MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_020929	TGCC	2	8	683902	683909	0 %	25 %	25 %	50 %	478451939
13503	NC_020929	AGC	2	6	684013	684018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451939
13504	NC_020929	T	6	6	684031	684036	0 %	100 %	0 %	0 %	478451939
13505	NC_020929	A	6	6	684071	684076	100 %	0 %	0 %	0 %	478451939
13506	NC_020929	GCAA	2	8	684077	684084	50 %	0 %	25 %	25 %	478451939
13507	NC_020929	G	6	6	684137	684142	0 %	0 %	100 %	0 %	478451939
13508	NC_020929	TTC	2	6	684219	684224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451940
13509	NC_020929	AT	4	8	684235	684242	50 %	50 %	0 %	0 %	478451940
13510	NC_020929	TACA	2	8	684243	684250	50 %	25 %	0 %	25 %	478451940
13511	NC_020929	GCA	2	6	684273	684278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13512	NC_020929	CCG	2	6	684286	684291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451940
13513	NC_020929	AGCTGG	3	18	684323	684340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478451940
13514	NC_020929	AGT	2	6	684350	684355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451940
13515	NC_020929	AGA	2	6	684380	684385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451940
13516	NC_020929	AGC	2	6	684434	684439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13517	NC_020929	TAGA	2	8	684559	684566	50 %	25 %	25 %	0 %	478451940
13518	NC_020929	TTAT	2	8	684580	684587	25 %	75 %	0 %	0 %	478451940
13519	NC_020929	ATTA	2	8	684608	684615	50 %	50 %	0 %	0 %	478451940
13520	NC_020929	TGCAA	3	15	684654	684668	40 %	20 %	20 %	20 %	478451940
13521	NC_020929	TC	3	6	684676	684681	0 %	50 %	0 %	50 %	478451940
13522	NC_020929	A	6	6	684686	684691	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13523	NC_020929	TGC	2	6	684779	684784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13524	NC_020929	GAT	2	6	684801	684806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451940
13525	NC_020929	CTG	2	6	684828	684833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13526	NC_020929	TTG	2	6	684879	684884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451940
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13528	NC_020929	TGC	2	6	684938	684943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13529	NC_020929	TA	3	6	684986	684991	50 %	50 %	0 %	0 %	478451940
13530	NC_020929	ATT	2	6	685039	685044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451940
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13533	NC_020929	AAT	2	6	685125	685130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451940
13534	NC_020929	A	6	6	685144	685149	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13535	NC_020929	AGA	2	6	685232	685237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451940
13536	NC_020929	CT	4	8	685270	685277	0 %	50 %	0 %	50 %	478451940
13537	NC_020929	CGAA	2	8	685296	685303	50 %	0 %	25 %	25 %	478451940
13538	NC_020929	GCG	2	6	685326	685331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451940
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13540	NC_020929	TAA	2	6	685430	685435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451940
13541	NC_020929	A	6	6	685473	685478	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13542	NC_020929	ACCT	2	8	685534	685541	25 %	25 %	0 %	50 %	478451940
13543	NC_020929	TTG	2	6	685553	685558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451940
13544	NC_020929	A	6	6	685572	685577	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13545	NC_020929	A	6	6	685593	685598	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13546	NC_020929	AGC	2	6	685645	685650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451940
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13549	NC_020929	A	6	6	685751	685756	100 %	0 %	0 %	0 %	478451940
13550	NC_020929	ATT	2	6	685769	685774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451940
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13552	NC_020929	GAA	2	6	685947	685952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451940
13553	NC_020929	CTT	2	6	685956	685961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451940
13554	NC_020929	GAACG	2	10	686086	686095	40 %	0 %	40 %	20 %	478451940
13555	NC_020929	CAG	2	6	686108	686113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451940
13556	NC_020929	TTA	2	6	686116	686121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451940
13557	NC_020929	GCATCA	2	12	686165	686176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478451941
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13559	NC_020929	CTT	2	6	686388	686393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451941
13560	NC_020929	CAA	2	6	686556	686561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451941
13561	NC_020929	CTA	2	6	686613	686618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451941
13562	NC_020929	AGG	2	6	686635	686640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451941
13563	NC_020929	TAT	2	6	686648	686653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451941
13564	NC_020929	ACT	2	6	686691	686696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451941
13565	NC_020929	ATGC	2	8	686709	686716	25 %	25 %	25 %	25 %	478451941
13566	NC_020929	CAG	3	9	686776	686784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451941
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13569	NC_020929	TAA	2	6	686873	686878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451941
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13578	NC_020929	CT	4	8	687123	687130	0 %	50 %	0 %	50 %	478451941
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13589	NC_020929	CTT	2	6	687655	687660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451942
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13593	NC_020929	AGC	2	6	687863	687868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451942
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13601	NC_020929	A	6	6	688248	688253	100 %	0 %	0 %	0 %	478451942
13602	NC_020929	CAT	2	6	688268	688273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451943
13603	NC_020929	TTCTT	2	10	688274	688283	0 %	80 %	0 %	20 %	478451943
13604	NC_020929	A	6	6	688304	688309	100 %	0 %	0 %	0 %	478451943
13605	NC_020929	ACAA	2	8	688444	688451	75 %	0 %	0 %	25 %	478451943
13606	NC_020929	GAC	2	6	688503	688508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451943
13607	NC_020929	TA	3	6	688528	688533	50 %	50 %	0 %	0 %	478451943
13608	NC_020929	CGC	2	6	688586	688591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451943
13609	NC_020929	AGT	2	6	688597	688602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451943
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13611	NC_020929	TCA	2	6	688730	688735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451943
13612	NC_020929	CTT	2	6	688761	688766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451943
13613	NC_020929	T	6	6	688765	688770	0 %	100 %	0 %	0 %	478451943
13614	NC_020929	AT	3	6	688777	688782	50 %	50 %	0 %	0 %	478451943
13615	NC_020929	ACAAA	2	10	688795	688804	80 %	0 %	0 %	20 %	478451943
13616	NC_020929	CTT	2	6	688815	688820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451943
13617	NC_020929	T	7	7	688819	688825	0 %	100 %	0 %	0 %	478451943
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