MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020929	TC	3	6	508402	508407	0 %	50 %	0 %	50 %	478451769
10003	NC_020929	TAGA	2	8	508480	508487	50 %	25 %	25 %	0 %	478451769
10004	NC_020929	AGT	2	6	508541	508546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451769
10005	NC_020929	CAC	2	6	508552	508557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451769
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10007	NC_020929	AAC	2	6	508672	508677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451769
10008	NC_020929	TG	3	6	508878	508883	0 %	50 %	50 %	0 %	478451770
10009	NC_020929	GAA	2	6	508922	508927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451770
10010	NC_020929	CGAAT	2	10	509017	509026	40 %	20 %	20 %	20 %	478451770
10011	NC_020929	ACT	2	6	509027	509032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451770
10012	NC_020929	TCT	2	6	509123	509128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451770
10013	NC_020929	CTA	2	6	509199	509204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451770
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10016	NC_020929	AGC	2	6	509280	509285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451770
10017	NC_020929	CAA	2	6	509292	509297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451770
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10019	NC_020929	ACT	2	6	509387	509392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451770
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10022	NC_020929	TACT	2	8	509553	509560	25 %	50 %	0 %	25 %	478451770
10023	NC_020929	GTT	2	6	509585	509590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451770
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10028	NC_020929	ACT	2	6	509831	509836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451770
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10032	NC_020929	CAG	2	6	510042	510047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451770
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10034	NC_020929	ATC	2	6	510214	510219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451770
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10036	NC_020929	T	6	6	510346	510351	0 %	100 %	0 %	0 %	478451770
10037	NC_020929	AGCTA	2	10	510388	510397	40 %	20 %	20 %	20 %	478451770
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10040	NC_020929	TCTT	2	8	510811	510818	0 %	75 %	0 %	25 %	478451771
10041	NC_020929	ACA	2	6	510885	510890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451771
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10044	NC_020929	AGC	2	6	510918	510923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451771
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10053	NC_020929	TGC	3	9	511560	511568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451773
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10056	NC_020929	ATG	2	6	511721	511726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451773
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10073	NC_020929	AGA	2	6	512337	512342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451773
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10077	NC_020929	TCC	2	6	512630	512635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451773
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10085	NC_020929	CTTC	2	8	513389	513396	0 %	50 %	0 %	50 %	478451774
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10091	NC_020929	TGC	2	6	513787	513792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451774
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10101	NC_020929	ATCC	2	8	514579	514586	25 %	25 %	0 %	50 %	478451775
10102	NC_020929	CAT	2	6	514614	514619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451775
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10105	NC_020929	TCT	2	6	514679	514684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451775
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10107	NC_020929	GAA	2	6	514749	514754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451775
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10111	NC_020929	CAG	2	6	515004	515009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451775
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10113	NC_020929	CGA	2	6	515137	515142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451775
10114	NC_020929	T	6	6	515180	515185	0 %	100 %	0 %	0 %	478451775
10115	NC_020929	TC	3	6	515244	515249	0 %	50 %	0 %	50 %	478451775
10116	NC_020929	A	6	6	515297	515302	100 %	0 %	0 %	0 %	478451775
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10121	NC_020929	TGCAA	2	10	515446	515455	40 %	20 %	20 %	20 %	478451775
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10233	NC_020929	TTCT	2	8	522619	522626	0 %	75 %	0 %	25 %	478451779
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10480	NC_020929	CGA	2	6	533116	533121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451787
10481	NC_020929	ATCG	2	8	533164	533171	25 %	25 %	25 %	25 %	478451787
10482	NC_020929	ACT	2	6	533195	533200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451787
10483	NC_020929	GCA	2	6	533221	533226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451787
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10485	NC_020929	AGAA	2	8	533309	533316	75 %	0 %	25 %	0 %	478451787
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