MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	ACAA	2	8	425	432	75 %	0 %	0 %	25 %	472465461
2	NC_020887	AGT	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
3	NC_020887	ATT	3	9	507	515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
4	NC_020887	T	6	6	631	636	0 %	100 %	0 %	0 %	472465461
5	NC_020887	CGG	2	6	643	648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465461
6	NC_020887	GAACA	2	10	701	710	60 %	0 %	20 %	20 %	472465461
7	NC_020887	TGTA	2	8	726	733	25 %	50 %	25 %	0 %	472465461
8	NC_020887	TTA	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
9	NC_020887	GAT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
10	NC_020887	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
11	NC_020887	CTT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465461
12	NC_020887	GAA	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
13	NC_020887	ATT	2	6	923	928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
14	NC_020887	GGA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465461
15	NC_020887	A	6	6	1052	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	472465461
16	NC_020887	TGA	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
17	NC_020887	AT	3	6	1099	1104	50 %	50 %	0 %	0 %	472465461
18	NC_020887	GTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465461
19	NC_020887	AGC	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465461
20	NC_020887	ATA	2	6	1268	1273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465461
21	NC_020887	GAAA	2	8	1320	1327	75 %	0 %	25 %	0 %	472465461
22	NC_020887	TCTT	2	8	1390	1397	0 %	75 %	0 %	25 %	472465461
23	NC_020887	GGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465461
24	NC_020887	AGAA	2	8	1477	1484	75 %	0 %	25 %	0 %	472465461
25	NC_020887	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
26	NC_020887	GAA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
27	NC_020887	TAA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465462
28	NC_020887	TAC	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
29	NC_020887	GGAA	2	8	1913	1920	50 %	0 %	50 %	0 %	472465462
30	NC_020887	TAC	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
31	NC_020887	CAT	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
32	NC_020887	TGT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465462
33	NC_020887	GAA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465462
34	NC_020887	CAG	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465462
35	NC_020887	AT	3	6	2244	2249	50 %	50 %	0 %	0 %	472465462
36	NC_020887	ATG	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465462
37	NC_020887	AAAAT	2	10	2269	2278	80 %	20 %	0 %	0 %	472465462
38	NC_020887	GTT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465462
39	NC_020887	A	6	6	2405	2410	100 %	0 %	0 %	0 %	472465462
40	NC_020887	AT	3	6	2421	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	472465462
41	NC_020887	TGA	2	6	2444	2449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465462
42	NC_020887	TTTG	2	8	2483	2490	0 %	75 %	25 %	0 %	472465462
43	NC_020887	AAT	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465462
44	NC_020887	GA	3	6	2616	2621	50 %	0 %	50 %	0 %	472465462
45	NC_020887	GAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465462
46	NC_020887	ATT	2	6	2667	2672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465462
47	NC_020887	ATTT	2	8	2826	2833	25 %	75 %	0 %	0 %	472465462
48	NC_020887	TG	3	6	2853	2858	0 %	50 %	50 %	0 %	472465462
49	NC_020887	ATA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
50	NC_020887	T	7	7	3137	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	472465463
51	NC_020887	ATA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
52	NC_020887	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
53	NC_020887	AAATA	2	10	3190	3199	80 %	20 %	0 %	0 %	472465463
54	NC_020887	A	6	6	3216	3221	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
55	NC_020887	ATG	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
56	NC_020887	A	7	7	3239	3245	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
57	NC_020887	A	6	6	3247	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
58	NC_020887	GTT	2	6	3270	3275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465463
59	NC_020887	T	6	6	3286	3291	0 %	100 %	0 %	0 %	472465463
60	NC_020887	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
61	NC_020887	TAAAAA	2	12	3413	3424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472465463
62	NC_020887	TAT	2	6	3427	3432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
63	NC_020887	A	9	9	3434	3442	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
64	NC_020887	AGAT	2	8	3457	3464	50 %	25 %	25 %	0 %	472465463
65	NC_020887	AAG	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
66	NC_020887	A	6	6	3538	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
67	NC_020887	GAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
68	NC_020887	A	6	6	3659	3664	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
69	NC_020887	CAG	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465463
70	NC_020887	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465463
71	NC_020887	A	6	6	3826	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	472465463
72	NC_020887	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
73	NC_020887	ATT	2	6	3895	3900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
74	NC_020887	TAA	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
75	NC_020887	GAT	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
