MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020512	A	6	6	642952	642957	100 %	0 %	0 %	0 %	478428708
12503	NC_020512	CAT	2	6	643008	643013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428708
12504	NC_020512	GGA	2	6	643036	643041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428709
12505	NC_020512	TTC	2	6	643042	643047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12506	NC_020512	TTTC	2	8	643067	643074	0 %	75 %	0 %	25 %	478428709
12507	NC_020512	AGC	2	6	643087	643092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428709
12508	NC_020512	CTG	2	6	643093	643098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428709
12509	NC_020512	CTA	2	6	643104	643109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428709
12510	NC_020512	ATC	2	6	643123	643128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428709
12511	NC_020512	AGC	2	6	643144	643149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428709
12512	NC_020512	TCT	2	6	643172	643177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12513	NC_020512	ATAAAC	2	12	643211	643222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478428709
12514	NC_020512	AAT	2	6	643259	643264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428709
12515	NC_020512	C	6	6	643336	643341	0 %	0 %	0 %	100 %	478428709
12516	NC_020512	AAT	2	6	643342	643347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428709
12517	NC_020512	TAA	2	6	643461	643466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428709
12518	NC_020512	TAA	2	6	643494	643499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428709
12519	NC_020512	GAA	2	6	643503	643508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428709
12520	NC_020512	AGA	2	6	643561	643566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428709
12521	NC_020512	TTC	2	6	643582	643587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12522	NC_020512	ACG	2	6	643625	643630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428709
12523	NC_020512	TTTC	2	8	643838	643845	0 %	75 %	0 %	25 %	478428709
12524	NC_020512	T	7	7	643872	643878	0 %	100 %	0 %	0 %	478428709
12525	NC_020512	CAA	2	6	643897	643902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428709
12526	NC_020512	ATCTTG	2	12	643904	643915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478428709
12527	NC_020512	CTT	2	6	643923	643928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12528	NC_020512	CTT	2	6	643995	644000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12529	NC_020512	ACT	2	6	644089	644094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428709
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12531	NC_020512	CT	3	6	644210	644215	0 %	50 %	0 %	50 %	478428709
12532	NC_020512	AGCG	2	8	644285	644292	25 %	0 %	50 %	25 %	478428709
12533	NC_020512	AGA	2	6	644332	644337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428709
12534	NC_020512	TCT	2	6	644339	644344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12535	NC_020512	TCT	2	6	644360	644365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
12536	NC_020512	GCT	2	6	644372	644377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428709
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12539	NC_020512	AGA	2	6	644605	644610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428709
12540	NC_020512	CTA	2	6	644696	644701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428709
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12544	NC_020512	GTT	2	6	644997	645002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428709
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12546	NC_020512	GA	3	6	645067	645072	50 %	0 %	50 %	0 %	478428709
12547	NC_020512	CTT	2	6	645078	645083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428709
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12550	NC_020512	TCC	2	6	645286	645291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428710
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12552	NC_020512	TCT	2	6	645497	645502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428710
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12555	NC_020512	CTG	2	6	645588	645593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428710
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12581	NC_020512	ATGA	2	8	646855	646862	50 %	25 %	25 %	0 %	478428711
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12588	NC_020512	TTC	2	6	647311	647316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428711
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12591	NC_020512	ACAA	2	8	647549	647556	75 %	0 %	0 %	25 %	478428711
12592	NC_020512	TCA	2	6	647564	647569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428711
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12594	NC_020512	GC	3	6	647657	647662	0 %	0 %	50 %	50 %	478428711
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12597	NC_020512	CAAGC	2	10	647803	647812	40 %	0 %	20 %	40 %	478428712
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12605	NC_020512	ACA	2	6	648177	648182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428712
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12612	NC_020512	CAC	2	6	648555	648560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428712
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12722	NC_020512	A	6	6	653873	653878	100 %	0 %	0 %	0 %	478428717
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12984	NC_020512	TGA	2	6	667827	667832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428726
12985	NC_020512	AAC	2	6	667833	667838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428726
12986	NC_020512	TTC	2	6	667887	667892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428726
12987	NC_020512	TCC	2	6	667926	667931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428726
12988	NC_020512	AAC	3	9	667976	667984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428726
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