MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

< Previous12...29303132333435363738394041Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16503	NC_020512	TTG	2	6	846773	846778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428869
16504	NC_020512	TG	3	6	846806	846811	0 %	50 %	50 %	0 %	478428869
16505	NC_020512	CAG	2	6	846898	846903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428869
16506	NC_020512	GAA	2	6	846974	846979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428869
16507	NC_020512	GA	3	6	846997	847002	50 %	0 %	50 %	0 %	478428869
16508	NC_020512	ATG	2	6	847012	847017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428869
16509	NC_020512	GT	3	6	847035	847040	0 %	50 %	50 %	0 %	478428869
16510	NC_020512	CT	3	6	847070	847075	0 %	50 %	0 %	50 %	478428869
16511	NC_020512	GCA	2	6	847104	847109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428869
16512	NC_020512	ATGCA	2	10	847217	847226	40 %	20 %	20 %	20 %	478428869
16513	NC_020512	TAA	2	6	847307	847312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428869
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16537	NC_020512	ATCA	2	8	848773	848780	50 %	25 %	0 %	25 %	478428871
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16545	NC_020512	CT	3	6	849322	849327	0 %	50 %	0 %	50 %	478428871
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16555	NC_020512	A	6	6	849863	849868	100 %	0 %	0 %	0 %	478428871
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16557	NC_020512	GC	3	6	849894	849899	0 %	0 %	50 %	50 %	478428871
16558	NC_020512	TTG	2	6	849907	849912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428871
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16623	NC_020512	GGA	2	6	853339	853344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428875
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16635	NC_020512	T	10	10	853913	853922	0 %	100 %	0 %	0 %	478428875
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16654	NC_020512	TTCT	2	8	860992	860999	0 %	75 %	0 %	25 %	478428876
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16989	NC_020512	GCT	2	6	884058	884063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428886
16990	NC_020512	CTAC	2	8	884109	884116	25 %	25 %	0 %	50 %	478428886
16991	NC_020512	AGGA	2	8	884182	884189	50 %	0 %	50 %	0 %	478428886
16992	NC_020512	TG	3	6	884209	884214	0 %	50 %	50 %	0 %	478428886
16993	NC_020512	TTG	2	6	884300	884305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428886
16994	NC_020512	GA	3	6	884316	884321	50 %	0 %	50 %	0 %	478428886
16995	NC_020512	AGG	2	6	884351	884356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428886
16996	NC_020512	ATGG	2	8	884442	884449	25 %	25 %	50 %	0 %	478428886
16997	NC_020512	ATA	2	6	884506	884511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428886
16998	NC_020512	ATC	2	6	884576	884581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428887
16999	NC_020512	AG	3	6	884649	884654	50 %	0 %	50 %	0 %	478428887
17000	NC_020512	GCA	2	6	884805	884810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428887

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