MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020929	GCT	2	6	659738	659743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451917
13002	NC_020929	TCT	2	6	659744	659749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451917
13003	NC_020929	ATG	2	6	659775	659780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451917
13004	NC_020929	GAA	2	6	659864	659869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451917
13005	NC_020929	GAC	2	6	659930	659935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451917
13006	NC_020929	ATTG	2	8	659956	659963	25 %	50 %	25 %	0 %	478451917
13007	NC_020929	TCA	2	6	660000	660005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451917
13008	NC_020929	AACCA	2	10	660006	660015	60 %	0 %	0 %	40 %	478451917
13009	NC_020929	GCTAC	2	10	660069	660078	20 %	20 %	20 %	40 %	478451917
13010	NC_020929	AGA	2	6	660106	660111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451917
13011	NC_020929	TAC	2	6	660112	660117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451917
13012	NC_020929	GAA	2	6	660218	660223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451917
13013	NC_020929	AATA	2	8	660426	660433	75 %	25 %	0 %	0 %	478451918
13014	NC_020929	CACG	2	8	660451	660458	25 %	0 %	25 %	50 %	478451918
13015	NC_020929	TG	3	6	660483	660488	0 %	50 %	50 %	0 %	478451918
13016	NC_020929	TAT	2	6	660494	660499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451918
13017	NC_020929	CTC	2	6	660557	660562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451918
13018	NC_020929	TTTA	2	8	660590	660597	25 %	75 %	0 %	0 %	478451918
13019	NC_020929	ACA	2	6	660611	660616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451918
13020	NC_020929	CT	3	6	660646	660651	0 %	50 %	0 %	50 %	478451918
13021	NC_020929	CTG	2	6	660685	660690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451918
13022	NC_020929	A	7	7	660761	660767	100 %	0 %	0 %	0 %	478451918
13023	NC_020929	AAC	2	6	660811	660816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451918
13024	NC_020929	AAG	2	6	660946	660951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13025	NC_020929	TATT	2	8	660987	660994	25 %	75 %	0 %	0 %	478451918
13026	NC_020929	CT	3	6	661021	661026	0 %	50 %	0 %	50 %	478451918
13027	NC_020929	TC	3	6	661043	661048	0 %	50 %	0 %	50 %	478451918
13028	NC_020929	CAT	2	6	661058	661063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451918
13029	NC_020929	GAT	2	6	661149	661154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451918
13030	NC_020929	C	6	6	661160	661165	0 %	0 %	0 %	100 %	478451918
13031	NC_020929	TAC	2	6	661174	661179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451918
13032	NC_020929	C	6	6	661181	661186	0 %	0 %	0 %	100 %	478451918
13033	NC_020929	AT	3	6	661259	661264	50 %	50 %	0 %	0 %	478451918
13034	NC_020929	CT	3	6	661268	661273	0 %	50 %	0 %	50 %	478451918
13035	NC_020929	GAA	2	6	661305	661310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13036	NC_020929	CTT	2	6	661327	661332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451918
13037	NC_020929	CGA	2	6	661338	661343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451918
13038	NC_020929	TTG	2	6	661367	661372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451918
13039	NC_020929	T	6	6	661397	661402	0 %	100 %	0 %	0 %	478451918
13040	NC_020929	ATG	2	6	661449	661454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451918
13041	NC_020929	TCG	2	6	661460	661465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451918
13042	NC_020929	CCAT	2	8	661475	661482	25 %	25 %	0 %	50 %	478451918
13043	NC_020929	ATC	2	6	661513	661518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451918
13044	NC_020929	A	7	7	661576	661582	100 %	0 %	0 %	0 %	478451918
13045	NC_020929	GAA	2	6	661626	661631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13046	NC_020929	CAA	2	6	661635	661640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451918
13047	NC_020929	AGG	2	6	661715	661720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451918
13048	NC_020929	TGCG	2	8	661808	661815	0 %	25 %	50 %	25 %	478451918
13049	NC_020929	TGAG	2	8	661855	661862	25 %	25 %	50 %	0 %	478451918
13050	NC_020929	CTC	2	6	661865	661870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451918
13051	NC_020929	AAG	2	6	661876	661881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13052	NC_020929	CAA	2	6	661887	661892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451918
13053	NC_020929	GCT	2	6	661896	661901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451918
13054	NC_020929	CT	3	6	661900	661905	0 %	50 %	0 %	50 %	478451918
13055	NC_020929	ACAG	2	8	661913	661920	50 %	0 %	25 %	25 %	478451918
13056	NC_020929	TCC	2	6	662087	662092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451918
13057	NC_020929	AAGC	2	8	662161	662168	50 %	0 %	25 %	25 %	478451918
13058	NC_020929	GA	3	6	662179	662184	50 %	0 %	50 %	0 %	478451918
13059	NC_020929	GAA	2	6	662193	662198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13060	NC_020929	GAA	2	6	662241	662246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451918
