MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 9283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328234
2	NC_020831	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328234
3	NC_020831	GAT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
4	NC_020831	AGC	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472328234
5	NC_020831	ATG	3	9	233	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
6	NC_020831	GTCAAA	2	12	307	318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472328234
7	NC_020831	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
8	NC_020831	CAC	3	9	332	340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472328234
9	NC_020831	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
10	NC_020831	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
11	NC_020831	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328234
12	NC_020831	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
13	NC_020831	TTA	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328234
14	NC_020831	TAAT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
15	NC_020831	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472328234
16	NC_020831	A	7	7	562	568	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
17	NC_020831	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472328234
18	NC_020831	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
19	NC_020831	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	472328234
20	NC_020831	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472328234
21	NC_020831	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
22	NC_020831	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
23	NC_020831	TA	3	6	715	720	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
24	NC_020831	GTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472328234
25	NC_020831	GCT	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472328234
26	NC_020831	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472328234
27	NC_020831	TA	3	6	853	858	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
28	NC_020831	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472328234
29	NC_020831	TTAA	2	8	934	941	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
30	NC_020831	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
31	NC_020831	GAT	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
32	NC_020831	TAA	2	6	990	995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
33	NC_020831	TGA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
34	NC_020831	TAG	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
35	NC_020831	A	8	8	1049	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
36	NC_020831	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	472328234
37	NC_020831	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
38	NC_020831	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472328234
39	NC_020831	TAT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328234
40	NC_020831	TTA	2	6	1171	1176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328234
41	NC_020831	G	6	6	1212	1217	0 %	0 %	100 %	0 %	472328234
42	NC_020831	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
43	NC_020831	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328234
44	NC_020831	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328234
45	NC_020831	A	7	7	1261	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
46	NC_020831	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	472328234
47	NC_020831	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472328234
48	NC_020831	CAG	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472328234
49	NC_020831	GAAA	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	472328234
50	NC_020831	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
51	NC_020831	AAAT	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	472328234
52	NC_020831	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	472328234
53	NC_020831	ACC	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472328234
54	NC_020831	TCT	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328234
55	NC_020831	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472328234
56	NC_020831	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	472328234
57	NC_020831	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
58	NC_020831	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
59	NC_020831	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
60	NC_020831	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
61	NC_020831	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
62	NC_020831	TAAT	2	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	472328234
63	NC_020831	GAA	2	6	1708	1713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
64	NC_020831	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328234
65	NC_020831	A	8	8	1734	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
66	NC_020831	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
67	NC_020831	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
68	NC_020831	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
69	NC_020831	A	8	8	1807	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
70	NC_020831	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
71	NC_020831	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
72	NC_020831	A	6	6	1831	1836	100 %	0 %	0 %	0 %	472328234
73	NC_020831	GAA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328234
74	NC_020831	TAA	3	9	1872	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328234
75	NC_020831	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472328234
76	NC_020831	ATT	2	6	1918	1923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328235
77	NC_020831	ATC	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328235
78	NC_020831	A	6	6	2035	2040	100 %	0 %	0 %	0 %	472328235
79	NC_020831	A	6	6	2086	2091	100 %	0 %	0 %	0 %	472328235
80	NC_020831	CAAA	2	8	2136	2143	75 %	0 %	0 %	25 %	472328235
81	NC_020831	TAA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328235
82	NC_020831	GAA	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472328235
83	NC_020831	TA	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	472328235
84	NC_020831	A	7	7	2309	2315	100 %	0 %	0 %	0 %	472328235
85	NC_020831	T	8	8	2420	2427	0 %	100 %	0 %	0 %	472328235
86	NC_020831	ACA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472328235
87	NC_020831	A	9	9	2520	2528	100 %	0 %	0 %	0 %	472328235
88	NC_020831	GGT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472328235
89	NC_020831	GCA	2	6	2715	2720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472328235
90	NC_020831	GGT	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472328235
91	NC_020831	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328235
92	NC_020831	TAAAGG	2	12	2813	2824	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472328235
93	NC_020831	GTA	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328235
94	NC_020831	TAA	2	6	2897	2902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328235
95	NC_020831	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328235
96	NC_020831	ATA	2	6	2944	2949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328235
97	NC_020831	TAATT	2	10	3010	3019	40 %	60 %	0 %	0 %	472328236
98	NC_020831	TAT	2	6	3027	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
99	NC_020831	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
100	NC_020831	AAT	2	6	3106	3111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328236
101	NC_020831	TA	3	6	3195	3200	50 %	50 %	0 %	0 %	472328236
102	NC_020831	CTT	2	6	3216	3221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328236
103	NC_020831	AATT	2	8	3258	3265	50 %	50 %	0 %	0 %	472328236
104	NC_020831	TTA	3	9	3266	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
105	NC_020831	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328236
106	NC_020831	TAG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328236
107	NC_020831	ACC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472328236
108	NC_020831	ATTAC	2	10	3401	3410	40 %	40 %	0 %	20 %	472328236
109	NC_020831	TAG	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472328236
110	NC_020831	T	7	7	3430	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
111	NC_020831	TTA	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
112	NC_020831	TAA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328236
113	NC_020831	T	6	6	3476	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
114	NC_020831	TTA	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
115	NC_020831	T	7	7	3535	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
116	NC_020831	TCA	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328236
117	NC_020831	CTA	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328236
118	NC_020831	ATT	2	6	3635	3640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
119	NC_020831	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
120	NC_020831	TTTG	2	8	3652	3659	0 %	75 %	25 %	0 %	472328236
121	NC_020831	TTA	2	6	3660	3665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
122	NC_020831	CAC	2	6	3732	3737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472328236
123	NC_020831	TCT	2	6	3809	3814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328236
124	NC_020831	CCG	2	6	3868	3873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472328236
125	NC_020831	A	6	6	3887	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	472328236
126	NC_020831	TTC	3	9	3952	3960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328236
127	NC_020831	CTA	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328236
128	NC_020831	CCAT	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	472328236
129	NC_020831	T	7	7	4123	4129	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
130	NC_020831	TTTA	2	8	4141	4148	25 %	75 %	0 %	0 %	472328236
131	NC_020831	T	8	8	4155	4162	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
132	NC_020831	ATT	2	6	4163	4168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
133	NC_020831	ATT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
134	NC_020831	TAT	3	9	4237	4245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328236
135	NC_020831	CTT	2	6	4254	4259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328236
136	NC_020831	ATA	2	6	4277	4282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328236
137	NC_020831	AT	3	6	4332	4337	50 %	50 %	0 %	0 %	472328236
138	NC_020831	T	9	9	4342	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	472328236
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