MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020929	CTC	2	6	207593	207598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451508
4003	NC_020929	AGC	2	6	207600	207605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451508
4004	NC_020929	AGC	2	6	207702	207707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451508
4005	NC_020929	CAT	2	6	207722	207727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451508
4006	NC_020929	T	6	6	207750	207755	0 %	100 %	0 %	0 %	478451508
4007	NC_020929	ACA	2	6	207793	207798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451508
4008	NC_020929	CTT	2	6	207801	207806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4009	NC_020929	GCA	2	6	207859	207864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451508
4010	NC_020929	TTCC	2	8	207884	207891	0 %	50 %	0 %	50 %	478451508
4011	NC_020929	TAA	2	6	207899	207904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4012	NC_020929	AGTA	2	8	207988	207995	50 %	25 %	25 %	0 %	478451508
4013	NC_020929	TTC	2	6	208042	208047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4014	NC_020929	CGC	2	6	208073	208078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451508
4015	NC_020929	ATC	2	6	208122	208127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451508
4016	NC_020929	TGA	2	6	208139	208144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451508
4017	NC_020929	ATA	2	6	208162	208167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4018	NC_020929	TCT	2	6	208168	208173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4019	NC_020929	ACG	2	6	208212	208217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451508
4020	NC_020929	TTC	2	6	208251	208256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4021	NC_020929	TAAC	2	8	208271	208278	50 %	25 %	0 %	25 %	478451508
4022	NC_020929	TCT	2	6	208279	208284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4023	NC_020929	ATA	2	6	208302	208307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4024	NC_020929	TGT	2	6	208438	208443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451508
4025	NC_020929	TAC	2	6	208482	208487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451508
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4027	NC_020929	TTTA	2	8	208548	208555	25 %	75 %	0 %	0 %	478451508
4028	NC_020929	TTC	3	9	208568	208576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451508
4029	NC_020929	AAC	2	6	208716	208721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451508
4030	NC_020929	T	6	6	208737	208742	0 %	100 %	0 %	0 %	478451508
4031	NC_020929	ATTT	2	8	208853	208860	25 %	75 %	0 %	0 %	478451508
4032	NC_020929	AAT	2	6	208884	208889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4033	NC_020929	GC	3	6	208933	208938	0 %	0 %	50 %	50 %	478451508
4034	NC_020929	AAT	2	6	208995	209000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4035	NC_020929	CCT	2	6	209002	209007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451508
4036	NC_020929	AATT	2	8	209091	209098	50 %	50 %	0 %	0 %	478451508
4037	NC_020929	TTG	2	6	209123	209128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451508
4038	NC_020929	GAG	2	6	209149	209154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451508
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4041	NC_020929	AAT	2	6	209574	209579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451508
4042	NC_020929	GAT	2	6	209640	209645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451508
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4044	NC_020929	TTTA	2	8	209652	209659	25 %	75 %	0 %	0 %	478451508
4045	NC_020929	ATT	2	6	209690	209695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451509
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4049	NC_020929	AGT	2	6	209923	209928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451509
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4051	NC_020929	TCT	2	6	209976	209981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451509
4052	NC_020929	TGGA	2	8	210008	210015	25 %	25 %	50 %	0 %	478451509
4053	NC_020929	TTC	2	6	210062	210067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451509
4054	NC_020929	TA	3	6	210082	210087	50 %	50 %	0 %	0 %	478451509
4055	NC_020929	TTC	2	6	210110	210115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451509
4056	NC_020929	GCA	2	6	210120	210125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451509
4057	NC_020929	GCT	2	6	210129	210134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451509
4058	NC_020929	GGA	2	6	210186	210191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451509
4059	NC_020929	T	6	6	210254	210259	0 %	100 %	0 %	0 %	478451509
4060	NC_020929	AACG	2	8	210302	210309	50 %	0 %	25 %	25 %	478451509
4061	NC_020929	TCA	2	6	210345	210350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451509
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4063	NC_020929	CCAT	2	8	210393	210400	25 %	25 %	0 %	50 %	478451509
4064	NC_020929	GA	3	6	210411	210416	50 %	0 %	50 %	0 %	478451509
4065	NC_020929	T	6	6	210431	210436	0 %	100 %	0 %	0 %	478451509
