MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020929	CAA	2	6	583483	583488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451839
11503	NC_020929	AAT	2	6	583580	583585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451839
11504	NC_020929	AT	3	6	583617	583622	50 %	50 %	0 %	0 %	478451839
11505	NC_020929	ATG	2	6	583668	583673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451839
11506	NC_020929	TCTT	2	8	583759	583766	0 %	75 %	0 %	25 %	478451840
11507	NC_020929	ACA	2	6	583927	583932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451840
11508	NC_020929	GGTT	2	8	583992	583999	0 %	50 %	50 %	0 %	478451840
11509	NC_020929	TTC	2	6	584035	584040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451840
11510	NC_020929	ATA	2	6	584101	584106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451840
11511	NC_020929	A	6	6	584117	584122	100 %	0 %	0 %	0 %	478451840
11512	NC_020929	AAG	2	6	584174	584179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451840
11513	NC_020929	GAAA	2	8	584188	584195	75 %	0 %	25 %	0 %	478451840
11514	NC_020929	CCT	2	6	584290	584295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451840
11515	NC_020929	CT	3	6	584301	584306	0 %	50 %	0 %	50 %	478451840
11516	NC_020929	AAT	2	6	584313	584318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451840
11517	NC_020929	TCTT	2	8	584342	584349	0 %	75 %	0 %	25 %	478451840
11518	NC_020929	AAT	2	6	584358	584363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451840
11519	NC_020929	GGAA	2	8	584484	584491	50 %	0 %	50 %	0 %	478451840
11520	NC_020929	TGT	2	6	584589	584594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451840
11521	NC_020929	AAATA	2	10	584614	584623	80 %	20 %	0 %	0 %	478451840
11522	NC_020929	ACA	2	6	584651	584656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451840
11523	NC_020929	AAC	2	6	584679	584684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451840
11524	NC_020929	ATTC	2	8	584688	584695	25 %	50 %	0 %	25 %	478451840
11525	NC_020929	GAC	2	6	584829	584834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451840
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11527	NC_020929	AAC	2	6	584871	584876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451840
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11529	NC_020929	GCAA	2	8	585037	585044	50 %	0 %	25 %	25 %	478451840
11530	NC_020929	T	6	6	585062	585067	0 %	100 %	0 %	0 %	478451840
11531	NC_020929	GCA	2	6	585179	585184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451841
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11533	NC_020929	TCTT	2	8	585262	585269	0 %	75 %	0 %	25 %	478451841
11534	NC_020929	GTTGT	2	10	585321	585330	0 %	60 %	40 %	0 %	478451841
11535	NC_020929	TTC	2	6	585334	585339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451841
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11537	NC_020929	TTC	2	6	585519	585524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451841
11538	NC_020929	ATA	2	6	585588	585593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451842
11539	NC_020929	AG	3	6	585605	585610	50 %	0 %	50 %	0 %	478451842
11540	NC_020929	ATT	2	6	585653	585658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451842
11541	NC_020929	CAT	2	6	585778	585783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451842
11542	NC_020929	TCC	2	6	585812	585817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451842
11543	NC_020929	T	6	6	585843	585848	0 %	100 %	0 %	0 %	478451842
11544	NC_020929	AGC	2	6	585851	585856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451842
11545	NC_020929	AAACT	2	10	585954	585963	60 %	20 %	0 %	20 %	478451842
11546	NC_020929	CCT	2	6	585969	585974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451842
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11548	NC_020929	ACA	2	6	585986	585991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451842
11549	NC_020929	GAC	2	6	585998	586003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451842
11550	NC_020929	CT	3	6	586090	586095	0 %	50 %	0 %	50 %	478451843
11551	NC_020929	CTA	2	6	586116	586121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451843
11552	NC_020929	CTC	2	6	586140	586145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451843
11553	NC_020929	AAC	2	6	586153	586158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451843
11554	NC_020929	T	6	6	586226	586231	0 %	100 %	0 %	0 %	478451843
11555	NC_020929	AAAT	2	8	586272	586279	75 %	25 %	0 %	0 %	478451843
11556	NC_020929	CAT	2	6	586299	586304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451843
11557	NC_020929	TA	3	6	586425	586430	50 %	50 %	0 %	0 %	478451843
11558	NC_020929	T	6	6	586468	586473	0 %	100 %	0 %	0 %	478451844
11559	NC_020929	GCT	2	6	586484	586489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451844
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11561	NC_020929	AACT	2	8	586591	586598	50 %	25 %	0 %	25 %	478451844
11562	NC_020929	GTCT	2	8	586833	586840	0 %	50 %	25 %	25 %	478451844
11563	NC_020929	CAA	2	6	586860	586865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451844
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11565	NC_020929	TCA	2	6	586949	586954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451844
11566	NC_020929	ACCAA	2	10	587046	587055	60 %	0 %	0 %	40 %	478451845
11567	NC_020929	CGC	2	6	587067	587072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451845
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11594	NC_020929	ATCAC	2	10	588608	588617	40 %	20 %	0 %	40 %	478451848
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11605	NC_020929	T	7	7	589003	589009	0 %	100 %	0 %	0 %	478451850
11606	NC_020929	TAT	2	6	589017	589022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451850
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11620	NC_020929	GGC	2	6	589485	589490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451851
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11991	NC_020929	ATT	2	6	609278	609283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451874
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11999	NC_020929	A	6	6	609507	609512	100 %	0 %	0 %	0 %	478451874
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