MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020931	CAG	2	6	357067	357072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454343
7003	NC_020931	GATC	2	8	357154	357161	25 %	25 %	25 %	25 %	478454343
7004	NC_020931	TC	3	6	357375	357380	0 %	50 %	0 %	50 %	478454344
7005	NC_020931	T	6	6	357510	357515	0 %	100 %	0 %	0 %	478454344
7006	NC_020931	GAA	2	6	357523	357528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454344
7007	NC_020931	ACA	2	6	357583	357588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454344
7008	NC_020931	GCA	2	6	357661	357666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454344
7009	NC_020931	TGG	2	6	357684	357689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454344
7010	NC_020931	T	7	7	357740	357746	0 %	100 %	0 %	0 %	478454344
7011	NC_020931	TTCTTA	2	12	357852	357863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478454345
7012	NC_020931	ATC	2	6	357912	357917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454345
7013	NC_020931	TC	3	6	357926	357931	0 %	50 %	0 %	50 %	478454345
7014	NC_020931	GCC	2	6	357959	357964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478454345
7015	NC_020931	CAA	2	6	357995	358000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454345
7016	NC_020931	AACA	2	8	358005	358012	75 %	0 %	0 %	25 %	478454345
7017	NC_020931	AAC	2	6	358062	358067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454345
7018	NC_020931	T	6	6	358074	358079	0 %	100 %	0 %	0 %	478454345
7019	NC_020931	T	6	6	358102	358107	0 %	100 %	0 %	0 %	478454345
7020	NC_020931	TCT	2	6	358111	358116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454345
7021	NC_020931	CAGA	2	8	358118	358125	50 %	0 %	25 %	25 %	478454345
7022	NC_020931	TCT	2	6	358169	358174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454345
7023	NC_020931	TTC	2	6	358264	358269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454345
7024	NC_020931	GAT	2	6	358296	358301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454345
7025	NC_020931	CTG	2	6	358302	358307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454345
7026	NC_020931	CTT	2	6	358331	358336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454345
7027	NC_020931	TCT	2	6	358342	358347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454345
7028	NC_020931	T	6	6	358354	358359	0 %	100 %	0 %	0 %	478454345
7029	NC_020931	CTTT	2	8	358361	358368	0 %	75 %	0 %	25 %	478454345
7030	NC_020931	GAC	2	6	358389	358394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454345
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7032	NC_020931	TCA	2	6	358511	358516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454346
7033	NC_020931	TCT	2	6	358565	358570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454346
7034	NC_020931	TTC	2	6	358575	358580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454346
7035	NC_020931	GCT	2	6	358600	358605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454346
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7040	NC_020931	TGT	2	6	358981	358986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454347
7041	NC_020931	GAA	3	9	358990	358998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454347
7042	NC_020931	GAA	2	6	359017	359022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454347
7043	NC_020931	GTC	2	6	359031	359036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454347
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7045	NC_020931	GCAA	2	8	359103	359110	50 %	0 %	25 %	25 %	478454347
7046	NC_020931	GAG	2	6	359152	359157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454347
7047	NC_020931	TC	3	6	359169	359174	0 %	50 %	0 %	50 %	478454347
7048	NC_020931	GACC	2	8	359247	359254	25 %	0 %	25 %	50 %	478454347
7049	NC_020931	TAC	2	6	359305	359310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454347
7050	NC_020931	ATC	2	6	359395	359400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454347
7051	NC_020931	TATG	2	8	359431	359438	25 %	50 %	25 %	0 %	478454347
7052	NC_020931	TGA	2	6	359475	359480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454347
7053	NC_020931	AAG	2	6	359509	359514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454347
7054	NC_020931	TCT	2	6	359555	359560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454347
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7056	NC_020931	ACT	2	6	359672	359677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454347
7057	NC_020931	TTC	2	6	359821	359826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454347
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7071	NC_020931	CTC	2	6	361464	361469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454349
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7075	NC_020931	CAT	2	6	361612	361617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454349
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7090	NC_020931	TCCA	2	8	362955	362962	25 %	25 %	0 %	50 %	478454351
7091	NC_020931	A	7	7	362962	362968	100 %	0 %	0 %	0 %	478454351
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7094	NC_020931	CTT	2	6	363120	363125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454351
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7106	NC_020931	TGAG	2	8	363554	363561	25 %	25 %	50 %	0 %	478454351
7107	NC_020931	AC	3	6	363582	363587	50 %	0 %	0 %	50 %	478454351
7108	NC_020931	A	6	6	363683	363688	100 %	0 %	0 %	0 %	478454351
7109	NC_020931	CAA	2	6	363703	363708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
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7111	NC_020931	CAA	2	6	363842	363847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
7112	NC_020931	TGA	2	6	363864	363869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
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7114	NC_020931	TGA	2	6	363960	363965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454351
7115	NC_020931	CT	3	6	363987	363992	0 %	50 %	0 %	50 %	478454351
7116	NC_020931	CA	3	6	363996	364001	50 %	0 %	0 %	50 %	478454351
7117	NC_020931	CAA	2	6	364042	364047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454351
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7123	NC_020931	GAA	2	6	364248	364253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454351
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7494	NC_020931	A	9	9	383185	383193	100 %	0 %	0 %	0 %	478454367
7495	NC_020931	CTCA	2	8	383194	383201	25 %	25 %	0 %	50 %	478454367
7496	NC_020931	CAT	2	6	383271	383276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454367
7497	NC_020931	CTA	2	6	383279	383284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454367
7498	NC_020931	TCA	2	6	383359	383364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454367
7499	NC_020931	TTC	2	6	383409	383414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454367
7500	NC_020931	TTCT	2	8	383452	383459	0 %	75 %	0 %	25 %	478454367

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