MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_020512	CG	3	6	796317	796322	0 %	0 %	50 %	50 %	478428829
15503	NC_020512	TTC	2	6	796355	796360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428829
15504	NC_020512	GAA	2	6	796390	796395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428829
15505	NC_020512	TGC	2	6	796431	796436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428829
15506	NC_020512	ATG	2	6	796457	796462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428829
15507	NC_020512	AGAATT	2	12	796554	796565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478428829
15508	NC_020512	AGG	2	6	796617	796622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428829
15509	NC_020512	CGTG	2	8	796667	796674	0 %	25 %	50 %	25 %	478428829
15510	NC_020512	ATC	2	6	796676	796681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428829
15511	NC_020512	GAA	2	6	796753	796758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428829
15512	NC_020512	A	6	6	796777	796782	100 %	0 %	0 %	0 %	478428829
15513	NC_020512	AAGCTC	2	12	796793	796804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478428829
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15515	NC_020512	AGGA	2	8	796889	796896	50 %	0 %	50 %	0 %	478428829
15516	NC_020512	CCT	2	6	797014	797019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428829
15517	NC_020512	TTC	2	6	797064	797069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428829
15518	NC_020512	GCT	2	6	797101	797106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428829
15519	NC_020512	GTA	2	6	797107	797112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428829
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15521	NC_020512	TCT	2	6	797612	797617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428830
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15524	NC_020512	ACT	3	9	797690	797698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428830
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15528	NC_020512	ACT	2	6	797957	797962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428830
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15530	NC_020512	GCGT	2	8	797987	797994	0 %	25 %	50 %	25 %	478428830
15531	NC_020512	GGGA	2	8	798085	798092	25 %	0 %	75 %	0 %	478428830
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15535	NC_020512	GAG	2	6	798296	798301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428830
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15539	NC_020512	G	6	6	798535	798540	0 %	0 %	100 %	0 %	478428831
15540	NC_020512	TGA	2	6	798588	798593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428831
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15544	NC_020512	GGA	2	6	798735	798740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428831
15545	NC_020512	CGT	2	6	798802	798807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428831
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15553	NC_020512	ATG	2	6	799151	799156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428831
15554	NC_020512	TTG	2	6	799184	799189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428831
15555	NC_020512	ATG	2	6	799190	799195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428831
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15604	NC_020512	CATT	2	8	801725	801732	25 %	50 %	0 %	25 %	478428834
15605	NC_020512	GC	3	6	801805	801810	0 %	0 %	50 %	50 %	478428834
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15609	NC_020512	TAG	2	6	802005	802010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428834
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15613	NC_020512	GGAT	2	8	802251	802258	25 %	25 %	50 %	0 %	478428834
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15622	NC_020512	AGCA	2	8	802671	802678	50 %	0 %	25 %	25 %	478428834
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15624	NC_020512	ACAG	2	8	802768	802775	50 %	0 %	25 %	25 %	478428834
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15984	NC_020512	AAG	2	6	821205	821210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428846
15985	NC_020512	CTT	2	6	821230	821235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428846
15986	NC_020512	CAA	2	6	821247	821252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428846
15987	NC_020512	GGTT	2	8	821253	821260	0 %	50 %	50 %	0 %	478428846
15988	NC_020512	ATT	2	6	821277	821282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428846
15989	NC_020512	GAAG	3	12	821298	821309	50 %	0 %	50 %	0 %	478428846
15990	NC_020512	TGC	2	6	821318	821323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428846
15991	NC_020512	ATG	2	6	821434	821439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428846
15992	NC_020512	T	6	6	821472	821477	0 %	100 %	0 %	0 %	478428846
15993	NC_020512	CTG	2	6	821566	821571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428846
15994	NC_020512	TGG	2	6	821583	821588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428846
15995	NC_020512	TGAT	2	8	821620	821627	25 %	50 %	25 %	0 %	478428846
15996	NC_020512	GCA	2	6	821664	821669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428846
15997	NC_020512	CTT	2	6	821710	821715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428846
15998	NC_020512	AAT	2	6	821730	821735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428846
15999	NC_020512	TGG	2	6	821768	821773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428846
16000	NC_020512	TGA	2	6	821830	821835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428846

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