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4070	NC_020929	ATA	4	12	210567	210578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451509
4071	NC_020929	GCT	2	6	210636	210641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451509
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4074	NC_020929	AGCG	2	8	210847	210854	25 %	0 %	50 %	25 %	478451509
4075	NC_020929	CT	3	6	210884	210889	0 %	50 %	0 %	50 %	478451509
4076	NC_020929	CT	3	6	210892	210897	0 %	50 %	0 %	50 %	478451509
4077	NC_020929	AGC	2	6	210899	210904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451509
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4083	NC_020929	TAGA	2	8	211144	211151	50 %	25 %	25 %	0 %	478451509
4084	NC_020929	CTTGT	2	10	211222	211231	0 %	60 %	20 %	20 %	478451509
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4089	NC_020929	CG	3	6	211517	211522	0 %	0 %	50 %	50 %	478451509
4090	NC_020929	CTGGAT	2	12	211549	211560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478451509
4091	NC_020929	GTA	2	6	211774	211779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451509
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4093	NC_020929	CTTG	2	8	211816	211823	0 %	50 %	25 %	25 %	478451509
4094	NC_020929	GAAATA	2	12	211872	211883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478451509
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4098	NC_020929	TTTCT	2	10	212072	212081	0 %	80 %	0 %	20 %	478451509
4099	NC_020929	TAA	2	6	212101	212106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451510
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4101	NC_020929	CTT	2	6	212269	212274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451510
4102	NC_020929	ACG	2	6	212407	212412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451510
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4104	NC_020929	AATA	2	8	212700	212707	75 %	25 %	0 %	0 %	478451511
4105	NC_020929	CTT	2	6	212750	212755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451511
4106	NC_020929	CAG	2	6	212760	212765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451511
4107	NC_020929	TTG	2	6	212883	212888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451511
4108	NC_020929	TCC	2	6	212893	212898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451511
4109	NC_020929	AAG	2	6	212933	212938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451511
4110	NC_020929	CTT	2	6	212939	212944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451511
4111	NC_020929	CTT	2	6	212966	212971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451511
4112	NC_020929	CTG	2	6	213025	213030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451511
4113	NC_020929	CCA	2	6	213088	213093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451511
4114	NC_020929	CAAA	2	8	213108	213115	75 %	0 %	0 %	25 %	478451511
4115	NC_020929	CCA	2	6	213127	213132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451511
4116	NC_020929	GCA	2	6	213139	213144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451511
4117	NC_020929	CAA	2	6	213152	213157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451511
4118	NC_020929	TAC	2	6	213203	213208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451511
4119	NC_020929	CTT	2	6	213266	213271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451511
4120	NC_020929	TA	3	6	213392	213397	50 %	50 %	0 %	0 %	478451512
4121	NC_020929	ATG	2	6	213445	213450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451512
4122	NC_020929	TGT	2	6	213453	213458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451512
4123	NC_020929	GC	3	6	213518	213523	0 %	0 %	50 %	50 %	478451512
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4131	NC_020929	T	6	6	213929	213934	0 %	100 %	0 %	0 %	478451512
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4233	NC_020929	GA	4	8	219132	219139	50 %	0 %	50 %	0 %	478451516
4234	NC_020929	CA	3	6	219154	219159	50 %	0 %	0 %	50 %	478451516
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4239	NC_020929	GAT	2	6	219304	219309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451517
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4241	NC_020929	TCA	2	6	219363	219368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451517
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4243	NC_020929	A	7	7	219451	219457	100 %	0 %	0 %	0 %	478451517
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4245	NC_020929	TTA	2	6	219503	219508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451517
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4250	NC_020929	GAT	2	6	219625	219630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451517
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4491	NC_020929	CCT	2	6	231493	231498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451527
4492	NC_020929	TCC	2	6	231516	231521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451527
4493	NC_020929	CTG	2	6	231536	231541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451527
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4495	NC_020929	TAG	2	6	231648	231653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451527
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