MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 89737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020891	CGC	2	6	339776	339781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832373
10003	NC_020891	TCG	2	6	339805	339810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10004	NC_020891	GCC	2	6	339822	339827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832373
10005	NC_020891	TGA	2	6	339889	339894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832373
10006	NC_020891	CGG	2	6	339923	339928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832373
10007	NC_020891	GAT	2	6	339968	339973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832373
10008	NC_020891	CGC	2	6	339989	339994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832373
10009	NC_020891	CGT	2	6	339995	340000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10010	NC_020891	TGC	2	6	340021	340026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10011	NC_020891	TCGC	2	8	340068	340075	0 %	25 %	25 %	50 %	473832373
10012	NC_020891	CTT	2	6	340121	340126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832373
10013	NC_020891	CCA	2	6	340129	340134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832373
10014	NC_020891	TCG	2	6	340138	340143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10015	NC_020891	GGCG	2	8	340151	340158	0 %	0 %	75 %	25 %	473832373
10016	NC_020891	ATC	2	6	340173	340178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832373
10017	NC_020891	ACG	2	6	340224	340229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10018	NC_020891	TGC	2	6	340243	340248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10019	NC_020891	CTC	2	6	340251	340256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832373
10020	NC_020891	AGC	2	6	340258	340263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10021	NC_020891	GCA	2	6	340265	340270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10022	NC_020891	TGC	2	6	340273	340278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10023	NC_020891	GCT	2	6	340328	340333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10024	NC_020891	GTC	2	6	340365	340370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
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10026	NC_020891	GTG	2	6	340410	340415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832373
10027	NC_020891	GTC	2	6	340425	340430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10028	NC_020891	TCG	2	6	340432	340437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10029	NC_020891	GTC	2	6	340440	340445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10030	NC_020891	CGC	2	6	340470	340475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832373
10031	NC_020891	GAGC	2	8	340580	340587	25 %	0 %	50 %	25 %	473832373
10032	NC_020891	TCG	2	6	340657	340662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10033	NC_020891	GGC	2	6	340683	340688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832373
10034	NC_020891	TGC	2	6	340711	340716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832373
10035	NC_020891	TCC	2	6	340735	340740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832373
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10039	NC_020891	CGG	3	9	340975	340983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832373
10040	NC_020891	GAG	2	6	341004	341009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832373
10041	NC_020891	CGG	2	6	341014	341019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832373
10042	NC_020891	GCG	2	6	341046	341051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832373
10043	NC_020891	CG	3	6	341050	341055	0 %	0 %	50 %	50 %	473832373
10044	NC_020891	CG	3	6	341071	341076	0 %	0 %	50 %	50 %	473832373
10045	NC_020891	CG	3	6	341258	341263	0 %	0 %	50 %	50 %	473832374
10046	NC_020891	CG	3	6	341271	341276	0 %	0 %	50 %	50 %	473832374
10047	NC_020891	TTC	2	6	341303	341308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832374
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10050	NC_020891	TCG	2	6	341436	341441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832374
10051	NC_020891	CG	3	6	341440	341445	0 %	0 %	50 %	50 %	473832374
10052	NC_020891	TCG	2	6	341496	341501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832374
10053	NC_020891	TCC	2	6	341507	341512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832374
10054	NC_020891	GCT	2	6	341545	341550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832374
10055	NC_020891	CCT	2	6	341551	341556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832374
10056	NC_020891	CGCGG	2	10	341558	341567	0 %	0 %	60 %	40 %	473832374
10057	NC_020891	GCT	3	9	341608	341616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832374
10058	NC_020891	CCGGGC	2	12	341638	341649	0 %	0 %	50 %	50 %	473832374
10059	NC_020891	GGC	2	6	341666	341671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832374
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10068	NC_020891	GCT	2	6	341950	341955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832374
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10102	NC_020891	CG	3	6	342826	342831	0 %	0 %	50 %	50 %	473832375
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10235	NC_020891	GGA	2	6	346769	346774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832377
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10475	NC_020891	ACG	2	6	356579	356584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832388
10476	NC_020891	GCG	2	6	356605	356610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832388
10477	NC_020891	CGG	2	6	356614	356619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832388
10478	NC_020891	GCG	2	6	356633	356638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832388
10479	NC_020891	CG	3	6	356656	356661	0 %	0 %	50 %	50 %	473832388
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