76	NC_020887	CGTA	2	8	3982	3989	25 %	25 %	25 %	25 %	472465463
77	NC_020887	AAT	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
78	NC_020887	T	6	6	4160	4165	0 %	100 %	0 %	0 %	472465464
79	NC_020887	GGA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465464
80	NC_020887	TAA	2	6	4231	4236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
81	NC_020887	TAA	2	6	4253	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
82	NC_020887	CT	3	6	4266	4271	0 %	50 %	0 %	50 %	472465464
83	NC_020887	CAA	2	6	4279	4284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465464
84	NC_020887	TA	3	6	4291	4296	50 %	50 %	0 %	0 %	472465464
85	NC_020887	A	6	6	4308	4313	100 %	0 %	0 %	0 %	472465464
86	NC_020887	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
87	NC_020887	A	6	6	4371	4376	100 %	0 %	0 %	0 %	472465465
88	NC_020887	ATG	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465465
89	NC_020887	GTAT	2	8	4435	4442	25 %	50 %	25 %	0 %	472465465
90	NC_020887	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
91	NC_020887	TGA	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465465
92	NC_020887	ATT	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465465
93	NC_020887	GTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465465
94	NC_020887	TTCA	2	8	4654	4661	25 %	50 %	0 %	25 %	472465465
95	NC_020887	G	6	6	4698	4703	0 %	0 %	100 %	0 %	472465465
96	NC_020887	TGC	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465465
97	NC_020887	ATGG	2	8	4745	4752	25 %	25 %	50 %	0 %	472465465
98	NC_020887	ACAG	2	8	4783	4790	50 %	0 %	25 %	25 %	472465465
99	NC_020887	TAC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
100	NC_020887	T	6	6	4943	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	472465465
101	NC_020887	AT	3	6	5045	5050	50 %	50 %	0 %	0 %	472465465
102	NC_020887	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465465
103	NC_020887	CAT	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
104	NC_020887	AT	3	6	5085	5090	50 %	50 %	0 %	0 %	472465465
105	NC_020887	GAGATA	2	12	5115	5126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472465465
106	NC_020887	GGC	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
107	NC_020887	GGC	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
108	NC_020887	TAAT	2	8	5239	5246	50 %	50 %	0 %	0 %	472465465
109	NC_020887	GGAA	2	8	5312	5319	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
110	NC_020887	TTG	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465465
111	NC_020887	GGA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465465
112	NC_020887	AAT	2	6	5471	5476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
113	NC_020887	AAGG	2	8	5519	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
114	NC_020887	TG	3	6	5614	5619	0 %	50 %	50 %	0 %	472465465
115	NC_020887	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465465
116	NC_020887	GGAG	2	8	5633	5640	25 %	0 %	75 %	0 %	472465465
117	NC_020887	CGG	2	6	5648	5653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
118	NC_020887	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
119	NC_020887	TTC	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465465
120	NC_020887	ATA	2	6	5772	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
121	NC_020887	TAA	2	6	5842	5847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
122	NC_020887	TCA	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
123	NC_020887	GCT	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465465
124	NC_020887	T	6	6	5897	5902	0 %	100 %	0 %	0 %	472465465
125	NC_020887	TTGA	2	8	5922	5929	25 %	50 %	25 %	0 %	472465465
126	NC_020887	CCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472465465
127	NC_020887	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
128	NC_020887	TA	3	6	5998	6003	50 %	50 %	0 %	0 %	472465465
129	NC_020887	GAAG	2	8	6054	6061	50 %	0 %	50 %	0 %	472465465
130	NC_020887	ACA	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465465
131	NC_020887	AAT	2	6	6165	6170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
132	NC_020887	A	6	6	6251	6256	100 %	0 %	0 %	0 %	472465465
133	NC_020887	TAA	2	6	6260	6265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
134	NC_020887	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
135	NC_020887	ACCATA	2	12	6843	6854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472465466
136	NC_020887	T	9	9	6858	6866	0 %	100 %	0 %	0 %	472465466
137	NC_020887	TAT	2	6	6871	6876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465466
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268	NC_020887	GGT	2	6	15352	15357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472465472
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275	NC_020887	CGTATA	2	12	15713	15724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472465473
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385	NC_020887	ATTGG	2	10	22672	22681	20 %	40 %	40 %	0 %	537432304
386	NC_020887	AAGG	2	8	22854	22861	50 %	0 %	50 %	0 %	537432304
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388	NC_020887	TA	3	6	22992	22997	50 %	50 %	0 %	0 %	537432304
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392	NC_020887	AT	3	6	23198	23203	50 %	50 %	0 %	0 %	537432304
393	NC_020887	ATC	2	6	23253	23258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537432304
394	NC_020887	GGC	2	6	23289	23294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537432304
395	NC_020887	TTG	2	6	23317	23322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537432304
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