MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020929	TTG	2	6	153559	153564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451459
3002	NC_020929	TTA	2	6	153597	153602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451459
3003	NC_020929	GCA	2	6	153618	153623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451459
3004	NC_020929	GCA	2	6	153636	153641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451459
3005	NC_020929	AG	3	6	153942	153947	50 %	0 %	50 %	0 %	478451459
3006	NC_020929	CTTT	2	8	153971	153978	0 %	75 %	0 %	25 %	478451459
3007	NC_020929	AT	3	6	154096	154101	50 %	50 %	0 %	0 %	478451460
3008	NC_020929	T	7	7	154111	154117	0 %	100 %	0 %	0 %	478451460
3009	NC_020929	T	6	6	154182	154187	0 %	100 %	0 %	0 %	478451460
3010	NC_020929	ATC	2	6	154212	154217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451460
3011	NC_020929	T	6	6	154222	154227	0 %	100 %	0 %	0 %	478451460
3012	NC_020929	TGTGCG	2	12	154236	154247	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	478451460
3013	NC_020929	TCT	2	6	154361	154366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451460
3014	NC_020929	CAG	2	6	154400	154405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451460
3015	NC_020929	GATC	2	8	154472	154479	25 %	25 %	25 %	25 %	478451460
3016	NC_020929	ATT	2	6	154487	154492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451460
3017	NC_020929	ATG	2	6	154514	154519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451460
3018	NC_020929	ACG	2	6	154520	154525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451460
3019	NC_020929	TCT	2	6	154538	154543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451460
3020	NC_020929	AGC	2	6	154579	154584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451460
3021	NC_020929	AATC	2	8	154592	154599	50 %	25 %	0 %	25 %	478451460
3022	NC_020929	GAA	2	6	154604	154609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451460
3023	NC_020929	TA	3	6	154637	154642	50 %	50 %	0 %	0 %	478451460
3024	NC_020929	GAT	2	6	154658	154663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451460
3025	NC_020929	TA	3	6	154695	154700	50 %	50 %	0 %	0 %	478451460
3026	NC_020929	CTT	2	6	154713	154718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451460
3027	NC_020929	GGA	2	6	154745	154750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451460
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3029	NC_020929	ATG	2	6	154769	154774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451460
3030	NC_020929	AGTC	2	8	154805	154812	25 %	25 %	25 %	25 %	478451460
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3033	NC_020929	AGA	2	6	155011	155016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451461
3034	NC_020929	TTC	2	6	155076	155081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451461
3035	NC_020929	ATA	2	6	155109	155114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451461
3036	NC_020929	ATC	2	6	155157	155162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451461
3037	NC_020929	GCA	2	6	155170	155175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451461
3038	NC_020929	CTG	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451461
3039	NC_020929	GAA	2	6	155273	155278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451461
3040	NC_020929	GAG	2	6	155339	155344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451461
3041	NC_020929	TGT	2	6	155458	155463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451461
3042	NC_020929	CCTCAT	2	12	155534	155545	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478451461
3043	NC_020929	AGGC	2	8	155564	155571	25 %	0 %	50 %	25 %	478451461
3044	NC_020929	GAGT	2	8	155652	155659	25 %	25 %	50 %	0 %	478451461
3045	NC_020929	CAC	2	6	155804	155809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451462
3046	NC_020929	TTCTT	2	10	155832	155841	0 %	80 %	0 %	20 %	478451462
3047	NC_020929	GACT	2	8	155860	155867	25 %	25 %	25 %	25 %	478451462
3048	NC_020929	GTA	2	6	155914	155919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451462
3049	NC_020929	TGT	2	6	155983	155988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451462
3050	NC_020929	TA	3	6	156012	156017	50 %	50 %	0 %	0 %	478451462
3051	NC_020929	TGG	3	9	156047	156055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451462
3052	NC_020929	TTG	2	6	156105	156110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451462
3053	NC_020929	GAT	2	6	156162	156167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451462
3054	NC_020929	CG	3	6	156231	156236	0 %	0 %	50 %	50 %	478451462
3055	NC_020929	TTA	2	6	156258	156263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451462
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3057	NC_020929	T	7	7	156417	156423	0 %	100 %	0 %	0 %	478451462
3058	NC_020929	GAA	2	6	156432	156437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451462
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3061	NC_020929	ATT	2	6	156920	156925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451463
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3069	NC_020929	CCCA	2	8	157215	157222	25 %	0 %	0 %	75 %	478451463
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3083	NC_020929	AG	3	6	157708	157713	50 %	0 %	50 %	0 %	478451463
3084	NC_020929	AG	3	6	157773	157778	50 %	0 %	50 %	0 %	478451463
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3093	NC_020929	GA	3	6	158276	158281	50 %	0 %	50 %	0 %	478451464
3094	NC_020929	A	7	7	158303	158309	100 %	0 %	0 %	0 %	478451464
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3101	NC_020929	A	6	6	158508	158513	100 %	0 %	0 %	0 %	478451464
3102	NC_020929	T	6	6	158587	158592	0 %	100 %	0 %	0 %	478451464
3103	NC_020929	ATG	2	6	158637	158642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451464
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3106	NC_020929	T	6	6	158707	158712	0 %	100 %	0 %	0 %	478451464
3107	NC_020929	AGA	2	6	158729	158734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451464
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3113	NC_020929	AGA	2	6	159224	159229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451465
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3119	NC_020929	CAT	2	6	159947	159952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451466
3120	NC_020929	TCAA	2	8	160008	160015	50 %	25 %	0 %	25 %	478451466
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3122	NC_020929	AAG	2	6	160248	160253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451466
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3495	NC_020929	AGA	2	6	179250	179255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451478
3496	NC_020929	CAA	2	6	179337	179342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451478
3497	NC_020929	TTTC	2	8	179370	179377	0 %	75 %	0 %	25 %	478451478
3498	NC_020929	AGT	2	6	179409	179414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451478
3499	NC_020929	GAT	2	6	179444	179449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451478
3500	NC_020929	CTC	2	6	179464	179469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451478

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