MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020929	GCA	2	6	558978	558983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451815
11002	NC_020929	GAT	2	6	558999	559004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451815
11003	NC_020929	AAG	2	6	559185	559190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451815
11004	NC_020929	A	6	6	559254	559259	100 %	0 %	0 %	0 %	478451815
11005	NC_020929	TCC	2	6	559271	559276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451815
11006	NC_020929	CTG	2	6	559285	559290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451815
11007	NC_020929	TGT	2	6	559388	559393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451815
11008	NC_020929	AAT	2	6	559442	559447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451815
11009	NC_020929	GA	3	6	559554	559559	50 %	0 %	50 %	0 %	478451815
11010	NC_020929	TC	3	6	559573	559578	0 %	50 %	0 %	50 %	478451815
11011	NC_020929	CCT	2	6	559604	559609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451815
11012	NC_020929	GAG	2	6	559635	559640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451815
11013	NC_020929	GGAA	2	8	559684	559691	50 %	0 %	50 %	0 %	478451815
11014	NC_020929	TCC	2	6	559696	559701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451815
11015	NC_020929	CGA	2	6	559865	559870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451816
11016	NC_020929	TCC	3	9	559915	559923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451816
11017	NC_020929	CTA	2	6	560001	560006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451816
11018	NC_020929	CAT	2	6	560040	560045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451816
11019	NC_020929	TA	3	6	560148	560153	50 %	50 %	0 %	0 %	478451816
11020	NC_020929	GA	3	6	560182	560187	50 %	0 %	50 %	0 %	478451816
11021	NC_020929	ACA	2	6	560210	560215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451816
11022	NC_020929	TAA	2	6	560230	560235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451816
11023	NC_020929	TCT	2	6	560307	560312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451816
11024	NC_020929	ATC	2	6	560314	560319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451816
11025	NC_020929	TAAT	2	8	560381	560388	50 %	50 %	0 %	0 %	478451816
11026	NC_020929	TTG	2	6	560443	560448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451816
11027	NC_020929	CGA	2	6	560472	560477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451816
11028	NC_020929	TC	3	6	560490	560495	0 %	50 %	0 %	50 %	478451816
11029	NC_020929	GAAA	2	8	560690	560697	75 %	0 %	25 %	0 %	478451817
11030	NC_020929	C	6	6	560701	560706	0 %	0 %	0 %	100 %	478451817
11031	NC_020929	TGT	2	6	560804	560809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451817
11032	NC_020929	GAA	2	6	560832	560837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451817
11033	NC_020929	AGG	2	6	560857	560862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451817
11034	NC_020929	TA	3	6	560866	560871	50 %	50 %	0 %	0 %	478451817
11035	NC_020929	GAAC	2	8	560918	560925	50 %	0 %	25 %	25 %	478451817
11036	NC_020929	CTA	2	6	561038	561043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451817
11037	NC_020929	AGATCC	2	12	561061	561072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478451817
11038	NC_020929	CAAA	2	8	561075	561082	75 %	0 %	0 %	25 %	478451817
11039	NC_020929	CCT	2	6	561132	561137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451817
11040	NC_020929	CAC	2	6	561139	561144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451817
11041	NC_020929	AGAA	2	8	561208	561215	75 %	0 %	25 %	0 %	478451817
11042	NC_020929	CAAA	2	8	561332	561339	75 %	0 %	0 %	25 %	478451818
11043	NC_020929	GA	3	6	561344	561349	50 %	0 %	50 %	0 %	478451818
11044	NC_020929	CCAT	2	8	561355	561362	25 %	25 %	0 %	50 %	478451818
11045	NC_020929	GGA	2	6	561409	561414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451818
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11047	NC_020929	GCTC	2	8	561466	561473	0 %	25 %	25 %	50 %	478451818
11048	NC_020929	ATC	2	6	561504	561509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451818
11049	NC_020929	CT	3	6	561524	561529	0 %	50 %	0 %	50 %	478451818
11050	NC_020929	CAT	2	6	561536	561541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451818
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11052	NC_020929	CAA	2	6	561593	561598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451818
11053	NC_020929	TGA	2	6	561604	561609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451818
11054	NC_020929	AGA	2	6	561678	561683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451818
11055	NC_020929	AAT	2	6	561695	561700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451818
11056	NC_020929	A	6	6	561745	561750	100 %	0 %	0 %	0 %	478451818
11057	NC_020929	CTT	2	6	561767	561772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451818
11058	NC_020929	ACAA	2	8	561807	561814	75 %	0 %	0 %	25 %	478451818
11059	NC_020929	ATC	2	6	561816	561821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451818
11060	NC_020929	TC	3	6	561835	561840	0 %	50 %	0 %	50 %	478451818
11061	NC_020929	T	6	6	561854	561859	0 %	100 %	0 %	0 %	478451818
11062	NC_020929	CCCA	2	8	561868	561875	25 %	0 %	0 %	75 %	478451818
11063	NC_020929	CT	3	6	562038	562043	0 %	50 %	0 %	50 %	478451819
11064	NC_020929	GAT	2	6	562084	562089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451819
11065	NC_020929	AAC	2	6	562102	562107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451819
11066	NC_020929	CAG	2	6	562178	562183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451819
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11068	NC_020929	CAT	2	6	562267	562272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451819
11069	NC_020929	CA	3	6	562365	562370	50 %	0 %	0 %	50 %	478451819
11070	NC_020929	AAT	2	6	562399	562404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451819
11071	NC_020929	GAT	2	6	562416	562421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451819
11072	NC_020929	C	6	6	562441	562446	0 %	0 %	0 %	100 %	478451819
11073	NC_020929	TCA	2	6	562448	562453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451819
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11092	NC_020929	CTA	2	6	563724	563729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451820
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11105	NC_020929	T	6	6	564789	564794	0 %	100 %	0 %	0 %	478451821
11106	NC_020929	ACG	2	6	564804	564809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451821
11107	NC_020929	TCT	2	6	564835	564840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451821
11108	NC_020929	GGAA	2	8	564843	564850	50 %	0 %	50 %	0 %	478451821
11109	NC_020929	TCA	2	6	564928	564933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451821
11110	NC_020929	TTTC	2	8	565091	565098	0 %	75 %	0 %	25 %	478451821
11111	NC_020929	TCT	2	6	565099	565104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451821
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11113	NC_020929	CT	3	6	565201	565206	0 %	50 %	0 %	50 %	478451821
11114	NC_020929	CGA	2	6	565254	565259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451822
11115	NC_020929	TTC	2	6	565262	565267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451822
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11118	NC_020929	AGA	2	6	565322	565327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451822
11119	NC_020929	T	7	7	565372	565378	0 %	100 %	0 %	0 %	478451822
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