MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_020929	TTCT	3	12	408630	408641	0 %	75 %	0 %	25 %	478451684
8003	NC_020929	CT	3	6	408640	408645	0 %	50 %	0 %	50 %	478451684
8004	NC_020929	CTG	2	6	408674	408679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451684
8005	NC_020929	AATG	2	8	408681	408688	50 %	25 %	25 %	0 %	478451684
8006	NC_020929	AGCA	2	8	408745	408752	50 %	0 %	25 %	25 %	478451684
8007	NC_020929	TCTCT	2	10	409023	409032	0 %	60 %	0 %	40 %	478451685
8008	NC_020929	TTC	2	6	409149	409154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451685
8009	NC_020929	GAC	2	6	409168	409173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451685
8010	NC_020929	GTC	2	6	409271	409276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451685
8011	NC_020929	AATC	2	8	409555	409562	50 %	25 %	0 %	25 %	478451685
8012	NC_020929	AAAC	2	8	409633	409640	75 %	0 %	0 %	25 %	478451685
8013	NC_020929	AAATA	2	10	409697	409706	80 %	20 %	0 %	0 %	478451685
8014	NC_020929	CGAA	2	8	409730	409737	50 %	0 %	25 %	25 %	478451685
8015	NC_020929	CT	3	6	409743	409748	0 %	50 %	0 %	50 %	478451685
8016	NC_020929	AGC	2	6	409751	409756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451685
8017	NC_020929	CAA	2	6	409844	409849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451686
8018	NC_020929	TTA	2	6	409875	409880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451686
8019	NC_020929	AATTA	2	10	409883	409892	60 %	40 %	0 %	0 %	478451686
8020	NC_020929	AGCT	2	8	409970	409977	25 %	25 %	25 %	25 %	478451686
8021	NC_020929	CTT	2	6	410281	410286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451686
8022	NC_020929	CT	3	6	410489	410494	0 %	50 %	0 %	50 %	478451686
8023	NC_020929	AG	3	6	410517	410522	50 %	0 %	50 %	0 %	478451686
8024	NC_020929	C	6	6	410537	410542	0 %	0 %	0 %	100 %	478451686
8025	NC_020929	TCT	2	6	410610	410615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451686
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8029	NC_020929	CT	3	6	410932	410937	0 %	50 %	0 %	50 %	478451686
8030	NC_020929	AAC	3	9	410996	411004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451686
8031	NC_020929	TCTT	2	8	411014	411021	0 %	75 %	0 %	25 %	478451686
8032	NC_020929	TCG	2	6	411041	411046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451686
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8034	NC_020929	T	6	6	411103	411108	0 %	100 %	0 %	0 %	478451686
8035	NC_020929	CT	3	6	411127	411132	0 %	50 %	0 %	50 %	478451687
8036	NC_020929	TGA	2	6	411133	411138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451687
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8042	NC_020929	TCT	2	6	411376	411381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451687
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8044	NC_020929	TCT	2	6	411521	411526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451687
8045	NC_020929	ACATGC	2	12	411622	411633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478451687
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8047	NC_020929	ACA	2	6	411684	411689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451687
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8052	NC_020929	CTG	2	6	411848	411853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451687
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8054	NC_020929	ACA	2	6	411883	411888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451687
8055	NC_020929	AACGC	2	10	411986	411995	40 %	0 %	20 %	40 %	478451687
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8057	NC_020929	CAA	2	6	412073	412078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451687
8058	NC_020929	AAAC	2	8	412146	412153	75 %	0 %	0 %	25 %	478451688
8059	NC_020929	TCT	2	6	412208	412213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451688
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8062	NC_020929	CT	3	6	412378	412383	0 %	50 %	0 %	50 %	478451688
8063	NC_020929	CAT	2	6	412475	412480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451688
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8066	NC_020929	GCT	2	6	412510	412515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451688
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8088	NC_020929	TGA	2	6	413610	413615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451689
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8106	NC_020929	T	7	7	414233	414239	0 %	100 %	0 %	0 %	478451689
8107	NC_020929	CTC	2	6	414289	414294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451689
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8118	NC_020929	TCTCT	2	10	415100	415109	0 %	60 %	0 %	40 %	478451690
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8121	NC_020929	CCCCCA	2	12	415285	415296	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	478451690
8122	NC_020929	CA	3	6	415314	415319	50 %	0 %	0 %	50 %	478451690
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8495	NC_020929	CT	3	6	432526	432531	0 %	50 %	0 %	50 %	478451706
8496	NC_020929	GCA	2	6	432579	432584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451706
8497	NC_020929	CTG	2	6	432715	432720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451706
8498	NC_020929	AAT	2	6	432762	432767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451706
8499	NC_020929	GTTC	2	8	432836	432843	0 %	50 %	25 %	25 %	478451706
8500	NC_020929	AAT	2	6	432947	432952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451706

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