13061	NC_020929	TTA	2	6	662351	662356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451918
13062	NC_020929	GACA	2	8	662486	662493	50 %	0 %	25 %	25 %	478451919
13063	NC_020929	CTT	2	6	662509	662514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
13064	NC_020929	CTC	2	6	662537	662542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451919
13065	NC_020929	CTTT	3	12	662563	662574	0 %	75 %	0 %	25 %	478451919
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13068	NC_020929	T	6	6	662730	662735	0 %	100 %	0 %	0 %	478451919
13069	NC_020929	GAT	2	6	662754	662759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451919
13070	NC_020929	TTC	2	6	662796	662801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
13071	NC_020929	TA	3	6	662851	662856	50 %	50 %	0 %	0 %	478451919
13072	NC_020929	AACA	2	8	663055	663062	75 %	0 %	0 %	25 %	478451919
13073	NC_020929	TCT	2	6	663075	663080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
13074	NC_020929	TC	4	8	663148	663155	0 %	50 %	0 %	50 %	478451919
13075	NC_020929	CT	4	8	663173	663180	0 %	50 %	0 %	50 %	478451919
13076	NC_020929	CTT	2	6	663191	663196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
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13080	NC_020929	TACTT	2	10	663564	663573	20 %	60 %	0 %	20 %	478451919
13081	NC_020929	CTG	2	6	663577	663582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451919
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13083	NC_020929	TTA	2	6	663625	663630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451919
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13085	NC_020929	TC	3	6	663691	663696	0 %	50 %	0 %	50 %	478451919
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13090	NC_020929	CTT	2	6	663827	663832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
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13092	NC_020929	TGA	2	6	663927	663932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451919
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13094	NC_020929	TTC	2	6	663987	663992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451919
13095	NC_020929	TCC	2	6	664026	664031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451919
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13099	NC_020929	A	7	7	664307	664313	100 %	0 %	0 %	0 %	478451920
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13101	NC_020929	CCA	2	6	664436	664441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451920
13102	NC_020929	AAT	2	6	664448	664453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451920
13103	NC_020929	AAG	2	6	664536	664541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451920
13104	NC_020929	AGC	2	6	664575	664580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451920
13105	NC_020929	TCT	2	6	664600	664605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451920
13106	NC_020929	TAA	2	6	664635	664640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451920
13107	NC_020929	ATA	2	6	664673	664678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451920
13108	NC_020929	TCT	2	6	664699	664704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451920
13109	NC_020929	GAA	2	6	664738	664743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451920
13110	NC_020929	AAG	2	6	664754	664759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451920
13111	NC_020929	CTG	2	6	664785	664790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451920
13112	NC_020929	CTA	2	6	664850	664855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451920
13113	NC_020929	TCA	2	6	664861	664866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451920
13114	NC_020929	GAAA	2	8	664880	664887	75 %	0 %	25 %	0 %	478451920
13115	NC_020929	GA	3	6	664924	664929	50 %	0 %	50 %	0 %	478451920
13116	NC_020929	TCA	2	6	664930	664935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451920
13117	NC_020929	TAA	2	6	664994	664999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451920
13118	NC_020929	AT	3	6	665004	665009	50 %	50 %	0 %	0 %	478451920
13119	NC_020929	A	6	6	665038	665043	100 %	0 %	0 %	0 %	478451920
13120	NC_020929	CA	3	6	665062	665067	50 %	0 %	0 %	50 %	478451920
13121	NC_020929	TC	3	6	665068	665073	0 %	50 %	0 %	50 %	478451920
13122	NC_020929	GCT	3	9	665158	665166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451920
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13489	NC_020929	CTT	2	6	682961	682966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451937
13490	NC_020929	ATCG	3	12	682994	683005	25 %	25 %	25 %	25 %	478451937
13491	NC_020929	TGC	2	6	683018	683023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451937
13492	NC_020929	TTTG	2	8	683128	683135	0 %	75 %	25 %	0 %	478451937
13493	NC_020929	AG	3	6	683272	683277	50 %	0 %	50 %	0 %	478451937
13494	NC_020929	CT	3	6	683289	683294	0 %	50 %	0 %	50 %	478451938
13495	NC_020929	ATC	2	6	683501	683506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451939
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13497	NC_020929	TAAT	2	8	683531	683538	50 %	50 %	0 %	0 %	478451939
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