MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_020512	GCT	2	6	769258	769263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428808
15003	NC_020512	GGAG	2	8	769336	769343	25 %	0 %	75 %	0 %	478428808
15004	NC_020512	AGA	2	6	769444	769449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428808
15005	NC_020512	AGA	3	9	769534	769542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428808
15006	NC_020512	GTT	2	6	769553	769558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428808
15007	NC_020512	T	6	6	769646	769651	0 %	100 %	0 %	0 %	478428808
15008	NC_020512	AGA	2	6	769717	769722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428808
15009	NC_020512	GAA	2	6	769730	769735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428808
15010	NC_020512	AGG	2	6	769744	769749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428808
15011	NC_020512	CAA	2	6	769773	769778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428808
15012	NC_020512	ATT	2	6	769889	769894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428808
15013	NC_020512	CAT	2	6	769924	769929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428808
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15015	NC_020512	TGT	2	6	770226	770231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428809
15016	NC_020512	TTC	2	6	770273	770278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428809
15017	NC_020512	GAA	3	9	770287	770295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428809
15018	NC_020512	GGA	2	6	770340	770345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428809
15019	NC_020512	AT	3	6	770616	770621	50 %	50 %	0 %	0 %	478428809
15020	NC_020512	GAGCA	2	10	770629	770638	40 %	0 %	40 %	20 %	478428809
15021	NC_020512	TTG	2	6	770683	770688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428809
15022	NC_020512	GCA	2	6	770794	770799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428809
15023	NC_020512	AAGA	2	8	770875	770882	75 %	0 %	25 %	0 %	478428809
15024	NC_020512	TGT	2	6	770886	770891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428809
15025	NC_020512	AG	3	6	770918	770923	50 %	0 %	50 %	0 %	478428809
15026	NC_020512	ATA	2	6	771005	771010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428809
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15028	NC_020512	GAG	2	6	771121	771126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428809
15029	NC_020512	GAA	2	6	771199	771204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428809
15030	NC_020512	TTG	2	6	771213	771218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428809
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15032	NC_020512	A	6	6	771282	771287	100 %	0 %	0 %	0 %	478428809
15033	NC_020512	G	7	7	771295	771301	0 %	0 %	100 %	0 %	478428809
15034	NC_020512	GGA	2	6	771336	771341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428809
15035	NC_020512	AC	3	6	771402	771407	50 %	0 %	0 %	50 %	478428809
15036	NC_020512	TATATT	2	12	771428	771439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428809
15037	NC_020512	CTT	2	6	771443	771448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428809
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15039	NC_020512	GTT	2	6	771660	771665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428810
15040	NC_020512	GCG	2	6	771672	771677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428810
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15042	NC_020512	CAG	2	6	771756	771761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428810
15043	NC_020512	GCT	2	6	771765	771770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428810
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15045	NC_020512	AGA	2	6	771987	771992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428810
15046	NC_020512	GCAG	2	8	772031	772038	25 %	0 %	50 %	25 %	478428810
15047	NC_020512	CTG	2	6	772039	772044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428810
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15051	NC_020512	AGA	2	6	772175	772180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428810
15052	NC_020512	GAA	2	6	772229	772234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428810
15053	NC_020512	AAG	3	9	772294	772302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428810
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15055	NC_020512	AAAC	2	8	772325	772332	75 %	0 %	0 %	25 %	478428810
15056	NC_020512	AAG	2	6	772357	772362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428810
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15062	NC_020512	ATG	2	6	772738	772743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428810
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15067	NC_020512	CTG	3	9	773086	773094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428810
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15088	NC_020512	AAT	2	6	774663	774668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428811
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15101	NC_020512	GAA	2	6	775261	775266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428811
15102	NC_020512	AAAG	2	8	775273	775280	75 %	0 %	25 %	0 %	478428811
15103	NC_020512	TGT	2	6	775285	775290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428811
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15105	NC_020512	TGCC	2	8	775400	775407	0 %	25 %	25 %	50 %	478428811
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15110	NC_020512	GGCGT	2	10	775655	775664	0 %	20 %	60 %	20 %	478428811
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15121	NC_020512	GCT	2	6	776806	776811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428813
15122	NC_020512	TCG	2	6	776822	776827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428813
15123	NC_020512	TTC	2	6	776831	776836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428813
15124	NC_020512	TGC	2	6	776900	776905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428813
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15135	NC_020512	CCATT	2	10	777615	777624	20 %	40 %	0 %	40 %	478428814
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15243	NC_020512	T	6	6	783713	783718	0 %	100 %	0 %	0 %	478428818
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15360	NC_020512	AAG	2	6	789076	789081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428822
15361	NC_020512	TA	3	6	789097	789102	50 %	50 %	0 %	0 %	478428822
15362	NC_020512	AGGGA	2	10	789114	789123	40 %	0 %	60 %	0 %	478428822
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15485	NC_020512	GAT	2	6	795422	795427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428828
15486	NC_020512	ATG	2	6	795463	795468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428828
15487	NC_020512	TTC	2	6	795527	795532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428828
15488	NC_020512	GGA	2	6	795561	795566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428828
15489	NC_020512	TGAT	2	8	795607	795614	25 %	50 %	25 %	0 %	478428828
15490	NC_020512	A	7	7	795624	795630	100 %	0 %	0 %	0 %	478428828
15491	NC_020512	TCC	2	6	795699	795704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428828
15492	NC_020512	CTA	2	6	795721	795726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428828
15493	NC_020512	TGT	3	9	795731	795739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428828
15494	NC_020512	TTA	2	6	795823	795828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428828
15495	NC_020512	CTG	2	6	795835	795840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428828
15496	NC_020512	GCG	2	6	795843	795848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428828
15497	NC_020512	T	8	8	795861	795868	0 %	100 %	0 %	0 %	478428828
15498	NC_020512	GC	3	6	795875	795880	0 %	0 %	50 %	50 %	478428828
15499	NC_020512	GAT	2	6	796117	796122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428829
15500	NC_020512	GCA	2	6	796174	796179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428829

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