %	25 %	0 %	478454479
10084	NC_020931	TCT	2	6	513825	513830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454479
10085	NC_020931	TGC	2	6	513831	513836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454479
10086	NC_020931	TGAACT	2	12	513837	513848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478454479
10087	NC_020931	TTG	2	6	513872	513877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454479
10088	NC_020931	CAA	2	6	514329	514334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454480
10089	NC_020931	ATA	2	6	514363	514368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454480
10090	NC_020931	TC	3	6	514461	514466	0 %	50 %	0 %	50 %	478454480
10091	NC_020931	TAA	2	6	514503	514508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454480
10092	NC_020931	AGA	2	6	514541	514546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454480
10093	NC_020931	AAG	2	6	514578	514583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454480
10094	NC_020931	GA	3	6	514616	514621	50 %	0 %	50 %	0 %	478454480
10095	NC_020931	ATCC	2	8	514623	514630	25 %	25 %	0 %	50 %	478454480
10096	NC_020931	CAT	2	6	514658	514663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454480
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10099	NC_020931	TCT	2	6	514723	514728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454480
10100	NC_020931	A	6	6	514773	514778	100 %	0 %	0 %	0 %	478454480
10101	NC_020931	GAA	2	6	514793	514798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454480
10102	NC_020931	TAA	2	6	514803	514808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454480
10103	NC_020931	AAT	2	6	514863	514868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454480
10104	NC_020931	AAT	2	6	514908	514913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454480
10105	NC_020931	CAG	2	6	515048	515053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454480
10106	NC_020931	TAATTC	2	12	515159	515170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478454480
10107	NC_020931	CGA	2	6	515181	515186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454480
10108	NC_020931	T	6	6	515224	515229	0 %	100 %	0 %	0 %	478454480
10109	NC_020931	TC	3	6	515288	515293	0 %	50 %	0 %	50 %	478454480
10110	NC_020931	A	6	6	515341	515346	100 %	0 %	0 %	0 %	478454480
10111	NC_020931	AAG	2	6	515372	515377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454480
10112	NC_020931	CTG	2	6	515382	515387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454480
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10114	NC_020931	ACTCCT	2	12	515428	515439	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478454480
10115	NC_020931	TGCAA	2	10	515490	515499	40 %	20 %	20 %	20 %	478454480
10116	NC_020931	CTG	2	6	515582	515587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454480
10117	NC_020931	GCA	2	6	515630	515635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454480
10118	NC_020931	AAG	2	6	515648	515653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454480
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10120	NC_020931	TGT	2	6	515665	515670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454480
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10241	NC_020931	TCC	2	6	523228	523233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454484
10242	NC_020931	GAT	2	6	523261	523266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454484
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10259	NC_020931	ATTC	2	8	524114	524121	25 %	50 %	0 %	25 %	478454486
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10341	NC_020931	AGCCAC	2	12	528109	528120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478454489
10342	NC_020931	TCA	2	6	528200	528205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454489
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10352	NC_020931	CAG	2	6	528474	528479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454489
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