MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 89737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020891	CGC	3	9	189161	189169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832245
5502	NC_020891	GAT	2	6	189353	189358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832246
5503	NC_020891	GCC	2	6	189378	189383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832246
5504	NC_020891	CTT	2	6	189413	189418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832246
5505	NC_020891	CGCGC	2	10	189431	189440	0 %	0 %	40 %	60 %	473832246
5506	NC_020891	CGT	2	6	189449	189454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5507	NC_020891	GC	3	6	189468	189473	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5508	NC_020891	GCTGGG	2	12	189493	189504	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	473832246
5509	NC_020891	GC	3	6	189506	189511	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5510	NC_020891	GC	3	6	189524	189529	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5511	NC_020891	CG	4	8	189536	189543	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5512	NC_020891	CGT	2	6	189554	189559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5513	NC_020891	GCA	2	6	189577	189582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5514	NC_020891	GGTCGC	2	12	189593	189604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832246
5515	NC_020891	GAG	2	6	189660	189665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832246
5516	NC_020891	GGC	2	6	189677	189682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832246
5517	NC_020891	GGC	3	9	189695	189703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832246
5518	NC_020891	CG	3	6	189714	189719	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5519	NC_020891	CCG	2	6	189737	189742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832246
5520	NC_020891	TCG	2	6	189772	189777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5521	NC_020891	GC	4	8	189809	189816	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5522	NC_020891	AGG	2	6	189874	189879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832246
5523	NC_020891	CGG	2	6	189880	189885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832246
5524	NC_020891	GC	3	6	189910	189915	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5525	NC_020891	TCG	2	6	189919	189924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5526	NC_020891	TCA	2	6	189937	189942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832246
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5528	NC_020891	TCG	2	6	189985	189990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5529	NC_020891	GCT	2	6	190001	190006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
5530	NC_020891	CG	3	6	190015	190020	0 %	0 %	50 %	50 %	473832246
5531	NC_020891	CGG	2	6	190025	190030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832246
5532	NC_020891	CGTCG	2	10	190031	190040	0 %	20 %	40 %	40 %	473832246
5533	NC_020891	AGCG	2	8	190041	190048	25 %	0 %	50 %	25 %	473832246
5534	NC_020891	CGA	2	6	190064	190069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832246
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5539	NC_020891	CCGAGC	2	12	190279	190290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832246
5540	NC_020891	GTG	2	6	190307	190312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832246
5541	NC_020891	CGC	2	6	190382	190387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832246
5542	NC_020891	CGT	2	6	190405	190410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832246
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5544	NC_020891	ACG	2	6	190685	190690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832247
5545	NC_020891	GGC	2	6	190705	190710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832247
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5547	NC_020891	GCCC	2	8	190726	190733	0 %	0 %	25 %	75 %	473832247
5548	NC_020891	CG	3	6	190768	190773	0 %	0 %	50 %	50 %	473832247
5549	NC_020891	CGG	2	6	190801	190806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832247
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5553	NC_020891	CGA	2	6	190915	190920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832247
5554	NC_020891	CGA	2	6	190924	190929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832247
5555	NC_020891	ACG	2	6	190959	190964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832247
5556	NC_020891	CGA	2	6	191014	191019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832247
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5558	NC_020891	TAC	2	6	191114	191119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832247
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5560	NC_020891	CCTC	2	8	191240	191247	0 %	25 %	0 %	75 %	473832248
5561	NC_020891	GC	3	6	191270	191275	0 %	0 %	50 %	50 %	473832248
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5565	NC_020891	GCTC	2	8	191417	191424	0 %	25 %	25 %	50 %	473832248
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5985	NC_020891	CGC	2	6	204579	204584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832265
5986	NC_020891	CGA	2	6	204647	204652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832265
5987	NC_020891	GGC	2	6	204675	204680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832265
5988	NC_020891	GTC	2	6	204687	204692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832265
5989	NC_020891	GGCG	2	8	204693	204700	0 %	0 %	75 %	25 %	473832265
5990	NC_020891	CGGC	2	8	204701	204708	0 %	0 %	50 %	50 %	473832265
5991	NC_020891	CGG	2	6	204736	204741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832265
5992	NC_020891	CGG	2	6	204749	204754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832265
5993	NC_020891	GAG	2	6	204763	204768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832265
5994	NC_020891	GCG	2	6	204827	204832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832265
5995	NC_020891	ACG	2	6	204838	204843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832265
5996	NC_020891	GACG	2	8	204849	204856	25 %	0 %	50 %	25 %	473832265
5997	NC_020891	GTC	2	6	204875	204880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832265
5998	NC_020891	CTC	3	9	204888	204896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832265
5999	NC_020891	ATG	2	6	204916	204921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832265
6000	NC_020891	CATGAC	2	12	205134	205145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	473832266

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