MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_020512	CGT	2	6	822090	822095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428846
16003	NC_020512	CAG	2	6	822148	822153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428846
16004	NC_020512	TTG	2	6	822204	822209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428846
16005	NC_020512	GAA	2	6	822300	822305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428846
16006	NC_020512	AAT	2	6	822331	822336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428846
16007	NC_020512	TGC	3	9	822518	822526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428847
16008	NC_020512	T	7	7	822547	822553	0 %	100 %	0 %	0 %	478428847
16009	NC_020512	A	6	6	822571	822576	100 %	0 %	0 %	0 %	478428847
16010	NC_020512	AAC	2	6	822674	822679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428847
16011	NC_020512	TTG	2	6	822709	822714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428847
16012	NC_020512	TTC	2	6	822722	822727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428847
16013	NC_020512	TAA	2	6	822749	822754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428847
16014	NC_020512	TGA	2	6	822797	822802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428847
16015	NC_020512	G	6	6	822825	822830	0 %	0 %	100 %	0 %	478428847
16016	NC_020512	AGA	3	9	822851	822859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428847
16017	NC_020512	CAA	2	6	822912	822917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428847
16018	NC_020512	AAT	2	6	822999	823004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428847
16019	NC_020512	AAAGT	2	10	823021	823030	60 %	20 %	20 %	0 %	478428847
16020	NC_020512	CGATG	2	10	823097	823106	20 %	20 %	40 %	20 %	478428847
16021	NC_020512	CT	3	6	823127	823132	0 %	50 %	0 %	50 %	478428847
16022	NC_020512	GA	3	6	823140	823145	50 %	0 %	50 %	0 %	478428847
16023	NC_020512	AACA	2	8	823225	823232	75 %	0 %	0 %	25 %	478428847
16024	NC_020512	GCTT	2	8	823291	823298	0 %	50 %	25 %	25 %	478428847
16025	NC_020512	TGA	2	6	823346	823351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428847
16026	NC_020512	TCAT	2	8	823393	823400	25 %	50 %	0 %	25 %	478428847
16027	NC_020512	TGA	2	6	823409	823414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428847
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16033	NC_020512	ATA	2	6	823693	823698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428847
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16046	NC_020512	TTA	2	6	824334	824339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428847
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16054	NC_020512	AGC	2	6	824602	824607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428847
16055	NC_020512	CGT	2	6	824617	824622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428847
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16101	NC_020512	GTA	2	6	826573	826578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428849
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16393	NC_020512	GAAG	2	8	841277	841284	50 %	0 %	50 %	0 %	478428864
16394	NC_020512	CTTG	2	8	841375	841382	0 %	50 %	25 %	25 %	478428864
16395	NC_020512	TCT	2	6	841398	841403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428864
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16402	NC_020512	A	6	6	841730	841735	100 %	0 %	0 %	0 %	478428864
16403	NC_020512	CAAT	2	8	841749	841756	50 %	25 %	0 %	25 %	478428864
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16488	NC_020512	TTG	2	6	845827	845832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428868
16489	NC_020512	GGA	2	6	845862	845867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428868
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