MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020929	CT	3	6	257423	257428	0 %	50 %	0 %	50 %	478451554
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5004	NC_020929	CT	3	6	257451	257456	0 %	50 %	0 %	50 %	478451554
5005	NC_020929	ACCTTT	2	12	257490	257501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478451554
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5012	NC_020929	CTT	2	6	257933	257938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451554
5013	NC_020929	ATT	2	6	257958	257963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451554
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5015	NC_020929	CAT	2	6	258112	258117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451554
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5041	NC_020929	TAA	2	6	258975	258980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451554
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5112	NC_020929	CA	3	6	263333	263338	50 %	0 %	0 %	50 %	478451559
5113	NC_020929	GCA	2	6	263460	263465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451559
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5119	NC_020929	TCATT	2	10	263903	263912	20 %	60 %	0 %	20 %	478451560
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5371	NC_020929	CAT	2	6	275745	275750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451568
5372	NC_020929	CTT	2	6	275799	275804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451568
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5375	NC_020929	GTA	2	6	275878	275883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451568
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5402	NC_020929	A	6	6	277182	277187	100 %	0 %	0 %	0 %	478451570
5403	NC_020929	TAAT	2	8	277249	277256	50 %	50 %	0 %	0 %	478451570
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5478	NC_020929	AAGC	2	8	281354	281361	50 %	0 %	25 %	25 %	478451572
5479	NC_020929	ATG	2	6	281371	281376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451572
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5483	NC_020929	A	7	7	281488	281494	100 %	0 %	0 %	0 %	478451572
5484	NC_020929	AG	3	6	281555	281560	50 %	0 %	50 %	0 %	478451572
5485	NC_020929	CTT	2	6	281858	281863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451573
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5488	NC_020929	GTC	2	6	281968	281973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451573
5489	NC_020929	T	6	6	281987	281992	0 %	100 %	0 %	0 %	478451573
5490	NC_020929	ACT	2	6	282015	282020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
5491	NC_020929	ACT	2	6	282084	282089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
5492	NC_020929	TGC	2	6	282120	282125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451573
5493	NC_020929	T	7	7	282130	282136	0 %	100 %	0 %	0 %	478451573
5494	NC_020929	CTCCTA	2	12	282137	282148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478451573
5495	NC_020929	AAC	2	6	282222	282227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451573
5496	NC_020929	TC	3	6	282337	282342	0 %	50 %	0 %	50 %	478451573
5497	NC_020929	ATC	2	6	282362	282367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
5498	NC_020929	TGGC	2	8	282372	282379	0 %	25 %	50 %	25 %	478451573
5499	NC_020929	TTCGA	2	10	282391	282400	20 %	40 %	20 %	20 %	478451573
5500	NC_020929	ATT	2	6	282426	282431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451573

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