MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020512	TTA	2	6	619416	619421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428684
12003	NC_020512	CCT	2	6	619451	619456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428684
12004	NC_020512	CT	3	6	619489	619494	0 %	50 %	0 %	50 %	478428684
12005	NC_020512	TCT	2	6	619568	619573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428685
12006	NC_020512	TAC	2	6	619577	619582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428685
12007	NC_020512	C	6	6	619610	619615	0 %	0 %	0 %	100 %	478428685
12008	NC_020512	AGAAA	2	10	619623	619632	80 %	0 %	20 %	0 %	478428685
12009	NC_020512	CT	3	6	619698	619703	0 %	50 %	0 %	50 %	478428685
12010	NC_020512	CTC	2	6	619729	619734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428685
12011	NC_020512	TC	3	6	619775	619780	0 %	50 %	0 %	50 %	478428685
12012	NC_020512	TGA	2	6	619794	619799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428685
12013	NC_020512	TGA	2	6	619833	619838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428685
12014	NC_020512	CA	3	6	619917	619922	50 %	0 %	0 %	50 %	478428685
12015	NC_020512	TCA	2	6	619998	620003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428685
12016	NC_020512	TATAT	2	10	620058	620067	40 %	60 %	0 %	0 %	478428685
12017	NC_020512	ACA	2	6	620091	620096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428685
12018	NC_020512	ACTGTA	2	12	620193	620204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478428686
12019	NC_020512	A	6	6	620210	620215	100 %	0 %	0 %	0 %	478428686
12020	NC_020512	GCTT	2	8	620230	620237	0 %	50 %	25 %	25 %	478428686
12021	NC_020512	GAA	2	6	620240	620245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428686
12022	NC_020512	CTTC	2	8	620282	620289	0 %	50 %	0 %	50 %	478428686
12023	NC_020512	GGAT	2	8	620294	620301	25 %	25 %	50 %	0 %	478428686
12024	NC_020512	CAT	2	6	620392	620397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428686
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12029	NC_020512	CACTCT	2	12	620509	620520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478428686
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12034	NC_020512	ACCA	2	8	620760	620767	50 %	0 %	0 %	50 %	478428687
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12036	NC_020512	TAAA	2	8	620785	620792	75 %	25 %	0 %	0 %	478428687
12037	NC_020512	AT	3	6	620893	620898	50 %	50 %	0 %	0 %	478428687
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12041	NC_020512	T	6	6	621093	621098	0 %	100 %	0 %	0 %	478428688
12042	NC_020512	TTG	2	6	621100	621105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428688
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12044	NC_020512	GAAA	2	8	621228	621235	75 %	0 %	25 %	0 %	478428688
12045	NC_020512	A	7	7	621233	621239	100 %	0 %	0 %	0 %	478428688
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12051	NC_020512	TTA	2	6	621488	621493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428688
12052	NC_020512	ATG	2	6	621503	621508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428688
12053	NC_020512	CTG	2	6	621531	621536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428688
12054	NC_020512	CAT	2	6	621628	621633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428688
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12101	NC_020512	CTTCT	2	10	623785	623794	0 %	60 %	0 %	40 %	478428690
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12107	NC_020512	TCG	2	6	624010	624015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428690
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12362	NC_020512	AGCC	2	8	636567	636574	25 %	0 %	25 %	50 %	478428701
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12486	NC_020512	TCT	2	6	642151	642156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428708
12487	NC_020512	TA	3	6	642203	642208	50 %	50 %	0 %	0 %	478428708
12488	NC_020512	GTC	2	6	642214	642219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428708
12489	NC_020512	AGG	2	6	642284	642289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428708
12490	NC_020512	AGG	2	6	642300	642305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428708
12491	NC_020512	ATGA	2	8	642375	642382	50 %	25 %	25 %	0 %	478428708
12492	NC_020512	TCC	2	6	642417	642422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428708
12493	NC_020512	TAA	2	6	642500	642505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428708
12494	NC_020512	GCTC	2	8	642613	642620	0 %	25 %	25 %	50 %	478428708
12495	NC_020512	AAG	2	6	642687	642692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428708
12496	NC_020512	TA	3	6	642776	642781	50 %	50 %	0 %	0 %	478428708
12497	NC_020512	AAT	2	6	642798	642803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428708
12498	NC_020512	CTT	2	6	642809	642814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428708
12499	NC_020512	T	7	7	642881	642887	0 %	100 %	0 %	0 %	478428708
12500	NC_020512	GCA	2	6	642932	642937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428708

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