MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020512	TCA	2	6	568811	568816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428627
11003	NC_020512	TTTC	2	8	568974	568981	0 %	75 %	0 %	25 %	478428627
11004	NC_020512	TCT	2	6	568982	568987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428627
11005	NC_020512	CAA	2	6	568992	568997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428627
11006	NC_020512	CTT	2	6	569013	569018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428627
11007	NC_020512	CT	3	6	569084	569089	0 %	50 %	0 %	50 %	478428627
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11009	NC_020512	TTC	2	6	569145	569150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428628
11010	NC_020512	ATT	2	6	569160	569165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428628
11011	NC_020512	T	6	6	569192	569197	0 %	100 %	0 %	0 %	478428628
11012	NC_020512	AGA	2	6	569205	569210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428628
11013	NC_020512	T	7	7	569255	569261	0 %	100 %	0 %	0 %	478428628
11014	NC_020512	ACA	2	6	569342	569347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428628
11015	NC_020512	CAA	2	6	569411	569416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428628
11016	NC_020512	AC	3	6	569421	569426	50 %	0 %	0 %	50 %	478428628
11017	NC_020512	TCT	2	6	569443	569448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428628
11018	NC_020512	CTA	2	6	569500	569505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428628
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11020	NC_020512	ACAG	2	8	569745	569752	50 %	0 %	25 %	25 %	478428629
11021	NC_020512	TTC	2	6	569804	569809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428629
11022	NC_020512	ATA	2	6	569824	569829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428629
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11024	NC_020512	TTAA	2	8	569910	569917	50 %	50 %	0 %	0 %	478428629
11025	NC_020512	GCA	2	6	569922	569927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428629
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11027	NC_020512	TAA	2	6	570070	570075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428629
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11029	NC_020512	CTG	2	6	570170	570175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428629
11030	NC_020512	GCT	3	9	570217	570225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428629
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11032	NC_020512	AAT	2	6	570358	570363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428629
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11036	NC_020512	ACA	2	6	570568	570573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428629
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11040	NC_020512	TCT	2	6	570912	570917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428629
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11043	NC_020512	A	7	7	571036	571042	100 %	0 %	0 %	0 %	478428629
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11054	NC_020512	TGC	2	6	571479	571484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428629
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11059	NC_020512	GAA	2	6	571749	571754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428629
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11063	NC_020512	CAT	2	6	571960	571965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428629
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11065	NC_020512	TTA	2	6	572109	572114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428629
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11101	NC_020512	CAA	2	6	573622	573627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428631
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11105	NC_020512	GCC	2	6	573740	573745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478428631
11106	NC_020512	TTC	2	6	573755	573760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428631
11107	NC_020512	TCA	2	6	573761	573766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428631
11108	NC_020512	CCT	2	6	573848	573853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428631
11109	NC_020512	GA	3	6	573876	573881	50 %	0 %	50 %	0 %	478428631
11110	NC_020512	ATAG	2	8	573925	573932	50 %	25 %	25 %	0 %	478428631
11111	NC_020512	CAG	2	6	574020	574025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428631
11112	NC_020512	CGT	2	6	574063	574068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428631
11113	NC_020512	AG	3	6	574168	574173	50 %	0 %	50 %	0 %	478428631
11114	NC_020512	ACG	3	9	574175	574183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428631
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11117	NC_020512	TTTTGC	2	12	574231	574242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478428631
11118	NC_020512	TCTT	2	8	574259	574266	0 %	75 %	0 %	25 %	478428631
11119	NC_020512	CGAC	2	8	574275	574282	25 %	0 %	25 %	50 %	478428631
11120	NC_020512	CTG	2	6	574287	574292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428631
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11233	NC_020512	TGGAGA	2	12	579597	579608	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478428635
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11237	NC_020512	GCTTA	2	10	579715	579724	20 %	40 %	20 %	20 %	478428635
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11240	NC_020512	TCTG	2	8	579934	579941	0 %	50 %	25 %	25 %	478428636
11241	NC_020512	AGA	2	6	580022	580027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428636
11242	NC_020512	TAT	2	6	580037	580042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428636
11243	NC_020512	GCG	2	6	580054	580059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428636
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11245	NC_020512	CTCCAT	2	12	580120	580131	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478428636
11246	NC_020512	T	6	6	580217	580222	0 %	100 %	0 %	0 %	478428636
11247	NC_020512	A	7	7	580227	580233	100 %	0 %	0 %	0 %	478428636
11248	NC_020512	TCA	2	6	580274	580279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428636
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11250	NC_020512	CTT	2	6	580348	580353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428636
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11351	NC_020512	CATC	2	8	584957	584964	25 %	25 %	0 %	50 %	478428642
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11360	NC_020512	T	7	7	585593	585599	0 %	100 %	0 %	0 %	478428643
11361	NC_020512	T	6	6	585651	585656	0 %	100 %	0 %	0 %	478428644
11362	NC_020512	T	6	6	585672	585677	0 %	100 %	0 %	0 %	478428644
11363	NC_020512	ATTTC	2	10	585732	585741	20 %	60 %	0 %	20 %	478428644
11364	NC_020512	AG	3	6	585765	585770	50 %	0 %	50 %	0 %	478428644
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11471	NC_020512	CATA	2	8	591597	591604	50 %	25 %	0 %	25 %	478428653
11472	NC_020512	TTA	2	6	591780	591785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428653
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11474	NC_020512	TCTT	2	8	591846	591853	0 %	75 %	0 %	25 %	478428653
11475	NC_020512	TA	3	6	591864	591869	50 %	50 %	0 %	0 %	478428653
11476	NC_020512	T	7	7	591871	591877	0 %	100 %	0 %	0 %	478428653
11477	NC_020512	TC	5	10	591899	591908	0 %	50 %	0 %	50 %	478428654
11478	NC_020512	GAA	2	6	591924	591929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428654
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11480	NC_020512	GAG	2	6	592036	592041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428654
11481	NC_020512	T	6	6	592092	592097	0 %	100 %	0 %	0 %	478428654
11482	NC_020512	AAC	2	6	592138	592143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428654
11483	NC_020512	AGCA	2	8	592178	592185	50 %	0 %	25 %	25 %	478428654
11484	NC_020512	ATC	2	6	592340	592345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428655
11485	NC_020512	GAT	2	6	592346	592351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428655
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11487	NC_020512	CTT	2	6	592445	592450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428655
11488	NC_020512	ATCAC	2	10	592491	592500	40 %	20 %	0 %	40 %	478428655
11489	NC_020512	CGA	2	6	592518	592523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428655
11490	NC_020512	TAT	2	6	592567	592572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428655
11491	NC_020512	ACT	2	6	592619	592624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428656
11492	NC_020512	CTT	2	6	592700	592705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428656
11493	NC_020512	ATA	2	6	592728	592733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428656
11494	NC_020512	ACC	2	6	592750	592755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428656
11495	NC_020512	AAC	3	9	592794	592802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428656
11496	NC_020512	T	6	6	592805	592810	0 %	100 %	0 %	0 %	478428656
11497	NC_020512	TGA	2	6	592818	592823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428656
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11499	NC_020512	T	7	7	592886	592892	0 %	100 %	0 %	0 %	478428657
11500	NC_020512	TGA	2	6	592943	592948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428657

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